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越南篦齿苏铁(Cycas elongata)MADS-box基因克隆表达模式分析与内参基因筛选
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越南篦齿苏铁(Cycas elongata)MADS-box基因克隆表达模式分析与内参基因筛选
论文目录
 
摘要第1-5页
Abstract第5-11页
1 前言第11-23页
　　· 被子植物花的起源第11-12页
　　· MADS-box基因与被子植物第12-14页
　　　　· 基因简介第12页
　　　　· 基因历史第12页
　　　　· 基因结构与类型第12-13页
　　　　· 基因生物功能第13-14页
　　· MADS-box基因与裸子植物第14-18页
　　· 种子植物MADS-box基因系统发育概述第18-20页
　　· MADS-box基因花起源假设第20-21页
　　· 实时荧光定量PCR内参基因筛选第21-22页
　　· 本研究目的意义第22-23页
2 实验材料与方法第23-36页
　　· 实验材料第23-25页
　　　　· 植物材料第23-24页
　　　　· 试剂第24-25页
　　　　· 仪器第25页
　　　　· 分析软件第25页
　　· 实验方法第25-36页
　　　　· 转录组数据挖掘候选基因第25-26页
　　　　　　· 本地CMD命令行Blastn、Blastx和Blastp分析第25-26页
　　　　　　· HHMER模型同源序列搜索第26页
　　　　　　· 验证搜索结果第26页
　　　　· 候选基因引物设计第26-27页
　　　　　　· 普通PCR引物第26页
　　　　　　· 实时荧光定量PCR引物第26-27页
　　　　· 总RNA提取第27页
　　　　· RNA纯度及完整性检测第27-28页
　　　　· 反转录cDNA第一条链第28-29页
　　　　　　· 基因组DNA去除反应第28页
　　　　　　· 反转录反应第28-29页
　　　　· 目标片段PCR扩增第29页
　　　　· PCR产物凝胶回收第29-30页
　　　　· 载体克隆目的片段第30-32页
　　　　　　· 配置LB培养基第30-31页
　　　　　　· 连接第31页
　　　　　　· 感受态细胞制备第31页
　　　　　　· 转化第31-32页
　　　　· 质粒抽提及测序第32页
　　　　· 测序结果确认第32-33页
　　　　· 内参基因荧光定量PCR第33页
　　　　· 内参基因筛选第33-35页
　　　　　　· 软件筛选最稳定内参基因第34-35页
　　　　　　· 最稳定内参基因评估第35页
　　　　· 构建MADS-box基因树第35页
　　　　· MADS-box基因荧光定量PCR第35-36页
3 结果与分析第36-56页
　　· 转录组数据目标基因挖掘第36-38页
　　　　· MADSA-box基因第36-37页
　　　　· 内参基因第37-38页
　　· 越南篦齿苏铁总RNA提取第38-39页
　　· 目标基因引物设计、克隆与序列确定第39-44页
　　　　· MADS-box基因第39-41页
　　　　· 内参基因第41-44页
　　· MADS-box基因系统发育树构建第44-47页
　　· 稳定内参基因筛选第47-53页
　　　　· 荧光定量PCR、引物设计和Ct值获取第47-48页
　　　　· 软件分析内参基因稳定性第48-51页
　　　　· 稳定内参基因评估第51-53页
　　· MADS-box基因表达模式分析第53-56页
4 讨论与结论第56-66页
　　· 内参基因筛选第56-58页
　　　　· 内参基因的稳定性第56-57页
　　　　· 最佳内参基因个数第57-58页
　　　　· 稳定内参基因评估第58页
　　· MADS-box基因第58-64页
　　　　· MIKCC型第58-63页
　　　　　　· AG、DEF/GLO、AGL6亚族第59-61页
　　　　　　· 花起源分子机制第61-62页
　　　　　　· 其他亚族第62-63页
　　　　· Type I型第63-64页
　　· 结论第64-66页
致谢第66-68页
参考文献第68-76页
附录第76页

本篇论文共76页，点击这进入下载页面。
 
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