基于频率谱的蛋白质结构和相互作用位点预测



基于频率谱的蛋白质结构和相互作用位点预测

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基于频率谱的蛋白质结构和相互作用位点预测

论文目录
摘要	第1-6页
Abstract	第6-15页
第1章绪论	第15-33页
· 课题的研究背景	第15-16页
· 人类基因组计划与后基因组时代	第15页
· 蛋白质组学	第15-16页
· 生物信息学	第16页
· 课题研究的目的和意义	第16-18页
· 研究现状	第18-29页
· 蛋白质无序区预测研究现状	第18-22页
· 蛋白质远程同源性检测和折叠识别研究现状	第22-24页
· 蛋白质相互作用位点预测研究现状	第24-29页
· 本文的研究内容及创新点	第29-31页
· 研究内容概述	第29-31页
· 本文的主要创新点	第31页
· 本文的内容安排	第31-33页
第2章基于排序谱长无序区倾向性与PSSM 的蛋白质长无序区域预测	第33-51页
· 引言	第33-34页
· 频率谱	第34-36页
· 频率谱转化为排序谱	第36-39页
· 排序谱长无序区倾向性计算方法	第39-40页
· 位置特异性分数矩阵(PSSM)	第40-41页
· 预测方法	第41-42页
· 实验结果与讨论	第42-50页
· 数据集	第42-43页
· 评价指标	第43-44页
· 氨基酸长无序区倾向性	第44-45页
· 排序谱长无序区倾向性	第45-46页
· 参数优化和五份交叉验证	第46-47页
· 预测示例	第47-48页
· 独立测试	第48-50页
· 本章小结	第50-51页
第3章基于Top-n-gram 的蛋白质远程同源性检测和折叠识别	第51-74页
· 引言	第51-53页
· Top-n-gram	第53-54页
· 预测方法	第54-60页
· 创建支持向量机分类器	第54-59页
· 潜在语义分析	第59-60页
· 实验结果与分析	第60-73页
· 数据集	第60-61页
· 评价指标	第61页
· 统计检验	第61-62页
· 实验结果	第62-63页
· 实验结果分析	第63-68页
· 时间复杂度	第68-70页
· Top-n-gram 和蛋白质家族之间的关系	第70-72页
· 讨论	第72-73页
· 本章小结	第73-74页
第4章基于排序谱相互作用位点倾向性的蛋白质相互作用位点预测	第74-89页
· 引言	第74-75页
· 排序谱相互作用位点倾向性计算方法	第75页
· 蛋白质相互作用位点预测方法	第75-77页
· 三种相互作用位点倾向性比较	第77-82页
· 氨基酸相互作用位点倾向性	第77-79页
· 二进制谱相互作用位点倾向性	第79页
· 排序谱相互作用位点倾向性	第79-82页
· 实验结果与分析	第82-88页
· 实验数据集的建立方法	第82-83页
· 评估准则	第83-84页
· 四类复合物数据集实验结果	第84-85页
· 相互作用位点预测实例	第85-87页
· 对比实验	第87-88页
· 本章小结	第88-89页
第5章基于隐马尔可夫支持向量机的蛋白质相互作用位点预测	第89-110页
· 引言	第89-90页
· 隐马尔可夫支持向量机	第90-93页
· 基于HM-SVM 的蛋白质相互作用位点预测	第93-96页
· 特征的定义	第93-95页
· 对比实验步骤	第95页
· 五份交叉验证	第95-96页
· 实验结果与分析	第96-109页
· 数据集	第96-97页
· 基本特征集上各种方法性能比较	第97-101页
· 训练样本数量对预测结果的影响	第101-103页
· 临近氨基酸的信息对预测效果的影响	第103页
· 滑动窗口对实验结果的影响	第103-104页
· 预测实例	第104-106页
· 使用排序谱相互作用位点倾向性的HM-SVM	第106-107页
· 讨论	第107-109页
· 本章小结	第109-110页
结论	第110-112页
参考文献	第112-127页
攻读学位期间发表的学术论文	第127-129页
致谢	第129-131页
个人简历	第131页

本篇论文共131页，点击这进入下载页面。

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