论文目录 | |
| 摘要 | 第1-8
页 |
| Abstract | 第8-19
页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-42
页 |
| · 蛋白质吸附的应用 | 第19-22
页 |
| · 生物学过程中的蛋白质吸附现象 | 第19
页 |
| · 生物技术应用中的蛋白质吸附现象 | 第19-22
页 |
| · 生物医学植入物 | 第19-20
页 |
| · 药物控释 | 第20
页 |
| · 蛋白质/酶的固定化 | 第20
页 |
| · 隐形眼镜 | 第20-21
页 |
| · 海洋生物防污 | 第21
页 |
| · 蛋白质分离 | 第21-22
页 |
| · 蛋白质吸附的研究方法 | 第22-24
页 |
| · 实验研究方法 | 第22-23
页 |
| · 理论研究方法 | 第23
页 |
| · 计算机模拟研究方法 | 第23-24
页 |
| · 实验方法的局限 | 第23-24
页 |
| · 理论方法的局限 | 第24
页 |
| · 计算机分子模拟的优势 | 第24
页 |
| · 分子模拟蛋白质吸附的模型和算法 | 第24-30
页 |
| · 结构模型 | 第24-28
页 |
| · 水模型 | 第25-26
页 |
| · 表面模型 | 第26
页 |
| · 蛋白质模型 | 第26-28
页 |
| · 力场模型 | 第28-30
页 |
| · 全原子力场 | 第28
页 |
| · 粗粒化力场 | 第28
页 |
| · 力场的验证 | 第28-29
页 |
| · 极化力场 | 第29-30
页 |
| · 算法 | 第30
页 |
| · 分子模拟蛋白质吸附的研究现状 | 第30-39
页 |
| · 蛋白质的可控吸附 | 第30-38
页 |
| · 吸附量 | 第30-31
页 |
| · 吸附取向 | 第31-35
页 |
| · 吸附构象 | 第35-38
页 |
| · 阻抗蛋白质吸附 | 第38-39
页 |
| · 本论文的研究内容和创新之处 | 第39-42
页 |
| · 研究内容 | 第40-41
页 |
| · 特色与创新之处 | 第41-42
页 |
| 第二章 并行退火Monte Carlo 模拟溶菌酶在带电表面的吸附取向 | 第42-60
页 |
| · 引言 | 第42-44
页 |
| · 模拟方法 | 第44-47
页 |
| · 结构和力场模型 | 第44-46
页 |
| · 结构模型 | 第44
页 |
| · 力场模型 | 第44-46
页 |
| · 模拟细节 | 第46-47
页 |
| · 并行退火模拟细节 | 第46
页 |
| · 蒙特卡罗模拟细节 | 第46
页 |
| · 副本个数和温度分布 | 第46-47
页 |
| · 结果与讨论 | 第47-59
页 |
| · PTMC 模拟性能测试 | 第48-53
页 |
| · 准确性 | 第48-49
页 |
| · 重复性 | 第49-53
页 |
| · 溶菌酶在负电表面的吸附 | 第53-56
页 |
| · 溶菌酶在正电表面的吸附 | 第56-59
页 |
| · 本章小结 | 第59-60
页 |
| 第三章 副本交换Monte Carlo 模拟葡萄糖氧化酶在带电表面的吸附取向 | 第60-75
页 |
| · 引言 | 第60-61
页 |
| · 模拟方法 | 第61-63
页 |
| · 结构和力场模型 | 第61-62
页 |
| · 结构模型 | 第61-62
页 |
| · 力场模型 | 第62
页 |
| · 模拟细节 | 第62-63
页 |
| · 蒙特卡罗模拟细节 | 第62
页 |
| · 副本交换模拟细节 | 第62-63
页 |
| · 结果与讨论 | 第63-73
页 |
| · Hamiltonian REMC 性能测试 | 第64
页 |
| · Hamiltonian REMC 模拟GOx 在正电表面的吸附取向 | 第64-68
页 |
| · Hamiltonian REMC 模拟GOx 在负电表面的吸附取向 | 第68-70
页 |
| · GOx 在表面吸附取向的分析 | 第70-73
页 |
| · GOx 的分子结构 | 第70-71
页 |
| · 模拟结果分析 | 第71-73
页 |
| · 本章小结 | 第73-75
页 |
| 第四章 分子动力学模拟外加电场对溶菌酶在带电表面吸附行为的影响 | 第75-94
页 |
| · 引言 | 第75-77
页 |
| · 模拟方法 | 第77-78
页 |
| · 模拟模型 | 第77
页 |
| · 模拟细节 | 第77-78
页 |
| · 结果与讨论 | 第78-92
页 |
| · 蛋白质－表面距离 | 第78-80
页 |
| · 反号离子与蛋白质的共吸附 | 第80-83
页 |
| · 蛋白质吸附取向及吸附位点 | 第83-88
页 |
| · 蛋白质构象变化 | 第88-91
页 |
| · 溶菌酶分子RMSD 值 | 第89-90
页 |
| · 溶菌酶分子的偶极矩 | 第90-91
页 |
| · 表面性质 | 第91-92
页 |
| · 本章小结 | 第92-94
页 |
| 第五章 分子动力学模拟神经介肽-B 与自组装单分子膜表面的相互作用 | 第94-106
页 |
| · 引言 | 第94-95
页 |
| · 模拟方法 | 第95-96
页 |
| · 模拟模型 | 第95
页 |
| · 模拟细节 | 第95-96
页 |
| · 结果与讨论 | 第96-104
页 |
| · 多肽-表面距离 | 第96-97
页 |
| · 力－距离曲线 | 第97-99
页 |
| · 表面力曲线 | 第97-99
页 |
| · 水分子力曲线 | 第99
页 |
| · 多肽结构 | 第99-100
页 |
| · 水结构和动力学 | 第100-103
页 |
| · 水分子的径向分布函数 | 第101-102
页 |
| · 表面和水分子之间的氢键 | 第102
页 |
| · 水分子的自扩散系数 | 第102-103
页 |
| · 表面结构和性质 | 第103-104
页 |
| · 本章小结 | 第104-106
页 |
| 结论 | 第106-109
页 |
| 展望 | 第109-110
页 |
| 参考文献 | 第110-141
页 |
| 攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第141-142
页 |
| 致谢 | 第142页 |
