论文目录 | |
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 1 绪论 | 第12-26页 |
| 1.1 研究的背景与意义 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-20页 |
| 1.2.1 窖水水质污染特征及其微生物多样性研究现状 | 第13-16页 |
| 1.2.2 微生物群落结构多样性研究中测序策略的选择 | 第16-18页 |
| 1.2.3 微生物群落结构多样性研究及其发展动态 | 第18-19页 |
| 1.2.4 微生物群落功能多样性研究及其发展动态 | 第19-20页 |
| 1.3 微生物群落结构与功能多样性研究方法及其发展动态 | 第20-23页 |
| 1.3.1 微生物群落结构多样性研究方法及其发展动态 | 第20-21页 |
| 1.3.2 微生物群落功能多样性研究方法及其发展动态 | 第21-23页 |
| 1.4 研究的总体思路 | 第23-26页 |
| 1.4.1 研究目的 | 第23页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第23-24页 |
| 1.4.3 关键科学问题 | 第24页 |
| 1.4.4 技术路线 | 第24-26页 |
| 2 样品处理及测定方法 | 第26-33页 |
| 2.1 水样采集及主要物理化学指标 | 第26-27页 |
| 2.1.1 取样点选择及取样频次 | 第26-27页 |
| 2.1.2 表征窖水水质污染状况的物理化学指标的选择 | 第27页 |
| 2.2 窖水水样微生物DNA样本提取与质量检测 | 第27-29页 |
| 2.3 16Sr RNA高变区PCR扩增、产物回收和纯化及文库构建 | 第29-31页 |
| 2.4 上机测序 | 第31页 |
| 2.5 Illumina MiSeq测序数据预处理 | 第31-32页 |
| 2.6 高通量测序数据生物信息学分析 | 第32-33页 |
| 3 水窖生态环境特征及其水质变化过程 | 第33-43页 |
| 3.1 引言 | 第33页 |
| 3.2 材料与方法 | 第33-34页 |
| 3.3 结果与分析 | 第34-41页 |
| 3.3.1 水窖生态环境特征 | 第34-35页 |
| 3.3.2 窖水水质污染特征及主要污染因子识别 | 第35-41页 |
| 3.4 小结 | 第41-43页 |
| 4 窖水中细菌群落多样性的季节性变化特征分析 | 第43-60页 |
| 4.1 引言 | 第43页 |
| 4.2 材料与方法 | 第43-44页 |
| 4.2.1 OTU聚类分析、注释及分类地位鉴定 | 第43-44页 |
| 4.2.2 微生物多样性分析 | 第44页 |
| 4.3 结果与分析 | 第44-58页 |
| 4.3.1 OTU分类地位鉴定 | 第44-46页 |
| 4.3.2 样品细菌群落OTU分析 | 第46-48页 |
| 4.3.3 α 多样性分析 | 第48-52页 |
| 4.3.4 β 多样性分析 | 第52-58页 |
| 4.4 讨论 | 第58页 |
| 4.5 小结 | 第58-60页 |
| 5 窖水细菌群落结构的季节性变化特征 | 第60-84页 |
| 5.1 引言 | 第60页 |
| 5.2 材料与方法 | 第60页 |
| 5.3 结果与分析 | 第60-80页 |
| 5.3.1 细菌群落在门分类水平上的季节性变化特征 | 第60-64页 |
| 5.3.2 细菌群落在纲分类水平上的季节性变化特征 | 第61-67页 |
| 5.3.3 细菌群落在目分类水平上的季节性变化特征 | 第67-72页 |
| 5.3.4 细菌群落在科分类水平上的季节性变化特征 | 第72-76页 |
| 5.3.5 细菌群落在属分类水平上的季节性变化特征 | 第76-80页 |
| 5.4 讨论 | 第80-82页 |
| 5.5 小结 | 第82-84页 |
| 6 窖水中细菌群落功能基因的季节性变化特征 | 第84-102页 |
| 6.1 引言 | 第84页 |
| 6.2 材料与方法 | 第84-85页 |
| 6.3 结果与分析 | 第85-100页 |
| 6.3.1 细菌群落碳的代谢功能基因分布特征 | 第85-91页 |
| 6.3.2 细菌群落氮的代谢功能基因分布特征 | 第91-95页 |
| 6.3.3 细菌群落磷的代谢功能基因分布特征 | 第95-100页 |
| 6.4 讨论 | 第100页 |
| 6.5 小结 | 第100-102页 |
| 7 窖水中细菌群落与水质因子的交互响应 | 第102-132页 |
| 7.1 引言 | 第102页 |
| 7.2 材料与方法 | 第102-103页 |
| 7.3 结果与分析 | 第103-126页 |
| 7.3.1 门分类水平上的细菌群落与水质因子的交互响应 | 第103-105页 |
| 7.3.2 纲分类水平上的细菌群落与水质因子的交互响应 | 第105-108页 |
| 7.3.3 目分类水平上的细菌群落与水质因子的交互响应 | 第108-113页 |
| 7.3.4 科分类水平上的细菌群落与水质因子的交互响应 | 第113-118页 |
| 7.3.5 属分类水平上的细菌群落与水质因子的交互响应 | 第118-126页 |
| 7.4 讨论 | 第126-129页 |
| 7.4.1 微生物群落共现性关联网络 | 第126页 |
| 7.4.2 细菌之间、细菌与水质因子间的交互作用机理的探讨 | 第126-129页 |
| 7.5 小结 | 第129-132页 |
| 结论与展望 | 第132-135页 |
| 结论 | 第132-134页 |
| 主要创新点 | 第134页 |
| 展望 | 第134-135页 |
| 致谢 | 第135-136页 |
| 参考文献 | 第136-150页 |
| 附录A 附录内容名称 | 第150-170页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第170-171页 |
