论文目录 | |
摘要 | 第1-11
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ABSTRACT | 第11-15
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缩略词表 | 第15-17
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第1章 文献综述 | 第17-42
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· 香菇研究概述 | 第17-19
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· 生物学特性 | 第17
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· 食药用功效 | 第17-18
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· 遗传育种进展 | 第18-19
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· 分子标记技术的类型及其在食用菌研究中的应用 | 第19-40
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· 分子标记的类型 | 第20-33
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· 基于分子杂交技术的分子标记 | 第20-21
页 |
· 基于PCR技术的分子标记 | 第21-30
页 |
· 限制性酶切和PCR结合的分子标记 | 第30-31
页 |
· 基于单个核苷酸多态性的DNA标记 | 第31-33
页 |
· 分子标记技术在食用菌研究中的应用 | 第33-40
页 |
· 菌株遗传多样性和亲缘关系分析 | 第33-35
页 |
· 种质资源评价及菌株鉴定 | 第35-36
页 |
· 杂交亲本选择及杂交子鉴定 | 第36-37
页 |
· 基因克隆 | 第37-38
页 |
· 遗传图谱构建和基因定位 | 第38-39
页 |
· 线粒体遗传研究 | 第39-40
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· 本研究的目的和意义 | 第40-42
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第2章 香菇SSR标记的开发及SSR-PCR技术体系的优化 | 第42-60
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· 引言 | 第42
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· 材料与方法 | 第42-50
页 |
· 试验材料 | 第42-44
页 |
· 供试香菇菌株 | 第42
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· 供试培养基 | 第42-44
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· 试验试剂 | 第44-45
页 |
· 贮存液 | 第44
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· DNA提取液 | 第44-45
页 |
· 大肠杆菌感受态细胞的制备试剂 | 第45
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· 质粒提取试剂 | 第45
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· 试验方法 | 第45-50
页 |
· 香菇基因组DNA的提取 | 第45-46
页 |
· PCR产物纯化回收 | 第46
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· 克隆与测序 | 第46-48
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· ISSR-PCR扩增 | 第48
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· ISSR-抑制PCR法开发香菇微卫星标记 | 第48-49
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· 数据库法开发香菇微卫星标记 | 第49
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· SSR-PCR反应体系的建立和优化 | 第49-50
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· 结果与分析 | 第50-56
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· ISSR-抑制PCR法开发SSR标记 | 第50-52
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· ISSR扩增和测序结果 | 第50-51
页 |
· 抑制PCR和SSR的分离 | 第51-52
页 |
· 数据库搜索法开发SSR标记 | 第52-53
页 |
· SSR引物的筛选 | 第53-55
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· SSR-PCR反应体系的建立和优化 | 第55-56
页 |
· SSR-PCR反应体系的正交优化 | 第55-56
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· 退火温度优化 | 第56
页 |
· 讨论 | 第56-60
页 |
· ISSR-抑制PCR法开发香菇SSR标记 | 第57-58
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· 数据库搜索法开发香菇SSR标记 | 第58
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· SSR-PCR反应体系的建立和优化 | 第58-60
页 |
第3章 中国香菇野生种质遗传多样性的SSR分析 | 第60-74
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· 引言 | 第60-61
页 |
· 材料与方法 | 第61-68
页 |
· 供试菌株 | 第61-62
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· 试验试剂 | 第62-63
页 |
· 贮存液 | 第62-63
页 |
· 染色溶液(碱性法) | 第63
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· 试验方法 | 第63-68
页 |
· 香菇基因组DNA的提取 | 第63
页 |
· SSR-PCR扩增 | 第63-64
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· PAGE凝胶电泳 | 第64
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· 银染程序 | 第64-65
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· 数据分析 | 第65-68
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· 结果与分析 | 第68-72
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· SSR标记的多态性 | 第68-69
页 |
· 基于SSR标记的聚类分析 | 第69-70
页 |
· 基于SSR标记的主坐标分析 | 第70-72
页 |
· 讨论 | 第72-74
页 |
第4章 中国香菇野生种质遗传多样性的TRAP分析 | 第74-91
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· 引言 | 第74
页 |
· 材料和方法 | 第74-76
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· 供试菌株 | 第74
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· DNA提取 | 第74
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· TRAP引物设计 | 第74-75
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· PCR反应体系优化 | 第75
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· TRAP-PCR扩增 | 第75
页 |
· 数据分析 | 第75
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· 扩增条带的序列测定 | 第75-76
页 |
· 结果和分析 | 第76-86
页 |
· TRAP-PCR体系的优化 | 第76-81
页 |
· 模板DNA浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第76-77
页 |
· dNTPs浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第77
页 |
· Mg2+浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第77-78
页 |
· 随机引物浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第78-80
页 |
· 固定引物浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第80
页 |
· Taq酶浓度对TRAP-PCR反应结果的影响 | 第80-81
页 |
· 最佳TRAP-PCR反应体系 | 第81
页 |
· TRAP标记的多态性 | 第81-82
页 |
· 基于TRAP标记的遗传相似性分析 | 第82-84
页 |
· 基于TRAP标记的聚类分析 | 第84-85
页 |
· 基于TRAP标记的主坐标分析 | 第85
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· TRAP标记真实性的验证 | 第85-86
页 |
· 讨论 | 第86-91
页 |
· TRAP-PCR的优化 | 第86-87
页 |
· TRAP标记技术 | 第87-89
页 |
· 中国香菇野生种质的遗传多样性 | 第89-91
页 |
第5章 中国香菇野生种质遗传多样性的SSR和TRAP整合比较分析 | 第91-99
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· 前言 | 第91
页 |
· 中国香菇野生种质遗传多样性SSR及TRAP分析间的比较 | 第91-93
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· 两种标记方法间的相似点 | 第92
页 |
· 扩增结果的高多态性 | 第92
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· 中国香菇自然种群的遗传关系 | 第92
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· 两种标记方法间的不同点 | 第92-93
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· 中国香菇野生种质遗传多样性的SSR和TRAP数据整合分析 | 第93-99
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· 遗传相似性分析 | 第93
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· 聚类分析 | 第93-94
页 |
· 主坐标分析 | 第94-96
页 |
· 讨论 | 第96-99
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· 供试菌株的遗传关系 | 第96-97
页 |
· 各群体遗传多样性分析 | 第97-99
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第6章 中国香菇栽培种质遗传多样性的IRAP和REMAP分析 | 第99-116
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· 前言 | 第99-100
页 |
· 材料和方法 | 第100-103
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· 供试菌株 | 第100
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· DNA提取 | 第100
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· 引物设计 | 第100-102
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· PCR反应体系优化 | 第102-103
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· IRAP-PCR扩增 | 第103
页 |
· 数据分析 | 第103
页 |
· 结果和分析 | 第103-112
页 |
· IRAP-PCR体系的优化 | 第103-106
页 |
· 模板DNA浓度对IRAP-PCR反应结果的影响 | 第103
页 |
· 引物浓度对IRAP-PCR反应结果的影响 | 第103-104
页 |
· dNTPs浓度对IRAP-PCR反应结果的影响 | 第104-105
页 |
· Mg2+浓度对IRAP-PCR反应结果的影响 | 第105
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· Taq酶浓度对IRAP-PCR反应结果的影响 | 第105-106
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· 退火温度优化 | 第106
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· IRAP和REMAP标记的多态性 | 第106-108
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· 基于IRAP和REMAP标记的遗传相似性分析 | 第108
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· 基于IRAP和REMAP标记的聚类分析 | 第108-111
页 |
· 基于IRAP和REMAP标记的主坐标分析 | 第111-112
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· 讨论 | 第112-116
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· IRAP-PCR的优化 | 第112-113
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· IRAP及REMAP标记技术 | 第113-114
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· 香菇栽培菌株的遗传关系 | 第114-116
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第7章 香菇栽培菌株IRAP-SCAR标记的开发 | 第116-123
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· 前言 | 第116
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· 材料和方法 | 第116-117
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· 供试菌株 | 第116
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· 特异性扩增条带的序列测定 | 第116
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· 引物设计 | 第116
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· PCR扩增 | 第116-117
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· 结果和分析 | 第117-121
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· 特异性带选择 | 第117
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· DNA回收 | 第117
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· 菌落PCR检测 | 第117-118
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· 测序结果 | 第118-120
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· SCAR引物设计 | 第120-121
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· SCAR-PCR | 第121
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· 讨论 | 第121-123
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全文结论 | 第123-125
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本论文主要创新点及下一步研究工作设想 | 第125-126
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参考文献 | 第126-146
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致谢 | 第146-147
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附录1 测定的12个TRAP序列 | 第147-150
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附录2 16个野生香菇菌株的IRAP聚类结果 | 第150-151
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附录3 攻读博士学位期间发表与课题相关的论文 | 第151-152
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