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主食变换对蒙古国志愿者肠道菌群结构及功能影响研究

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主食变换对蒙古国志愿者肠道菌群结构及功能影响研究
论文目录
 
摘要第3-5页
Abstract第5-11页
缩略语表第11-12页
1 引言第12-24页
  1.1 肠道菌群的概述第12-13页
  1.2 影响肠道菌群的因素第13-15页
    1.2.1 宿主基因第13页
    1.2.2 年龄第13-14页
    1.2.3 疾病第14页
    1.2.4 药物第14-15页
  1.3 膳食对肠道菌群的影响第15-21页
    1.3.1 膳食蛋白质与肠道菌群第15-16页
    1.3.2 膳食脂肪与肠道菌群第16页
    1.3.3 膳食碳水化合物与肠道菌群第16-21页
  1.4 高通量技术在肠道菌群中应用的研究进展第21-22页
  1.5 蒙古族膳食特点及肠道菌群的研究现状第22-23页
  1.6 立题意义与研究内容第23-24页
    1.6.1 立题目的与意义第23页
    1.6.2 主要研究内容第23-24页
2 材料和方法第24-32页
  2.1 试验设计第24页
  2.2 试验材料第24-26页
    2.2.1 志愿者信息第24-25页
    2.2.2 仪器和试剂第25-26页
  2.3 试验方法第26-32页
    2.3.1 样品采集及保存第26页
    2.3.2 样品宏基因组DNA的提取第26页
    2.3.3 细菌16S rRNA序列扩增及纯化第26-27页
    2.3.4 基因测序文库构建及测序第27-28页
    2.3.5 测序数据质量控制第28页
    2.3.6 测序结果生物信息学分析第28-30页
    2.3.7 肠道菌群的荧光定量(q-PCR)第30-31页
    2.3.8 统计学分析第31页
    2.3.9 测序数据登录号第31-32页
3 结果与分析第32-82页
  3.1 膳食中营养素含量分析第32-39页
  3.2 基于16S rRNA的测序结果分析主食变换对志愿者肠道菌群结构的影响第39-63页
    3.2.1 主食变换对志愿者肠道菌群α多样性的影响第39-41页
    3.2.2 主食变换对志愿者肠道菌群β多样性的影响第41-43页
    3.2.3 OTUs水平上主食变换对志愿者肠道菌群结构的影响第43-45页
    3.2.4 主食变换对志愿者肠道菌群相对含量的影响第45-56页
    3.2.5 肠道菌群的定量分析第56-59页
    3.2.6 主食变换过程中志愿者肠道菌群的PAM聚类分析第59-63页
  3.3 基于shotgun宏基因组测序结果分析主食变换对志愿者肠道菌群功能的影响第63-82页
    3.3.1 基于宏基因组测序结果主食变换对志愿者肠道菌群结构的影响第63-68页
    3.3.2 主食变换对志愿者肠道菌群功能的影响第68-73页
    3.3.3 主食变换对肠道菌群中碳水化合物活性酶的影响第73-77页
    3.3.4 肠道菌群与功能相关性分析第77-78页
    3.3.5 肠道菌群与噬菌体的协同作用第78-79页
    3.3.6 主食变换对肠道菌群影响程度分析第79-80页
    3.3.7 肠道菌群与膳食中主要营养素的线性关系第80-82页
4 讨论第82-87页
5 结论第87-88页
致谢第88-89页
参考文献第89-102页
附录第102-110页
作者简介第110-111页

本篇论文共111页,点击这进入下载页面
 
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