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生物多序列比对算法Kalign’s的研究分析
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生物多序列比对算法Kalign’s的研究分析
论文目录
 
摘要第1-5 页
ABSTRACT第5-10 页
第一章 绪论第10-17 页
　　· 生物信息学的背景及意义第10-12 页
　　· 生物信息学的研究现状第12-14 页
　　· 论文主要工作及安排第14-15 页
　　　　· 论文主要工作第14-15 页
　　　　· 论文内容具体安排第15 页
　　· 本章小结第15-17 页
第二章 序列比对基础第17-31 页
　　· 概论第17-19 页
　　· 空位罚分和记分矩阵第19-22 页
　　　　· 空位罚分第19-21 页
　　　　· 记分矩阵第21-22 页
　　· 目标函数第22-27 页
　　　　· SP 目标函数第23-24 页
　　　　· COFFEE 目标函数第24-27 页
　　· 序列比对第27-30 页
　　　　· 双序列比对第27-28 页
　　　　· 多序列比对第28-30 页
　　· 本章小结第30-31 页
第三章 生物序列比对算法研究现状第31-52 页
　　· 双序列比对第31-40 页
　　　　· 双序列比对算法数学原理第31-35 页
　　　　· 点阵图法第35 页
　　　　· 动态规划算法第35-40 页
　　　　· BLAST 和FASTA 算法第40 页
　　· 多序列比对第40-50 页
　　　　· 多序列比对算法分析第40-44 页
　　　　· 经典多序列比对算法简介第44-49 页
　　　　· 一些其它多序列比对算法第49-50 页
　　· 本章小结第50-52 页
第四章 KALIGN’S 方法的提出与研究第52-70 页
　　· 字符串匹配原理第52-59 页
　　　　· 基本概念第52-57 页
　　　　· 字符串匹配原理第57-59 页
　　· Wu-Manber 算法数学原理第59-62 页
　　· KALIGN 算法第62 页
　　· KALIGN 算法的改进----KALIGN’s 算法第62-68 页
　　　　· 相似性得分第63-64 页
　　　　· 序列距离第64-65 页
　　　　· 树的构造第65-66 页
　　　　· 序列加权第66 页
　　　　· 迭代优化第66-68 页
　　· 本章小结第68-70 页
第五章 KALIGN’s 算法比对质量的实现与评估第70-74 页
　　· 多序列比对算法评价基准数据集 BAliBASE第70-71 页
　　· Kalign’s 算法测试结果第71-73 页
　　· 本章小结第73-74 页
第六章 结束语第74-77 页
致谢第77-78 页
参考文献第78-82 页
攻硕期间取得的研究成果第82-83 页

本篇论文共83页，点击这进入下载页面。
 
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