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AMPK/Cnrk1在里氏木霉纤维素酶基因表达调控中的功能研究

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AMPK/Cnrk1在里氏木霉纤维素酶基因表达调控中的功能研究
论文目录
 
摘要第1-10页
Abstract第10-13页
缩略词 (Abbreviation)第13-15页
第一章 绪论第15-37页
  1.1 纤维素概述第15-17页
    1.1.1 纤维素的产生及结构第15-17页
    1.1.2 纤维素的降解第17页
  1.2 里氏木霉纤维素酶的研究进展第17-19页
    1.2.1 里氏木霉纤维素酶系统的组成第17-18页
    1.2.2 纤维素酶分子的结构和功能第18-19页
  1.3 里氏木霉纤维素酶基因诱导表达机制假设第19-20页
  1.4 细胞内能量变化-碳代谢抑制及其调控第20-21页
  1.5 真核细胞能量感受器-AMPK第21-24页
    1.5.1 AMPK的组成和结构第21-23页
    1.5.2 AMPK级联反应:细胞内能量的开关第23-24页
  1.6 真菌碳代谢抑制调控的关键蛋白AMPK第24-28页
    1.6.1 酵母AMPK/Snf1的发现第25-26页
    1.6.2 Snf1复合物的组成和活性调控第26页
    1.6.3 Snf1复合物各亚基的功能第26-28页
    1.6.4 Snf1复合物的Snf1/α亚基活性与其他亚基的关系第28页
  1.7 AMPK/Snf1在酵母代谢调控中的功能第28-34页
    1.7.1 Snf1在葡糖糖阻遏(CCR)中的作用第29-30页
    1.7.2 Snf1在葡糖糖信号感应中的作用第30-31页
    1.7.3 Snf1在转录水平对细胞代谢的影响第31-33页
    1.7.4 Snf1在转录后水平对细胞代谢的影响第33-34页
  1.8 丝状真菌能量感应过程和AMPK的研究进展第34-35页
  1.9 立题依据及研究内容第35-37页
第二章 里氏木霉AMP-激活的蛋白激酶编码基因cnrk1的鉴定第37-52页
  2.1 材料与方法第37-44页
    2.1.1 菌种和质粒第37-38页
    2.1.2 引物第38-39页
    2.1.3 主要试剂及仪器第39-40页
    2.1.4 培养条件第40-42页
    2.1.5 常规分子生物学方法第42-44页
  2.2 结果与讨论第44-51页
    2.2.1 里氏木霉中cnrk1基因的鉴定和蛋白结构域比对分析第44-46页
    2.2.2 酵母AMPK在里氏木霉中的回补第46-47页
    2.2.3 里氏木霉Cnrk1在酵母中的回补第47-49页
    2.2.4 里氏木S Cnrkl-N端与爵母AMPK-C端融合片段在掉母AMPK缺失菌MCY4908中的回补第49-51页
  2.3 小结第51-52页
第三章 里氏木霉AMPK/Cnrk1缺失菌的构建和性状分析第52-72页
  3.1 材料与方法第52-63页
    3.1.1 菌种和质粒第52-53页
    3.1.2 引物第53页
    3.1.3 主要试剂及仪器第53页
    3.1.4 序列比对第53-54页
    3.1.5 培养基和培养条件第54页
    3.1.6 常规分子生物学方法第54-57页
    3.1.7 遗传操作第57-58页
    3.1.8 突变株鉴定第58-63页
    3.1.9 平板生长检测第63页
    3.1.10 发酵液蛋白浓度测定第63页
    3.1.11 外切葡聚糖(pNPC)酶活力测定方法第63页
  3.2 结果与讨论第63-71页
    3.2.1 里氏木霉中cnrk1基因缺失突变株的构建及验证第63-66页
    3.2.2 里氏木霉△cnrk1突变株的生长表型测定第66-67页
    3.2.3 里氏木霉Cnrk1的缺失对细胞壁完整性的影响第67-69页
    3.2.4 里氏木霉Cnrk1的缺失对孢子存活的影响第69-70页
    3.2.5 Cnrk1的缺失对里氏木霉纤维素酶产生的影响第70-71页
  3.3 小结第71-72页
第四章 Tricoderma reesei Cnrk1活性突变株的构建及性质研究第72-91页
  4.1 材料与方法第72-80页
    4.1.1 菌种和质粒第72-73页
    4.1.2 引物第73-74页
    4.1.3 主要试剂及仪器第74-75页
    4.1.4 生物信息学分析第75页
    4.1.5 培养条件第75页
    4.1.6 常规分子生物学方法第75-80页
  4.2 结果与讨论第80-90页
    4.2.1 里氏木霉Cnrk1与酵母AMPK氨基酸活性位点比对分析第80页
    4.2.2 里氏木霉中Cnrk1活性突变株的构建及验证第80-82页
    4.2.3 里氏木霉Cnrk1活性突变株对不同碳源的利用第82-83页
    4.2.4 里氏木霉Cnrk1活性突变对纤维素酶产生的影响第83-84页
    4.2.5 里氏木霉Cnrk1G18R突变对纤维素酶产生的影响第84-88页
    4.2.6 里氏木霉Cnrk1G18R/T175A双突变对纤维素酶产生的影响第88-89页
    4.2.7 △cnrk1诱导动力学分析第89-90页
  4.3 小结第90-91页
第五章 酵母双杂交体系筛选与Cnrk1相互作用蛋白第91-101页
  5.1 材料与方法第92-97页
    5.1.1 菌种和质粒第92页
    5.1.2 引物第92-93页
    5.1.3 主要试剂及仪器第93页
    5.1.4 培养条件第93-94页
    5.1.5 常规分子生物学方法第94-97页
  5.2 结果与讨论第97-100页
    5.2.1 Bait重组质粒pGBKT7-Cnrk1构建与鉴定第97页
    5.2.2 重组诱饵质粒pGBKT7-Cnrk1在Y2HGold中的表达和鉴定第97页
    5.2.3 pGBKT7-Cnrk1 bait菌株毒性及自激活检测第97-98页
    5.2.4 文库质粒在bait菌种的大规模转化第98页
    5.2.5 转化子的筛选第98-99页
    5.2.6 转化子的鉴定第99页
    5.2.7 阳性克隆测序结果分析第99-100页
  5.3 小结第100-101页
全文总结第101-103页
参考文献第103-109页
致谢第109-110页
附件第110页

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