论文目录 | |
| 摘要 | 第10-13
页 |
| ABSTRACT | 第13-17
页 |
| 前言 | 第17-19
页 |
| 第一章 人群遗传结构的研究范畴和现状 | 第19-41
页 |
| · 本文涉及的遗传结构研究范畴 | 第19-23
页 |
| · 人类学揭示的现代人群结构 | 第23-26
页 |
| · 语言学研究揭示的现代人群结构 | 第26-29
页 |
| · 世界语系划分 | 第26-28
页 |
| · 我国人群的语系归属 | 第28-29
页 |
| · 世界范围人群遗传结构的研究结果 | 第29-31
页 |
| · 线粒体DNA和Y-DNA的研究 | 第29-30
页 |
| · 常染色体的研究成果 | 第30-31
页 |
| · 我国人群遗传结构研究的一些成果 | 第31-35
页 |
| · 单核苷酸多态性在研究人群遗传结构中的前景 | 第35-37
页 |
| · 参考文献 | 第37-41
页 |
| 第二章 常染色体SNPS揭示的人群亚结构 | 第41-99
页 |
| · 群体和样本 | 第44
页 |
| · 数据和位点信息 | 第44-51
页 |
| · 数据Ⅰ(Chromosome 21 SNP Project) | 第45-48
页 |
| · 数据Ⅱ(Pan Asian SNP Project) | 第48-51
页 |
| · 方法和统计量 | 第51-58
页 |
| · 个体聚类 | 第51
页 |
| · 群体聚类 | 第51-54
页 |
| · F~*_(ST)距离的估计 | 第52
页 |
| · Nei的标准遗传距离 | 第52-53
页 |
| · Cavalli-Sforza的d_c遗传距离 | 第53
页 |
| · Nei的D_A遗传距离 | 第53-54
页 |
| · 多维尺度(MDS)分析 | 第54-55
页 |
| · 群体的杂合度与Wright's F_(ST) | 第55-56
页 |
| · 群体的AMOVA分析 | 第56-57
页 |
| · 群体的STRUCTURE分析 | 第57-58
页 |
| · 结果 | 第58-87
页 |
| · 个体聚类结果 | 第58-64
页 |
| · 621个个体的聚类结果 | 第58-60
页 |
| · 510个个体的聚类结果 | 第60-61
页 |
| · 中国5个人群样本的个体聚类树 | 第61-63
页 |
| · 泛亚15个人群样本的个体聚类树 | 第63-64
页 |
| · 群体聚类结果 | 第64-73
页 |
| · 30个人群样本的群体聚类结果 | 第64-66
页 |
| · 30个群体MDS分析结果 | 第66-68
页 |
| · 泛亚15个群体聚类分析结果 | 第68-70
页 |
| · 40个群体聚类分析结果 | 第70-72
页 |
| · 40个群体MDS分析结果 | 第72-73
页 |
| · AMOVA分析结果 | 第73-77
页 |
| · 三个大洲人群的AMOVA分析 | 第73-75
页 |
| · 东南亚六大语系人群的AMOVA分析 | 第75
页 |
| · 汉藏语系人群AMOVA分析 | 第75-76
页 |
| 2.4.3.4.汉族和壮族,苗族的AMOVA分析 | 第76-77
页 |
| · STRUCURE分析结果 | 第77-87
页 |
| 2.4.4.1.泛亚15个群体的STRUCTURE分析 | 第77-83
页 |
| 2.4.4.2.22个群体的STRUCTURE分析 | 第83-87
页 |
| · 结论 | 第87-88
页 |
| · 讨论 | 第88-96
页 |
| · 参考文献 | 第96-99
页 |
| 第三章 从基因型到单倍型 | 第99-114
页 |
| · 群体和样本 | 第100
页 |
| · 数据信息 | 第100-102
页 |
| · 连锁不平衡原理 | 第102
页 |
| · 连锁不平衡的统计量及其性质 | 第102-105
页 |
| · 影响连锁不平衡的因素 | 第105-108
页 |
| · 在个体水平重建整条染色体的单倍型 | 第108-110
页 |
| · 参考文献 | 第110-114
页 |
| 第四章 人群的连锁不平衡结构 | 第114-132
页 |
| · 群体和样本 | 第115
页 |
| · 数据和位点信息 | 第115-116
页 |
| · 方法和统计量 | 第116
页 |
| · 结果 | 第116-128
页 |
| · 考虑所有位点的结果 | 第116-122
页 |
| · 只考虑MAF≥0.10的位点的结果 | 第122-128
页 |
| · 结论 | 第128-129
页 |
| · 讨论 | 第129-130
页 |
| · 参考文献 | 第130-132
页 |
| 第五章 混合人群的遗传结构<一> | 第132-185
页 |
| · 群体和样本 | 第135
页 |
| · 数据和位点信息 | 第135-136
页 |
| · 数据Ⅰ(Chromosome 21 SNP Project) | 第135-136
页 |
| · 数据Ⅱ(Perlegen Data) | 第136
页 |
| · 方法和统计量 | 第136-144
页 |
| · F_(ST)的估计 | 第136-137
页 |
| · 位点的祖先信息含量 | 第137-139
页 |
| · 挑选富含祖先信息的位点 | 第139-143
页 |
| · 从数据Ⅰ得到的AIMs | 第139-141
页 |
| · 从数据Ⅱ得到的AIMs | 第141-143
页 |
| · 单倍型推断 | 第143
页 |
| · STRUCTURE分析 | 第143
页 |
| · 组内相关系数 | 第143-144
页 |
| · 结果 | 第144-173
页 |
| · 美国黑人及其双亲群体的等位基因频率分布 | 第144-145
页 |
| · 美国黑人及其双亲群体的位点杂合度分布 | 第145-146
页 |
| · 美国黑人及其双亲群体的F_(ST)分布 | 第146
页 |
| · 基于基因型数据的个体聚类 | 第146-149
页 |
| · 基于单倍型数据的STRUCTURE分析 | 第149-161
页 |
| · 个体的混合比例 | 第150-151
页 |
| · 数据Ⅰ的结果 | 第150
页 |
| · 数据Ⅱ的结果 | 第150-151
页 |
| · 群体的混合比例 | 第151-153
页 |
| · 数据Ⅰ的结果 | 第151-152
页 |
| · 数据Ⅱ的结果 | 第152-153
页 |
| · 推断染色体区段的祖先来源 | 第153-161
页 |
| · 数据Ⅰ的结果 | 第153-158
页 |
| · 数据Ⅱ的结果 | 第158-161
页 |
| · 美国黑人及其双亲群体的连锁不平衡分析 | 第161-173
页 |
| · 整体分析 | 第161-163
页 |
| · 美国黑人的LD与位点信息含量的关系 | 第163-166
页 |
| · AIMs揭示的美国黑人LD的强度和延伸程度 | 第166-168
页 |
| · 美国黑人个体的混合程度对LD的影响 | 第168-170
页 |
| · Mixture LD & Admixture LD | 第170-173
页 |
| · 结论 | 第173-174
页 |
| · 讨论 | 第174-180
页 |
| · 参考文献 | 第180-185
页 |
| 第六章 混合人群的遗传结构<二> | 第185-234
页 |
| · 群体和样本 | 第187
页 |
| · 数据和位点信息 | 第187-188
页 |
| · 数据Ⅰ(PanAsian Data) | 第187-188
页 |
| · 数据Ⅱ(Chromosome 21 SNP Project) | 第188
页 |
| · 方法和统计量 | 第188-189
页 |
| · 结果 | 第189-226
页 |
| · 848个个体的个体聚类结果 | 第189-191
页 |
| · 18个群体的聚类结果 | 第191-192
页 |
| · 18个群体的STRUCURE分析结果 | 第192-199
页 |
| · 群体的等位基因频率分布 | 第199
页 |
| · 维吾尔族及其双亲群体的位点杂合度分布 | 第199-200
页 |
| · 群体的F_(ST)分布 | 第200-201
页 |
| · 挑选祖先信息位点(AIMs) | 第201-204
页 |
| · 从21号染色体得到的AIMs | 第201-203
页 |
| · 从PanAsian数据得到的AIMs | 第203-204
页 |
| · 和用AIMs进行个体聚类 | 第204-206
页 |
| · 21号染色体AIMs | 第204-205
页 |
| · PanAsian数据中的AIMs | 第205-206
页 |
| · 基于单倍型数据的STRUCTURE分析 | 第206-213
页 |
| · 个体与群体的混合比例 | 第206-209
页 |
| · 从21号染色体数据获得的结果 | 第206-207
页 |
| · 从PanAsian数据获得的结果 | 第207-209
页 |
| · 推断染色体区段的祖先来源 | 第209-211
页 |
| · 从21号染色体数据获得的结果 | 第209-211
页 |
| · 从PanAsian数据获得的结果 | 第211
页 |
| · 根据重组率估算的混合时间 | 第211-213
页 |
| · 维吾尔族及其双亲群体的连锁不平衡分析 | 第213-226
页 |
| · 连锁不平衡散点分布图 | 第213-215
页 |
| · 不同频率位点的连锁不平衡表现 | 第215-223
页 |
| · MAF≥0的情况 | 第215-217
页 |
| · MAF≥0.05的情况 | 第217-220
页 |
| · MAF≥0.15的情况 | 第220-223
页 |
| · AIMs揭示的维吾尔族LD的强度和延伸程度 | 第223-226
页 |
| · 结论 | 第226-227
页 |
| · 讨论 | 第227-233
页 |
| · 参考文献 | 第233-234
页 |
| 第七章 隔离人群的遗传结构 | 第234-265
页 |
| · 群体和样本 | 第235-236
页 |
| · 数据和位点信息 | 第236-238
页 |
| · SNP数据和位点信息 | 第236-237
页 |
| · STR数据和位点信息 | 第237-238
页 |
| · 方法和统计量 | 第238
页 |
| · 单倍型推断 | 第238
页 |
| · 结果 | 第238-258
页 |
| · 等位基因频率在人群中的分布 | 第238-239
页 |
| · 位点平均杂合度在人群中的分布 | 第239-240
页 |
| · 基于基因型数据的群体聚类 | 第240-242
页 |
| · STRUCTURE分析 | 第242-248
页 |
| · SNP数据分析结果 | 第242-246
页 |
| · STR数据分析结果 | 第246-248
页 |
| · Samoan的连锁不平衡分析 | 第248-258
页 |
| · 连锁不平衡散点分布图 | 第248-250
页 |
| · 不同频率位点的连锁不平衡表现 | 第250-258
页 |
| · MAF≥0的情况 | 第250-253
页 |
| · MAF≥0.05的情况 | 第253-255
页 |
| · MAF≥0.15的情况 | 第255-258
页 |
| · 结论 | 第258-259
页 |
| · 讨论 | 第259-261
页 |
| · 参考文献 | 第261-265
页 |
| 后记 | 第265-267
页 |
| 致谢 | 第267-269
页 |
| 拟公开发表论文 | 第269-271
页 |
