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作物缺磷和菌根信号转导途径中调控基因的鉴定与功能验证

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作物缺磷和菌根信号转导途径中调控基因的鉴定与功能验证
论文目录
 
摘要第1-11页
ABSTRACT第11-14页
英文缩略符及其中英文对照表第14-16页
第一章 文献综述第16-32页
  1 缺磷信号转导途径相关基因第16-30页
    · 转录因子基因第16-21页
    · PHF1第21页
    · AtSIZ1第21-22页
    · microRNA第22-25页
    · TPSI1-Mt4,At4/IPS1第25-26页
    · PHO第26页
    · SPX家族第26-30页
  2 菌根共生信号转导途径相关基因第30-31页
  3 结语第31-32页
第二章 研究方案及技术路线第32-34页
第三章 烟草中miRNA的生物信息学预测第34-44页
  1 引言第34-35页
  2 材料与方法第35-36页
    · 生物材料第35页
    · 烟草GSS和EST序列及植物中已知miRNA成熟片段序列的获得第35页
    · 烟草中保守miRNA的预测第35-36页
    · 烟草缺磷处理第36页
  3 结果与分析第36-41页
    · 所预测miRNA各家族成员数统计第36-37页
    · 所预测miRNA成熟片段及前体长度分布第37-38页
    · 所预测miRNA特征参数统计第38-39页
    · 部分miRNA二级结构折叠第39-40页
    · 烟草miRNA399和miRNA827家族部分成员表达模式研究第40-41页
  4 讨论第41-44页
第四章 缺磷和菌根侵染条件下番茄中miRNA表达谱的芯片分析及验证第44-56页
  1 引言第44-45页
  2 材料与方法第45-46页
    · 生物材料第45页
    · 番茄缺磷和菌根侵染处理第45页
    · 采样第45页
    · 菌根真菌侵染率的测定第45页
    · miRNA芯片制作及数据处理第45-46页
    · RNA提取及poly(A)-tailed RT-PCR分析第46页
  3 结果与分析第46-52页
    · 加磷、缺磷及缺磷加菌根三种处理材料的检测第46-47页
    · miRNA芯片结果筛选第47-48页
    · miRNA芯片结果的验证第48-50页
    · 差异表达miRNA靶基因的生物信息学预测及功能分类第50-52页
  4 讨论第52-56页
第五章 缺磷诱导OsmiR827a及其靶基因的生物信息学和表达模式分析第56-74页
  1 引言第56页
  2 材料与方法第56-60页
    · 生物材料第56-57页
    · OsmiR827a靶基因的预测第57页
    · OsSPX7和OsSPX8氨基酸序列及结构域分析第57页
    · 水稻和拟南芥中SPX家族成员进化树分析第57页
    · OsSPX7、OsSPX8及部分SPX家族其它成员亚细胞定位分析第57页
    · RT-PCR检测分析第57-58页
    · OsmiR827a、OsSPX7和OsSPX8启动子序列分析第58页
    · 农杆菌介导的水稻转基因第58-60页
    · GUS报告基因的检测第60页
  3 结果与分析第60-70页
    · miR827成熟片段在不同物种间的保守性分析第60-61页
    · OsmiR827a靶基因的预测及分析第61-66页
    · 缺磷信号对OsmiR827a、OsSPX7和OsSPX8表达的影响第66-68页
    · OsmiR827a、OsSPX7和OsSPX8启动子及组织定位分析第68-70页
  4 讨论第70-74页
第六章 OsmiR827a及其靶基因的功能研究第74-88页
  1 引言第74-75页
  2 材料与方法第75页
    · 生物材料第75页
    · 农杆菌介导的水稻转基因第75页
    · 植物有效磷浓度的测定第75页
    · RT-PCR检测分析第75页
  3 结果与分析第75-85页
    · OsmiR827a过量表达植株的获得和鉴定第75-76页
    · OsSPX7和OsSPX8突变纯合体的鉴定第76-77页
    · OsSPX7和OsSPX8突变纯合体敲除效果的检测第77-78页
    · OsSPX7和OsSPX8突变体在不同供磷处理下的表型分析第78-81页
    · OsSPX7和OsSPX8突变体在不同供憐处理下有效確浓度的变化第81-83页
    · OsSPX7和OsSPX8突变对缺磷信号转导途径中其它基因转录水平表达的影响第83-85页
    · OsPHR2对OsmiR827a的调控分析第85页
  4 讨论第85-88页
第七章 番茄和烟草PHT1;4基因启动子功能区域分析第88-100页
  1 引言第88-89页
  2 材料与方法第89-90页
    · 生物材料第89页
    · 重叠延伸PCR第89页
    · 烟草转基因操作第89-90页
    · 凝胶阻滞实验第90页
  3 结果与分析第90-98页
    · LePT4启动子序列分析第90-91页
    · LePT4启动子分割及定点突变第91-93页
    · 不同长度及定点突变LePT4启动子组织特异活性分析第93-94页
    · NtPT4启动子片段与核蛋白体外结合活性分析第94-97页
    · 顺式调控元件P1BS在NtPT4响应菌根信号过程中功能解析第97-98页
  4 讨论第98-100页
第八章 烟草缺磷和菌根信号途径转录因子基因NtPHR2和NtMYCF1的克隆、分析及表达模式研究第100-110页
  1 引言第100页
  2 材料与方法第100-102页
    · 生物材料第100页
    · cDNA全长扩增第100-101页
    · MYB-CC家族成员进化树分析第101页
    · 基因枪轰击洋葱表皮的亚细胞定位实验第101页
      · 金粉的清洗第101页
      · DNA质粒包埋金粉第101页
      · 荧光显微镜观察第101页
    · 酵母双杂交实验第101-102页
  3 结果与分析第102-107页
    · 烟草中PHR同源基因cDNA全长的克隆及序列、进化树分析第102-103页
    · NtMYCF1和NtPHR2亚细胞定位分析第103-104页
    · NtMYCF1和NtPHR2在缺磷及菌根共生条件下的表达模式分析第104-105页
    · NtMYCF1和NtPHR2在蛋白水平互作分析第105-107页
  4 讨论第107-110页
全文结论第110-112页
创新点第112-114页
参考文献第114-130页
附录第130-154页
在读期间发表的论文第154-156页
致谢第156-157 页

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