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几种新型分子标记技术在中国香菇种质资源遗传多样性研究中的应用

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几种新型分子标记技术在中国香菇种质资源遗传多样性研究中的应用
论文目录
 
摘要第1-11 页
ABSTRACT第11-15 页
缩略词表第15-17 页
第1章 文献综述第17-42 页
  · 香菇研究概述第17-19 页
    · 生物学特性第17 页
    · 食药用功效第17-18 页
    · 遗传育种进展第18-19 页
  · 分子标记技术的类型及其在食用菌研究中的应用第19-40 页
    · 分子标记的类型第20-33 页
      · 基于分子杂交技术的分子标记第20-21 页
      · 基于PCR技术的分子标记第21-30 页
      · 限制性酶切和PCR结合的分子标记第30-31 页
      · 基于单个核苷酸多态性的DNA标记第31-33 页
    · 分子标记技术在食用菌研究中的应用第33-40 页
      · 菌株遗传多样性和亲缘关系分析第33-35 页
      · 种质资源评价及菌株鉴定第35-36 页
      · 杂交亲本选择及杂交子鉴定第36-37 页
      · 基因克隆第37-38 页
      · 遗传图谱构建和基因定位第38-39 页
      · 线粒体遗传研究第39-40 页
  · 本研究的目的和意义第40-42 页
第2章 香菇SSR标记的开发及SSR-PCR技术体系的优化第42-60 页
  · 引言第42 页
  · 材料与方法第42-50 页
    · 试验材料第42-44 页
      · 供试香菇菌株第42 页
      · 供试培养基第42-44 页
    · 试验试剂第44-45 页
      · 贮存液第44 页
      · DNA提取液第44-45 页
      · 大肠杆菌感受态细胞的制备试剂第45 页
      · 质粒提取试剂第45 页
    · 试验方法第45-50 页
      · 香菇基因组DNA的提取第45-46 页
      · PCR产物纯化回收第46 页
      · 克隆与测序第46-48 页
      · ISSR-PCR扩增第48 页
      · ISSR-抑制PCR法开发香菇微卫星标记第48-49 页
      · 数据库法开发香菇微卫星标记第49 页
      · SSR-PCR反应体系的建立和优化第49-50 页
  · 结果与分析第50-56 页
    · ISSR-抑制PCR法开发SSR标记第50-52 页
      · ISSR扩增和测序结果第50-51 页
      · 抑制PCR和SSR的分离第51-52 页
    · 数据库搜索法开发SSR标记第52-53 页
    · SSR引物的筛选第53-55 页
    · SSR-PCR反应体系的建立和优化第55-56 页
      · SSR-PCR反应体系的正交优化第55-56 页
      · 退火温度优化第56 页
  · 讨论第56-60 页
    · ISSR-抑制PCR法开发香菇SSR标记第57-58 页
    · 数据库搜索法开发香菇SSR标记第58 页
    · SSR-PCR反应体系的建立和优化第58-60 页
第3章 中国香菇野生种质遗传多样性的SSR分析第60-74 页
  · 引言第60-61 页
  · 材料与方法第61-68 页
    · 供试菌株第61-62 页
    · 试验试剂第62-63 页
      · 贮存液第62-63 页
      · 染色溶液(碱性法)第63 页
    · 试验方法第63-68 页
      · 香菇基因组DNA的提取第63 页
      · SSR-PCR扩增第63-64 页
      · PAGE凝胶电泳第64 页
      · 银染程序第64-65 页
      · 数据分析第65-68 页
  · 结果与分析第68-72 页
    · SSR标记的多态性第68-69 页
    · 基于SSR标记的聚类分析第69-70 页
    · 基于SSR标记的主坐标分析第70-72 页
  · 讨论第72-74 页
第4章 中国香菇野生种质遗传多样性的TRAP分析第74-91 页
  · 引言第74 页
  · 材料和方法第74-76 页
    · 供试菌株第74 页
    · DNA提取第74 页
    · TRAP引物设计第74-75 页
    · PCR反应体系优化第75 页
    · TRAP-PCR扩增第75 页
    · 数据分析第75 页
    · 扩增条带的序列测定第75-76 页
  · 结果和分析第76-86 页
    · TRAP-PCR体系的优化第76-81 页
      · 模板DNA浓度对TRAP-PCR反应结果的影响第76-77 页
      · dNTPs浓度对TRAP-PCR反应结果的影响第77 页
      · Mg2+浓度对TRAP-PCR反应结果的影响第77-78 页
      · 随机引物浓度对TRAP-PCR反应结果的影响第78-80 页
      · 固定引物浓度对TRAP-PCR反应结果的影响第80 页
      · Taq酶浓度对TRAP-PCR反应结果的影响第80-81 页
      · 最佳TRAP-PCR反应体系第81 页
    · TRAP标记的多态性第81-82 页
    · 基于TRAP标记的遗传相似性分析第82-84 页
    · 基于TRAP标记的聚类分析第84-85 页
    · 基于TRAP标记的主坐标分析第85 页
    · TRAP标记真实性的验证第85-86 页
  · 讨论第86-91 页
    · TRAP-PCR的优化第86-87 页
    · TRAP标记技术第87-89 页
    · 中国香菇野生种质的遗传多样性第89-91 页
第5章 中国香菇野生种质遗传多样性的SSR和TRAP整合比较分析第91-99 页
  · 前言第91 页
  · 中国香菇野生种质遗传多样性SSR及TRAP分析间的比较第91-93 页
    · 两种标记方法间的相似点第92 页
      · 扩增结果的高多态性第92 页
      · 中国香菇自然种群的遗传关系第92 页
    · 两种标记方法间的不同点第92-93 页
  · 中国香菇野生种质遗传多样性的SSR和TRAP数据整合分析第93-99 页
    · 遗传相似性分析第93 页
    · 聚类分析第93-94 页
    · 主坐标分析第94-96 页
    · 讨论第96-99 页
      · 供试菌株的遗传关系第96-97 页
      · 各群体遗传多样性分析第97-99 页
第6章 中国香菇栽培种质遗传多样性的IRAP和REMAP分析第99-116 页
  · 前言第99-100 页
  · 材料和方法第100-103 页
    · 供试菌株第100 页
    · DNA提取第100 页
    · 引物设计第100-102 页
    · PCR反应体系优化第102-103 页
    · IRAP-PCR扩增第103 页
    · 数据分析第103 页
  · 结果和分析第103-112 页
    · IRAP-PCR体系的优化第103-106 页
      · 模板DNA浓度对IRAP-PCR反应结果的影响第103 页
      · 引物浓度对IRAP-PCR反应结果的影响第103-104 页
      · dNTPs浓度对IRAP-PCR反应结果的影响第104-105 页
      · Mg2+浓度对IRAP-PCR反应结果的影响第105 页
      · Taq酶浓度对IRAP-PCR反应结果的影响第105-106 页
      · 退火温度优化第106 页
    · IRAP和REMAP标记的多态性第106-108 页
    · 基于IRAP和REMAP标记的遗传相似性分析第108 页
    · 基于IRAP和REMAP标记的聚类分析第108-111 页
    · 基于IRAP和REMAP标记的主坐标分析第111-112 页
  · 讨论第112-116 页
    · IRAP-PCR的优化第112-113 页
    · IRAP及REMAP标记技术第113-114 页
    · 香菇栽培菌株的遗传关系第114-116 页
第7章 香菇栽培菌株IRAP-SCAR标记的开发第116-123 页
  · 前言第116 页
  · 材料和方法第116-117 页
    · 供试菌株第116 页
    · 特异性扩增条带的序列测定第116 页
    · 引物设计第116 页
    · PCR扩增第116-117 页
  · 结果和分析第117-121 页
    · 特异性带选择第117 页
    · DNA回收第117 页
    · 菌落PCR检测第117-118 页
    · 测序结果第118-120 页
    · SCAR引物设计第120-121 页
    · SCAR-PCR第121 页
  · 讨论第121-123 页
全文结论第123-125 页
本论文主要创新点及下一步研究工作设想第125-126 页
参考文献第126-146 页
致谢第146-147 页
附录1 测定的12个TRAP序列第147-150 页
附录2 16个野生香菇菌株的IRAP聚类结果第150-151 页
附录3 攻读博士学位期间发表与课题相关的论文第151-152 页

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