水稻基因组序列分析及比较基因组研究



水稻基因组序列分析及比较基因组研究

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水稻基因组序列分析及比较基因组研究

论文目录
中文摘要	第1-9 页
第一章水稻基因组概况	第9-13 页
一、基因组研究的历史与现状	第9-11 页
二、水稻基因组概况	第11-12 页
三、水稻第四号染色体的测序情况	第12-13 页
第二章水稻基因组序列分析	第13-50 页
一、概述	第13-15 页
二、核苷酸层次的序列分析	第15-31 页
1、真核基因的组成元件	第15-18 页
2、基因预测软件	第18-22 页
3、 EST数据分析	第22-24 页
4、非编码RNA基因的分析	第24-26 页
5、基因组重复序列的分析	第26-29 页
6、识别基因组数据中的错误	第29-30 页
7、识别假基因	第30-31 页
8、其它问题	第31 页
三、蛋白质层次的序列分析	第31-38 页
1、蛋白质的结构分析与功能预测	第32-35 页
2、蛋白质同源检索中的常见问题	第35-36 页
3、基因家族分析	第36-38 页
四、代谢调控过程层次的序列分析	第38-39 页
五、序列自动分析平台	第39-41 页
六、水稻四号染色体序列分析的基本结论	第41-43 页
七、基因组组成的复杂性：一点经验	第43-45 页
1、 “幽灵”外显子	第43-44 页
2、一个RNA基因	第44-45 页
八、粳稻、籼稻的比较基因组研究	第45-50 页
1、概述	第45-46 页
2、结果与分析	第46-50 页
第三章高等植物同源基因间外显子长度的保守性	第50-64 页
一、概述	第50 页
二、外显子长度的保守性：两个例子	第50-55 页
1、一个蛋白激酶基因家族	第51-52 页
2、周期蛋白依赖的蛋白激酶（CDKs）	第52-55 页
三、外显子长度的保守性：内容与适用范围	第55-57 页
四、外显子长度的保守性：应用	第57-64 页
1、基因结构预测	第57-58 页
2、翻译起始位点判断	第58-59 页
3、 Retroposons的鉴定	第59-60 页
4、预测基因功能和基因家族的进化路线	第60-64 页
第四章拟南芥全基因组Retroposons的鉴定与分析	第64-76 页
一、概述	第64-65 页
二、实验方法	第65-67 页
三、结果与分析	第67-76 页
第五章水稻与拟南芥的比较基因组研究	第76-84 页
一、通过比较解释差异	第76-78 页
二、通过比较揭示共性	第78-79 页
三、关于拟南芥Superroot突变体的功能预测	第79-84 页
结束语	第84-87 页
参考文献	第87-99 页
致谢	第99-100 页
发表文章	第100 页

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