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拟南芥胚囊成员细胞转录谱与细胞类型特异表达基因的分析

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拟南芥胚囊成员细胞转录谱与细胞类型特异表达基因的分析
论文目录
 
摘要第1-11页
Abstract第11-13页
第一章 前言第14-29页
    1.1 雌配子体的发育第14-24页
        1.1.1 胚珠的发育第14-15页
        1.1.2 体细胞向生殖细胞的转化第15-16页
        1.1.3 功能大孢子的特化第16-17页
        1.1.4 功能大孢子的有丝分裂进程第17-19页
        1.1.5 胚囊的细胞化第19-20页
        1.1.6 胚囊的极性和配子细胞的特化第20-21页
        1.1.7 雌性生殖单位第21-24页
    1.2 卵细胞的研究进展概述第24-28页
        1.2.1 动物中卵细胞发生的细胞学过程第24-25页
        1.2.2 动物中卵母细胞的细胞结构特征第25页
        1.2.3 卵细胞的成熟与卵泡细胞的相互关系第25-26页
        1.2.4 受精过程第26-27页
        1.2.5 卵细胞的表观遗传调控第27-28页
    1.3. 本研究的目的与意义第28-29页
第二章 拟南芥胚囊成员细胞的大量分离技术建立及优化第29-48页
    2.1 引言第29页
    2.2 实验材料和方法第29-31页
        2.2.1 实验材料第29页
        2.2.2 实验试剂第29-30页
        2.2.3 实验器材第30页
        2.2.4 实验方法第30-31页
    2.3 实验结果第31-46页
        2.3.1 酶解法分离卵细胞第31-35页
        2.3.2 酶解-解剖法分离卵细胞第35-37页
        2.3.3 分离助细胞第37页
        2.3.4 分离合子第37-39页
        2.3.5 分离中央细胞第39-40页
        2.3.6 分离反足细胞(此部分工作与罗岸博士合作完成)第40-44页
        2.3.7 反足细胞体外培养第44-46页
    2.4 讨论第46-48页
第三章 卵细胞的RNA-seq以及数据分析第48-66页
    3.1 引言第48页
    3.2 实验方法第48-51页
        3.2.1 少量细胞mRNA提取以及cDNA扩增第48-50页
        3.2.2 转录组数据生物信息学分析过程第50-51页
    3.3 实验结果第51-66页
        3.3.1 卵细胞的少量细胞扩增质量评估第51页
        3.3.2 卵细胞转录组数据质量统计和评估第51-53页
        3.3.3 卵细胞转录组基因富集分析第53-56页
        3.3.4 卵细胞表达的转录因子第56-59页
        3.3.5 卵细胞表达的分泌性蛋白第59-62页
        3.3.6 卵细胞表达的激酶第62-64页
        3.3.7 卵细胞表法的离子通道蛋白第64-66页
第四章 合子的转录组测序以及数据分析第66-74页
    4.1 合子cDNA扩增的质量检测第66页
    4.2 转录组基因富集分析第66-69页
    4.3 合子中表达的转录因子第69-70页
    4.4 合子中表达的胞外定位蛋白第70-74页
第五章 反足细胞转录组测序及数据分析第74-83页
    5.1 少量细胞的扩增以及cDNA质量评估第74-75页
    5.2 反足细胞转录组基因富集分析第75-77页
    5.3 反足细胞中表达的胞外分泌性蛋白第77-80页
    5.4 反足细胞中表达的激酶第80-83页
第六章 卵细胞和合子差异表达谱分析第83-87页
    6.1 引言第83页
    6.2 卵细胞中特异表达基因分析第83-85页
    6.3 合子中特异表达基因的分析第85-87页
第七章 卵细胞和反足细胞的转录谱差异基因分析第87-93页
    7.1 引言第87页
    7.2 卵细胞和反足细胞差异转录因子分析第87-89页
    7.3 卵细胞和反足细胞差异激酶分析第89-90页
    7.4 卵细胞和反足细胞差异的分泌性蛋白分析第90-93页
第八章 卵细胞特异表达基因的验证第93-108页
    8.1 引言第93页
    8.2 实验材料与方法第93-94页
        8.2.1 实验材料第93页
        8.2.2 实验方法第93-94页
    8.3 实验结果第94-105页
        8.3.1 RT-PCR分析Egg1-Egg7在根茎叶花中的表达模式第94-97页
        8.3.2 融合蛋白分析Egg1-Egg7的表达模式第97-102页
        8.3.3 Egg1和Egg2启动子活性分析第102-104页
        8.3.4 少量细胞的RT-PCR分析Egg1和Egg2的表达模式第104-105页
    8.4 讨论第105-106页
    8.5 结论与展望第106-108页
参考文献第108-116页
攻博期间的科研成果第116-117页
致谢第117页

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