论文目录 | |
| 中文摘要 | 第1-10
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| 英文摘要 | 第10-16
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| 第一章 文献综述 | 第16-52
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| 1 分子系统学 | 第16-27
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| · 生物分类观念与方法的演变 | 第16
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| · 分子生物学技术与系统分类学的融合 | 第16-18
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| · 分子系统学研究进展 | 第18-27
页 |
| · 分子序列数据的特点 | 第18-19
页 |
| · 系统发育重建 | 第19-25
页 |
| · 分子钟与分歧时间估算 | 第25-27
页 |
| 2 生物地理学 | 第27-30
页 |
| · 生物地理学的发展 | 第27-29
页 |
| · 历史生物地理学的分析方法 | 第29-30
页 |
| · 祖先分布区的重建:DIVA简介 | 第30
页 |
| 3 骨鳔鱼类的系统学研究进展 | 第30-33
页 |
| 4 snoRNA与U17 snoRNA研究进展 | 第33-38
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| · snoRNA的结构与功能 | 第33-34
页 |
| · 脊椎动物U17 snoRNA的结构、进化与系统发育意义 | 第34-38
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| 5 本研究的目的意义 | 第38-52
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| 第二章 U17 snoRNA基因序列变异与骨鳔鱼类分子系统发育及分化时间估算 | 第52-92
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| 1 引言 | 第52-54
页 |
| 2 材料与方法 | 第54-65
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| · 标本采集与实验样品 | 第54
页 |
| · 实验器材 | 第54-55
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| · 实验步骤 | 第55-61
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| · 基因组DNA的提取及检测 | 第55-58
页 |
| · PCR扩增 | 第58-59
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| · PCR产物回收 | 第59
页 |
| · 目的DNA克隆 | 第59-61
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| · 基因测序 | 第61
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| · 数据分析 | 第61-65
页 |
| · 序列的比对排列 | 第61-62
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| · 序列的初步分析 | 第62-63
页 |
| · 系统发育分析 | 第63-64
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| · 分歧时间估算 | 第64-65
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| 3 结果 | 第65-69
页 |
| · 序列变异及二级结构特征 | 第65-66
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| · 系统发育关系 | 第66-68
页 |
| · 分歧时间估算 | 第68-69
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| 4 讨论 | 第69-92
页 |
| · U17 snoRNA基因序列变异及其系统发育意义 | 第69-70
页 |
| · 骨鳔鱼类的系统发育关系 | 第70-71
页 |
| · 化石记录与分化时间 | 第71-92
页 |
| 第三章 基于RAG1和RAG2基因序列的耳鳔鱼类分子系统发育与分化时间估算 | 第92-132
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| 1 引言 | 第92-93
页 |
| 2 材料与方法 | 第93-97
页 |
| · 标本采集与实验样品 | 第93
页 |
| · 基因组DNA的提取、PCR扩增与克隆测序 | 第93
页 |
| · 数据分析 | 第93-97
页 |
| · 序列的比对排列 | 第93-94
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| · 序列的初步分析 | 第94
页 |
| · 系统发育分析 | 第94-96
页 |
| · 分歧时间估算 | 第96-97
页 |
| 3 结果 | 第97-102
页 |
| · 序列变异 | 第97-99
页 |
| · RAG1基因序列 | 第97-98
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| · RAG2基因序列 | 第98-99
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| · 耳鳔系鱼类系统发育关系 | 第99-101
页 |
| · RAG1基因 | 第99-100
页 |
| · RAG2基因 | 第100-101
页 |
| · 分歧时间估算 | 第101-102
页 |
| · RAG1基因 | 第101
页 |
| · RAG2基因 | 第101-102
页 |
| 4 讨论 | 第102-132
页 |
| · 基因序列变异及其系统发育意义 | 第102-103
页 |
| · 耳鳔系鱼类的系统发育关系 | 第103
页 |
| · 分歧时间估计的可靠性及意义 | 第103-132
页 |
| 第四章 S7 核糖体基因内含子6序列变异与鲤形目鱼类分子系统发育及分化时间估算 | 第132-159
页 |
| 1 引言 | 第132-134
页 |
| 2 材料与方法 | 第134-138
页 |
| · 标本采集与实验样品 | 第134-135
页 |
| · 基因组DNA提取、PCR扩增与克隆测序 | 第135
页 |
| · 数据分析 | 第135-138
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| · 序列的比对排列 | 第135
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| · 序列的初步分析 | 第135-136
页 |
| · 系统发育分析 | 第136-137
页 |
| · 分歧时间估算 | 第137-138
页 |
| 3 结果 | 第138-141
页 |
| · rpS7 intron6 序列变异 | 第138-139
页 |
| · 鲤形目鱼类的系统发育关系 | 第139-141
页 |
| · 分歧时间估算 | 第141
页 |
| 4 讨论 | 第141-159
页 |
| · rpS7 intron6 序列变异及其系统发育意义 | 第141-142
页 |
| · 鲤形目鱼类的系统发育关系 | 第142-159
页 |
| 第五章运用cyt b和165 rRNA基因序列重建鮡科鱼类的系统发育和历史生物地理学 | 第159-191
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| 1 引言 | 第159-162
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| 2 材料与方法 | 第162-166
页 |
| · 样品采集 | 第162
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| · 基因组DNA的提取、PCR扩增与测序 | 第162-163
页 |
| · 数据分析 | 第163-165
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| · 序列的比对排列 | 第163
页 |
| · 序列的初步分析 | 第163
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| · 系统发育分析 | 第163-164
页 |
| · 分歧时间估算 | 第164-165
页 |
| · 初级BPA、DIVA和WAAA分析 | 第165-166
页 |
| 3 结果 | 第166-169
页 |
| · 序列变异 | 第166
页 |
| · cyt b 基因序列 | 第166
页 |
| · 16S rRNA基因序列 | 第166
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| · 鮡科鱼类的系统发育关系 | 第166-167
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| · 分歧时间估算 | 第167-168
页 |
| · 历史生物地理学 | 第168-169
页 |
| 4 讨论 | 第169-191
页 |
| · 鮡科鱼类的系统发育关系 | 第169-170
页 |
| · 鮡科鱼类的历史生物地理学过程 | 第170-191
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| 参考文献 | 第191-212
页 |
| 攻读博士学位期间发表论文 | 第212-213
页 |
| 致谢 | 第213-215
页 |
| 附录Ⅰ地质时间表 | 第215-216
页 |
| 附录Ⅱ分子系统发育与进化相关大事简表 | 第216-223
页 |
| 附录Ⅲ个人简历 | 第223
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