论文目录 | |
摘要 | 第12-14
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Abstract | 第14-17
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缩略词 | 第17-19
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第一章 文献综述 | 第19-34
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· 植物DNA甲基化的建立和去甲基化 | 第19-22
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· 植物中5-甲基胞嘧啶的分布 | 第19-20
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· 植物中5-甲基胞嘧啶的含量 | 第20
页 |
· 植物DNA甲基化作用方式 | 第20-21
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· DNA去甲基化现象 | 第21-22
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· 植物DNA甲基化的功能 | 第22-25
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· 维持植物正常的生长发育 | 第22
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· 调节基因表达 | 第22-23
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· 维持基因组稳定性 | 第23-24
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· DNA甲基化与植物春化作用 | 第24
页 |
· DNA甲基化与杂种优势 | 第24-25
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· DNA甲基化与体细胞无性系变异 | 第25
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· DNA甲基化的研究方法 | 第25-27
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· MSAP | 第26
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· 高效液相色谱法 | 第26
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· 亚硫酸盐测序 | 第26-27
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· 甲基化敏感的限制性内切酶结合Southern杂交分析法 | 第27
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· 植物DNA甲基转移酶及与甲基化有关的蛋白 | 第27-32
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· MET1家族 | 第28-29
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· CMT家族 | 第29-30
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· DRM家族 | 第30-31
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· DDM1 | 第31-32
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· 本研究的目的意义 | 第32-34
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第二章 草莓和苹果DNA甲基转移酶基因片段的分离 | 第34-45
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· 材料与方法 | 第34-38
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· 植物材料 | 第34
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· 草莓和苹果基因组DNA的提取及检测 | 第34-35
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· 引物设计 | 第35
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· PCR反应 | 第35-36
页 |
· PCR特异DNA片段的回收 | 第36
页 |
· PCR产物克隆、测序 | 第36-38
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· 序列比对与分析 | 第38
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· 结果与分析 | 第38-43
页 |
· 草莓和苹果基因组DNA的质量和完整性检测 | 第38-39
页 |
· 草莓和苹果DNA甲基转移酶基因片段分离 | 第39
页 |
· MET1基因和DRM基因特异片段序列分析 | 第39-43
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· 讨论 | 第43-44
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· 克隆DNA片段的检测 | 第43-44
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· DNA甲基转移酶基因的进化 | 第44
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· 小结 | 第44-45
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第三章 草莓DNA甲基转移酶基因全序列的分离 | 第45-75
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· 材料与方法 | 第45-62
页 |
· 植物材料 | 第45
页 |
· 草莓基因组DNA和RNA的制备 | 第45-46
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· 引物设计 | 第46
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· 基因全长的获得 | 第46-50
页 |
· 完整cDNA的获得 | 第50-58
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· PCR特异DNA片段的回收 | 第58
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· PCR产物克隆测序 | 第58
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· 序列比对与分析 | 第58
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· Southern blot | 第58-62
页 |
· 结果与分析 | 第62-71
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· 草莓 DNA甲基转移酶基因全序列的获得 | 第62-64
页 |
· 草莓 DNA甲基转移酶基因cDNA全序列的获得 | 第64-66
页 |
· 草莓 DNA甲基转移酶基因拷贝数 | 第66-67
页 |
· DNA甲基转移酶基因序列分析 | 第67-70
页 |
· 草莓 DNA甲基转移酶基因的内含子及选择性剪接 | 第70-71
页 |
· 讨论 | 第71-74
页 |
· DNA甲基转移酶基因的分离方法 | 第71-72
页 |
· DNA甲基转移酶基因序列特性 | 第72-74
页 |
· 小结 | 第74-75
页 |
第四章 草莓 DNA甲基转移酶基因表达分析 | 第75-85
页 |
· 材料与方法 | 第75-79
页 |
· 植物材料 | 第75-76
页 |
· 总核酸和总 RNA提取 | 第76
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· 病毒检测 | 第76-77
页 |
· 实时定量 PCR | 第77-79
页 |
· 结果与分析 | 第79-82
页 |
· 病毒对草莓DNA甲基转移酶基因表达的影响 | 第79-81
页 |
· 微繁殖对草莓DNA甲基转移酶基因表达的影响 | 第81-82
页 |
· 讨论 | 第82-84
页 |
· 实时定量PCR偏差的克服方法 | 第82-83
页 |
· 组培诱导的表观遗传变异及与DNA甲基化的关系 | 第83
页 |
· 病毒对DNA甲基转移酶基因表达的影响 | 第83-84
页 |
· 简化的草莓病毒检测体系的优点 | 第84
页 |
· 小结 | 第84-85
页 |
第五章 DNA甲基转移酶基因在二倍体与四倍体苹果中表达分析 | 第85-93
页 |
· 材料与方法 | 第85-86
页 |
· 植物材料 | 第85
页 |
· 基因组RNA提取和质量、纯度检测 | 第85
页 |
· 半定量RT-PCR | 第85-86
页 |
· 结果与分析 | 第86-91
页 |
· 半定量RT-PCR体系建立 | 第86-88
页 |
· DNA甲基转移酶基因在‘寒富’苹果二倍体与四倍体中的表达差异 | 第88-91
页 |
· 讨论 | 第91-92
页 |
· 苹果DNA甲基转移酶基因及其表达差异 | 第91
页 |
· 半定量RT-PCR技术要点 | 第91-92
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· 小结 | 第92-93
页 |
第六章 草莓FaMET1和FaDRM启动子的分离鉴定 | 第93-102
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· 材料与方法 | 第93-97
页 |
· 植物材料 | 第93
页 |
· 基因组DNA提取和质量、纯度检测 | 第93
页 |
· 启动子特异片段扩增 | 第93-94
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· PCR特异DNA片段的回收 | 第94
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· PCR产物克隆测序 | 第94
页 |
· 序列分析 | 第94
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· 启动子表达载体的构建 | 第94-96
页 |
· 农杆菌感受态细胞的制备、转化、阳性克隆的筛选 | 第96-97
页 |
· 农杆菌侵染草莓果实及GUS活性检测 | 第97
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· 结果与分析 | 第97-100
页 |
· 草莓DNA甲基转移酶基因启动子特异片段克隆和序列分析 | 第97-98
页 |
· GUS融合基因的构建 | 第98-99
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· 草莓DNA甲基转移酶基因启动子活性分析 | 第99-100
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· 讨论 | 第100-101
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· GUS报告基因的优缺点 | 第100-101
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· 草莓DNA甲基转移酶基因转录活性 | 第101
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· 小结 | 第101-102
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第七章 结论与创新点 | 第102-104
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· 结论 | 第102
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· 创新点 | 第102-103
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· 下一步研究设想 | 第103-104
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参考文献 | 第104-117
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附录 | 第117-123
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致谢 | 第123-124
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攻读博士期间发表论文 | 第124
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