论文目录 | |
前言 | 第1-5页 |
中文摘要 | 第5-12页 |
Abstract | 第12-23页 |
第1章 绪论 | 第23-75页 |
1.1 高通量测序技术的发展、原理及展望 | 第23-51页 |
1.1.1 高通量测序技术的发展应用 | 第24-31页 |
1.1.2 高通量测序技术的工作原理及技术特点 | 第31-43页 |
1.1.3 高通量测序技术未来展望:三代测序 | 第43-51页 |
1.2 目标捕获测序技术 | 第51-64页 |
1.2.1 目标捕获测序技术检测范围及商品化panel | 第52-55页 |
1.2.2 目标捕获原理 | 第55-60页 |
1.2.3 目标捕获方法技术特点及选择策略 | 第60-64页 |
1.3 非梗阻性无精子症相关基因SNP关联分析现状 | 第64-75页 |
1.3.1 SNV检测方法 | 第66-68页 |
1.3.2 NOA相关SNP关联研究文献回顾 | 第68-75页 |
第2章 材料和方法 | 第75-93页 |
2.1 主要实验仪器 | 第75-76页 |
2.2 主要实验试剂(盒) | 第76-78页 |
2.2.1 主要订购实验试剂(盒) | 第76-77页 |
2.2.2 主要配制实验试剂 | 第77-78页 |
2.3 研究对象纳入和候选基因筛选 | 第78-79页 |
2.3.1 NOA组受试患者纳入 | 第78页 |
2.3.2 对照组受试者纳入 | 第78页 |
2.3.3 筛选目标区域捕获测序NOA相关基因 | 第78-79页 |
2.4 实验方法 | 第79-93页 |
2.4.1 相关基本信息收集和临床指标检测 | 第79-82页 |
2.4.2 目标区域捕获测 | 第82-87页 |
2.4.3 Case-Control study及统计分析方法 | 第87-93页 |
第3章 结果 | 第93-129页 |
3.1 研究对象基本信息和NOA相关临床指标 | 第93-94页 |
3.2 目标区域捕获测序检测结果 | 第94-98页 |
3.2.1 目标区域捕获测序产出数据质量检测 | 第94-96页 |
3.2.2 目标区域捕获测序检测结果 | 第96-98页 |
3.3 目标区域捕获测序检出SNV变异与NOA关联研究 | 第98-109页 |
3.3.1 待研究候选SNV筛选 | 第98-99页 |
3.3.2 NOA组与对照组SNV等位基因频率对比 | 第99-103页 |
3.3.3 SNV等位基因与NOA关联研究 | 第103-106页 |
3.3.4 NOA相关SNV基因型分析 | 第106-109页 |
3.4 NOA相关SNV基因型与NOA相关临床表型关联研究 | 第109-116页 |
3.4.1 NOA相关SNV基因型频率对比 | 第109-112页 |
3.4.2 NOA相关SNV基因型与临床表型相关性分析 | 第112-116页 |
3.5 NOA相关SNV单体型分析 | 第116-121页 |
3.5.1 1号染色体相关SNV单体型分析 | 第116-117页 |
3.5.2 5号染色体相关SNV单体型分析 | 第117-118页 |
3.5.3 6号染色体相关SNV单体型分析 | 第118-120页 |
3.5.4 17号染色体相关SNV单体型分析 | 第120-121页 |
3.6 NOA相关SNV library构建 | 第121-129页 |
3.6.1 贝勒流程筛选候选SNM | 第121-122页 |
3.6.2 筛选对照组内等位基因频率为0的SNM | 第122页 |
3.6.3 SNV library构成、数据库分布及变异效果统计比较 | 第122-129页 |
第4章 讨论 | 第129-141页 |
4.1 年龄对精子发生的影响 | 第129-131页 |
4.2 目标区域捕获结合高通量测序检测结果分析 | 第131-134页 |
4.2.1 关于目标NOA相关基因的讨论 | 第131-132页 |
4.2.2 关于目标区域捕获结合高通量测序产出数据质量的讨论 | 第132-133页 |
4.2.3 关于目标区域捕获结合高通量测序结果的讨论 | 第133-134页 |
4.3 NOA相关SNV关联研究结果分析 | 第134-140页 |
4.3.1 关于哈迪温伯格平衡的讨论 | 第134-136页 |
4.3.2 关于Bonferroni校正的讨论 | 第136页 |
4.3.3 关于NOA相关SNV及所在基因的讨论 | 第136-140页 |
4.4 关于贝勒流程的讨论 | 第140-141页 |
第5章 结论 | 第141-143页 |
创新点及实际应用价值 | 第143-145页 |
参考文献 | 第145-159页 |
附录1-目标区域捕获测序NOA相关基因列表 | 第159-170页 |
附录2-患者基本信息问询表 | 第170-171页 |
附录3-医生查体记录表 | 第171-172页 |
作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第172-174页 |
致谢 | 第174页 |