北戴河滨海湿地细菌多样性及其芦苇碱蓬根系群体感应细菌研究



北戴河滨海湿地细菌多样性及其芦苇碱蓬根系群体感应细菌研究

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北戴河滨海湿地细菌多样性及其芦苇碱蓬根系群体感应细菌研究

论文目录
摘要	第1-6页
Abstract	第6-7页
第一章滨海湿地与湿地微生物	第11-19页
1.1 滨海湿地生态系统简介	第11-13页
1.1.1 滨海湿地的重要功能	第11页
1.1.2 中国滨海湿地介绍	第11-12页
1.1.3 北戴河湿地的研究背景	第12-13页
1.2 滨海湿地现况	第13-16页
1.2.1 滨海湿地的退化	第13-14页
1.2.2 滨海湿地的修复	第14-15页
1.2.3 湿地修复的挑战	第15页
1.2.4 微生物在滨海湿地的重要生态学功能	第15-16页
1.3 滨海湿地中的群体感应细菌	第16-17页
1.3.1 群体感应细菌介绍	第16-17页
1.3.2 群体感应细菌在湿地中的生态学意义	第17页
1.4 本次研究的意义	第17-19页
第二章北戴河退化区微生物群落结构和多样性变化	第19-29页
2.1 材料和方法	第19-21页
2.1.1 样品采集	第19页
2.1.2 细菌基因组DNA提取和质检	第19-20页
2.1.3 高通量测序	第20页
2.1.4 数据分析	第20页
2.1.5 环境参数检测	第20-21页
2.2 结果	第21-26页
2.2.1 滨海湿地的理化性质	第21页
2.2.2 微生物多样性和分布特征	第21-23页
2.2.3 环境因子对微生物影响	第23-24页
2.2.4 网络分析结果	第24-26页
2.3 讨论	第26-28页
2.3.1 湿地微生物多样性	第26-27页
2.3.2 湿地微生物和环境因子的关系	第27页
2.3.3 湿地微生物的分布和共现关系	第27-28页
2.4 小结	第28-29页
第三章退化湿地修复过程中细菌多样性的时空变化	第29-43页
3.1 材料和方法	第29-31页
3.1.1 样品采集	第29页
3.1.2 样品基因组提取和纯化鉴定	第29-30页
3.1.3 高通量测序	第30页
3.1.4 生物信息学分析	第30-31页
3.1.5 数据分析	第31页
3.1.6 环境因子测定	第31页
3.2 结果	第31-39页
3.2.1 不同修复时期微生物多样性和土壤理化性质	第31-32页
3.2.2 土壤微生物在不同修复时期的丰富度和关系探究	第32-34页
3.2.3 门水平分类	第34-36页
3.2.4 属水平优势菌群分类	第36-38页
3.2.5 土壤微生物群落和环境因子间的关系	第38-39页
3.3 讨论	第39-42页
3.3.1 不同修复时期土壤微生物多样性	第39-40页
3.3.2 土壤微生物的群落结构	第40-41页
3.3.3 环境因子和土壤微生物间的关系	第41-42页
3.4 小结	第42-43页
第四章北戴河滨海湿地根系群体感应细菌多样性及其功能研究	第43-67页
4.1 实验方法	第43-48页
4.1.1 材料、仪器、试剂	第43页
4.1.2 常用的溶液及培养基	第43-44页
4.1.3 滨海湿地根际样品采集	第44页
4.1.4 样品高通量测序和数据分析	第44-45页
4.1.5 湿地植物根区域微生物的筛选	第45-46页
4.1.6 群体感应细菌的初步筛选	第46页
4.1.7 16 S rRNA的鉴定和进化树分析	第46页
4.1.8 AHL的萃取和生物自显影分析	第46-47页
4.1.9 生物自显影分析	第47页
4.1.10 AHL信号分子的GC-MS分析	第47页
4.1.11 QS细菌功能验证	第47-48页
4.2 结果	第48-61页
4.2.1 芦苇碱蓬根系环境中细菌的多样性和分布	第48-53页
4.2.2 QS细菌的筛选	第53页
4.2.3 QS细菌16S rRNA的鉴定	第53-57页
4.2.4 AHL信号分子种类分析	第57-59页
4.2.5 QS细菌的功能研究	第59-61页
4.3 讨论	第61-65页
4.3.1 细菌群落结构和多样性简述	第61-62页
4.3.2 根系环境中QS细菌的分布	第62-64页
4.3.3 AHL产物分析	第64页
4.3.4 QS细菌的功能和生态学意义	第61-65页
4.4 小结	第65-67页
第五章总结与展望	第67-69页
5.1 总结	第67-68页
5.2 展望	第68-69页
参考文献	第69-85页
硕士期间的学术成果	第85-86页
致谢	第86页

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