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水稻白叶枯菌抗性相关基因R1×4选择性剪接机制及功能初探

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水稻白叶枯菌抗性相关基因R1×4选择性剪接机制及功能初探
论文目录
 
中文摘要第1-9页
英文摘要第9-11页
综述 植物抗病性与植物基因剪接研究进展第11-28页
1 植物抗病性的研究领域第11-12页
2 植物基因的剪接第12-23页
2.1 内含子的类型第13-16页
2.2 参与RNA剪接的蛋白第16-17页
2.3 选择性剪接及其的生理功能第17-22页
2.4 基因剪接研究展望第22-23页
2.5 与基因剪接相关的网站第23页
3 本课题的引出第23-24页
第24-28页
第一节 RIX4基因剪接多样性及表达谱分析第28-40页
1 材料和方法第28-31页
1.1 材料第28页
1.2 方法第28-31页
1.2.1 cDNA末端快速扩增(RACE)第28-29页
1.2.2 M-EST芯片杂交分离获得RIX4基因另一转录本片段第29-30页
1.2.3 新转录本全长的获得第30页
1.2.4 RIX4基因其它多转录本的搜索第30页
1.2.5 RIX4基因的表达特性分析第30页
1.2.6 RIX4基因DNA的克隆第30-31页
1.2.7 RIX4基因DNA序列拼接第31页
2 结果与分析第31-33页
2.1 RACE结果第31页
2.2 M-EST芯片杂交结果第31-32页
2.3 RIX4-41转录本全长cDNA的获得第32页
2.4 RIX4基因其它转录本的搜索第32页
2.5 RIX4基因在不同品种不同处理水稻中的表达第32页
2.6 RIX4基因DNA全长的克隆第32页
2.7 RIX4基因DNA序列测定及其与cDNA的比对分析第32-33页
3 讨论第33-35页
3.1 基因剪接的普遍性极其作用第33页
3.2 多转录本基因的表达检测第33-34页
3.3 关于M-EST第34-35页
小结第35-36页
第36-40页
第二节 RIX4基因序列选择性剪接分析及其生物信息学功能预测第40-53页
1 材料和方法第40页
2 结果和分析第40-44页
2.1 RIX4基因DNA序列与cDNA的比对分析第40-41页
2.2 B1、B2、B3转录本剪接位点分析第41页
2.3 RIX4与RIX4-4I序列比较第41页
2.4 转录本RIX4与RIX4-4I的生物信息学功能预测与分析第41-44页
2.4.1 RIX4及RIX4-4I的氨基酸序列第41页
2.4.2 RIX4及RIX4-4I蛋白的基本特征第41-42页
2.4.3 RIX4和RIX4-4I跨膜结构分析第42页
2.4.4 RIX4和RIX4-4I蛋白的定位分析第42-43页
2.4.5 RIX4和RIX4-4I的二级结构分析第43页
2.4.6 蛋白的同源性搜索第43-44页
3 讨论第44-47页
3.1 关于RIX4基因DNA序列第44页
3.2 关于B1、B2、B3转录本的选择性剪接位点第44-45页
3.3 关于RIX4-4I的未去除的内含子第45-46页
3.4 关于对RIX4基因蛋白功能预测第46-47页
小结第47-48页
第48-53页
第三节 RIX4基因的图谱定位第53-58页
1 材料和方法第53-54页
1.1 水稻材料第53页
1.2 RFLP定位第53-54页
2 结果与分析第54-55页
2.1 RIX4基因定位第54-55页
2.1.1 RIX4基因在群体亲本间的RFLP多态性第54页
2.1.2 RIX4基因的定位第54-55页
小结第55-56页
第56-58页
第四节 RIX4基因的水稻转化研究第58-74页
1 实验材料第58页
2 实验方法第58-62页
2.1 正义与反义表达的植物转化载体构建第58-59页
2.2 水稻转化第59-60页
2.3 双元载体导入农杆菌及酶切鉴定第60页
2.4 转化农杆菌后质粒鉴定第60页
2.5 水稻幼胚愈伤组织的诱导第60页
2.6 根癌农杆菌的培养及水稻的转化第60-61页
2.7 转基因株T_0代的结实率统计第61页
2.8 转基因株的鉴定第61-62页
2.8.1 转基因水稻植株总DNA提取第61页
2.8.2 转基因植株的PCR分析第61-62页
3 结果与分析第62-65页
3.1 转基因载体的构建第62页
3.2 pCAM-RIX4-2及pCAM-RIX4-13转化农杆菌EHA105并酶切鉴定第62-63页
3.3 农杆菌法转化水稻幼胚愈伤组织及植株的再生第63-64页
3.4 RIX4正义与反义转基因株的PCR鉴定第64-65页
3.5 转基因植株的结实率分析第65页
4 讨论第65-66页
小结第66-67页
第67-74页
第五节 白叶枯菌诱导水稻基因表达的微阵列分析第74-85页
1 材料与方法第74-75页
1.1 材料第74页
1.2 方法第74-75页
1.2.1 总RNA提取及样品中DNA污染的去除第74页
1.2.2 探针的国位素标记第74页
1.2.3 cDNA微阵列制备第74-75页
1.2.4 微阵列杂交和数据提取第75页
2 结果与分析第75-76页
2.1 微阵列杂交结果的重复性第75页
2.2 表达谱分析第75-76页
2.3 抗病及信号传导相关基因表达差异第76页
3 讨论第76-79页
3.1 差异表达的已知功能基因中与植物抗病关系不确定的基因第76-77页
3.2 差异表达的未知功能基因及已知ESTs第77页
3.3 在表达谱中未表现出差异的基因第77页
3.4 水稻对白叶枯菌抗性的信号传导途径第77-78页
3.5 RIX4基因在中早14R和9S中的表达第78-79页
小结第79-80页
第80-85页
参考文献第85-95页
致谢第95页

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