论文目录 | |
致谢 | 第10-11
页 |
中文摘要 | 第11-13
页 |
英文摘要 | 第13-15
页 |
第一篇 文献综述 | 第15-48
页 |
1 双生病毒的特性与分类 | 第16-31
页 |
1.1 玉米线条病毒属(Mastrevirus) | 第16-17
页 |
1.1.1 寄主范围 | 第16
页 |
1.1.2 传播 | 第16
页 |
1.1.3 基因组结构 | 第16-17
页 |
1.1.4 症状 | 第17
页 |
1.1.5 地理分布 | 第17
页 |
1.1.6 成员 | 第17
页 |
1.2 甜菜曲顶病毒属(Curtovirus) | 第17-20
页 |
1.2.1 寄主范围 | 第17-18
页 |
1.2.2 传播 | 第18
页 |
1.2.3 基因组结构 | 第18-19
页 |
1.2.4 症状 | 第19
页 |
1.2.5 地理分布 | 第19
页 |
1.2.6 成员 | 第19-20
页 |
1.3 番茄伪曲顶病毒属(Topocuvirus) | 第20-21
页 |
1.3.1 寄主范围 | 第20
页 |
1.3.2 传播 | 第20
页 |
1.3.3 基因组结构 | 第20
页 |
1.3.4 症状 | 第20
页 |
1.3.5 地理分布 | 第20
页 |
1.3.6 成员 | 第20-21
页 |
1.4 菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus) | 第21-31
页 |
1.4.1 寄主范围 | 第21
页 |
1.4.2 传播 | 第21
页 |
1.4.3 基因组结构 | 第21-24
页 |
1.4.4 症状 | 第24
页 |
1.4.5 地理分布 | 第24
页 |
1.4.6 抗原特性 | 第24
页 |
1.4.7 细胞病理学 | 第24-25
页 |
1.4.8 成员 | 第25-31
页 |
2 双生病毒的复制和转录 | 第31-35
页 |
2.1 双生病毒的复制 | 第31-33
页 |
2.2 双生病毒的转录 | 第33-35
页 |
3 双生病毒的运动 | 第35-38
页 |
3.1 组份双生病毒的运动 | 第35-36
页 |
3.2 单组份双生病毒的运动 | 第36-38
页 |
4 双生病毒基因组变异 | 第38-42
页 |
4.1 突变 | 第38-39
页 |
4.2 获取外源DNA | 第39-40
页 |
4.3 假重组(Pseudo-Recombination) | 第40
页 |
4.4 重组 | 第40-42
页 |
4.4.1 属间重组 | 第40-41
页 |
4.4.2 Begomovimses属内重组 | 第41-42
页 |
5 与双生病毒伴随的小分子DNA | 第42-48
页 |
5.1 缺陷型小分子DNA | 第42-43
页 |
5.2 DNA1分子的发现 | 第43-44
页 |
5.3 DNAβ分子 | 第44-48
页 |
第二篇 研究内容 | 第48-151
页 |
第一章 材料与方法 | 第48-56
页 |
1 材料 | 第48
页 |
1.1 病毒 | 第48
页 |
1.2 抗血清 | 第48
页 |
1.3 常用化学试剂分子生物学试剂及仪器 | 第48
页 |
1.4 常用缓冲液的配制 | 第48
页 |
2 方法 | 第48-56
页 |
2.1 植物总DNA提取 | 第48
页 |
2.2 粉虱传毒试验 | 第48
页 |
2.3 粒子形态观察 | 第48
页 |
2.4 三抗体夹心ELISA (TAS-ELISA)测定 | 第48-49
页 |
2.5 免疫捕获PCR | 第49
页 |
2.6 PCR反应 | 第49-50
页 |
2.6.1 反应体系 | 第49
页 |
2.6.2 反应参数设置 | 第49-50
页 |
2.7 割胶回收 | 第50-51
页 |
2.8 DNA克隆技术 | 第51-54
页 |
2.8.1 连接方法 | 第51
页 |
2.8.2 感受态细胞制备方法 | 第51-52
页 |
2.8.3 转化 | 第52
页 |
2.8.4 重组克隆的筛选 | 第52-53
页 |
2.8.5 重组质粒PCR鉴定 | 第53
页 |
2.8.6 重组质粒的提取和纯化 | 第53-54
页 |
2.9 测序 | 第54
页 |
2.10 Southern blot分析 | 第54-56
页 |
2.10.1 电泳及转膜 | 第54
页 |
2.10.2 探针标记(用Promega Prime-a-Gene DNA Label kit) | 第54-55
页 |
2.10.3 杂交 | 第55-56
页 |
第二章 粉虱传双生病毒的TAS-ELISA及PCR快速检测 | 第56-61
页 |
1 材料与方法 | 第56-57
页 |
1.1 病毒 | 第56
页 |
1.2 三抗体夹心ELISA (TAS-ELISA)测定 | 第56
页 |
1.3 DNA提取及PCR扩增 | 第56-57
页 |
1.4 田间样品的TAS-ELISA及PCR检测 | 第57
页 |
2 结果与分析 | 第57-60
页 |
2.1 粉虱传双生病毒的TAS-ELISA检测 | 第57-58
页 |
2.2 粉虱传双生病毒的PCR检测 | 第58
页 |
2.3 粉虱传双生病毒的田间检测 | 第58-60
页 |
3 讨论 | 第60-61
页 |
第三章 云南烟草曲叶病毒是菜豆金色花叶病毒属的一个新种 | 第61-70
页 |
1 材料 | 第61
页 |
1.1 病毒 | 第61
页 |
1.2 抗血清 | 第61
页 |
2 方法 | 第61-63
页 |
2.1 植物总DNA提取 | 第61
页 |
2.2 粉虱传毒试验 | 第61
页 |
2.3 粒子形态观察 | 第61-62
页 |
2.4 三抗体夹心ELISA (TAS-ELISA)测定 | 第62
页 |
2.5 引物设计及序列 | 第62
页 |
2.6 序列分析 | 第62-63
页 |
3 结果与分析 | 第63-69
页 |
3.1 病毒病症状及粒子形态 | 第63
页 |
3.2 病毒粒子形态 | 第63-64
页 |
3.3 抗原表位型比较 | 第64-65
页 |
3.4 病毒基因组DNA-A结构 | 第65-66
页 |
3.5 Y3与其它双生病毒的比较 | 第66-67
页 |
3.6 Y3与其它双生病毒的分子进化分析 | 第67-69
页 |
4 讨论 | 第69-70
页 |
第四章 烟草曲茎病毒是菜豆金色花叶病毒属的一个新种 | 第70-80
页 |
1 材料 | 第70-71
页 |
1.1 病毒 | 第70
页 |
1.2 抗血清 | 第70-71
页 |
2 方法 | 第71-72
页 |
2.1 植物总DNA提取 | 第71
页 |
2.2 粉虱传毒试验 | 第71
页 |
2.3 粒子形态观察 | 第71
页 |
2.4 三抗体夹心ELISA (TAS-ELISA)测定 | 第71
页 |
2.5 引物设计及序列 | 第71-72
页 |
2.6 序列分析 | 第72
页 |
3 结果与分析 | 第72-78
页 |
3.1 病毒病症状及粒子形态 | 第72-73
页 |
3.2 抗原表位型比较 | 第73-74
页 |
3.3 病毒基因组DNA-A结构 | 第74-75
页 |
3.4 Y1与其它双生病毒的比较 | 第75-77
页 |
3.5 Y1与其它双生病毒DNA-A的分子进化分析 | 第77-78
页 |
4 讨论 | 第78-80
页 |
第五章 与烟草曲茎病毒伴随的缺陷干扰型DNA分子鉴定 | 第80-87
页 |
1 材料 | 第80
页 |
1.1 病毒 | 第80
页 |
1.2 抗血清 | 第80
页 |
2 方法 | 第80-81
页 |
2.1 免疫捕获PCR | 第80-81
页 |
2.2 PCR | 第81
页 |
2.3 Southern blot分析 | 第81
页 |
3 结果与分析 | 第81-85
页 |
3.1 小分子DNA的发现 | 第81-82
页 |
3.2 小分子DNA的分子鉴定 | 第82-84
页 |
3.3 小分子DNA由病毒粒子包裹 | 第84
页 |
3.4 小分子DNA由粉虱传播 | 第84-85
页 |
4 讨论 | 第85-87
页 |
第六章 与烟草曲茎病毒伴随的卫星DNA的鉴定及其基因组特征 | 第87-96
页 |
1 材料与方法 | 第87-89
页 |
1.1 病毒 | 第87
页 |
1.2 总DNA提取 | 第87
页 |
1.3 PCR扩增 | 第87-88
页 |
1.4 克隆 | 第88
页 |
1.5 测序及序列分析 | 第88
页 |
1.6 免疫捕获PCR(Immunotrapping PCR,IT-PCR) | 第88
页 |
1.7 粉虱传毒实验 | 第88-89
页 |
2 结果与分析 | 第89-94
页 |
2.1 Y35是烟草曲茎病毒的一个分离物 | 第89
页 |
2.2 TbCSV DNA β分子的鉴定 | 第89-90
页 |
2.3 烟草曲茎病毒DNA β结构 | 第90-91
页 |
2.4 烟草曲茎病毒DNA β与其它双生病毒DNA β的比较 | 第91-92
页 |
2.5 烟草曲茎病毒DNA β的分子进化分析 | 第92
页 |
2.6 DNA β由烟草曲茎病毒包裹,且由烟粉虱传播 | 第92-94
页 |
3 讨论 | 第94-96
页 |
第七章 云南南瓜曲叶病毒是一种由重组产生的双生病毒新种 | 第96-105
页 |
1 材料与方法 | 第96-98
页 |
1.1 病毒 | 第96
页 |
1.2 抗血清 | 第96
页 |
1.3 PCR及测序引物 | 第96-97
页 |
1.4 序列分析 | 第97-98
页 |
2 结果与分析 | 第98-103
页 |
2.1 抗原表位型比较 | 第98
页 |
2.2 Y23病毒基因组DNA-A结构 | 第98-99
页 |
2.3 Y23与其它双生病毒的比较及分子进化分析 | 第99-102
页 |
2.4 Y23是重组病毒的证据 | 第102-103
页 |
3 讨论 | 第103-105
页 |
第八章 侵染烟草的中国番茄黄化曲叶病毒及其卫星DNA的基因组结构及变异 | 第105-120
页 |
1 材料和方法 | 第105-107
页 |
1.1 病毒 | 第105
页 |
1.2 抗血清 | 第105
页 |
1.3 PCR扩增、克隆及序列测定 | 第105-106
页 |
1.4 序列分析 | 第106-107
页 |
2 结果与分析 | 第107-118
页 |
2.1 病毒抗原表位型测定 | 第107-108
页 |
2.2 病毒分离物DNA-A的序列分析 | 第108-109
页 |
2.3 病毒分离物DNA-A与中国报道其它双生病毒的比较 | 第109-111
页 |
2.4 Y5、Y8、Y10、Y11、Y36和Y38DNA-A编码蛋白比较 | 第111-112
页 |
2.5 Y5、Y8、Y10、Y11、Y36和Y38基因间隔区序列比较 | 第112
页 |
2.6 病毒分离物与其它双生病毒的分子进化分析 | 第112-114
页 |
2.7 病毒伴随卫星DNA β的鉴定 | 第114
页 |
2.8 病毒伴随卫星DNA β的结构特征 | 第114-115
页 |
2.9 TYLCCNV β的同源性比较 | 第115
页 |
2.10 病毒伴随卫星DNA β与其它DNA β的同源性比较 | 第115-117
页 |
2.11 病毒伴随卫星DNA β与其它DNA β的分子进化分析 | 第117-118
页 |
3 讨论 | 第118-120
页 |
第九章 与赛葵黄脉病毒伴随的卫星DNA分子 | 第120-126
页 |
1 材料与方法 | 第120-121
页 |
1.1 病毒 | 第120
页 |
1.2 DNA提取、PCR扩增、克隆及测序 | 第120
页 |
1.3 序列分析 | 第120-121
页 |
2 结果与分析 | 第121-124
页 |
2.1 与赛葵黄脉病毒伴随的DNA β分子的鉴定 | 第121
页 |
2.2 Y47 β的结构特征 | 第121-122
页 |
2.3 Y47 β与其它DNA β的同源性比较 | 第122-123
页 |
2.4 Y47 β与其它DNA β的分子进化分析 | 第123-124
页 |
3 讨论 | 第124-126
页 |
第十章 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA β的特征及与其辅助病毒共进化的证据 | 第126-137
页 |
1 材料和方法 | 第126-128
页 |
1.1 病毒 | 第126-127
页 |
1.2 DNA提取、PCR扩增、克隆及测序 | 第127
页 |
1.3 序列分析 | 第127-128
页 |
2 结果与分析 | 第128-134
页 |
2.1 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA β分子的鉴定 | 第128
页 |
2.2 DNA β的序列分析 | 第128-129
页 |
2.3 DNA β分子的结构特征 | 第129-130
页 |
2.4 DNA β分子与其辅助病毒基因组的共进化 | 第130-134
页 |
3 讨论 | 第134-137
页 |
第十一章 与双生病毒伴随的类nanovirus分子的鉴定 | 第137-145
页 |
1 材料与方法 | 第137-138
页 |
1.1 病毒 | 第137
页 |
1.2 总DNA提取 | 第137
页 |
1.3 PCR扩增 | 第137-138
页 |
1.4 克隆 | 第138
页 |
1.5 测序及序列分析 | 第138
页 |
2 结果与分析 | 第138-141
页 |
2.1 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA1分子的鉴定 | 第138-139
页 |
2.2 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA1的序列测定 | 第139
页 |
2.3 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA1的结构特征 | 第139-140
页 |
2.4 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA1的序列分析 | 第140-141
页 |
2.5 与begomoviruses伴随的DNA1分子与nanoviruses小分子的进化分析 | 第141
页 |
2.6 与begomoviruses伴随的DNA1分子与nanoviruses小分子编码的Rep蛋白的多序列比较分析 | 第141
页 |
3 讨论 | 第141-145
页 |
第十二章 云南粉虱传双生病毒田间复合侵染检测 | 第145-151
页 |
1 材料与方法 | 第145-146
页 |
1.1 病毒 | 第145
页 |
1.2 总DNA提取 | 第145
页 |
1.3 特异引物 | 第145-146
页 |
2 结果与分析 | 第146-149
页 |
2.1 DNA-A复合侵染检测 | 第146-149
页 |
2.2 DNA β复合侵染检测 | 第149
页 |
3 讨论 | 第149-151
页 |
全文小结 | 第151-152
页 |
综述文献 | 第152-162
页 |
附录A 常用化学试剂、分子生物学试剂及仪器 | 第162-164
页 |
附录B 常用缓冲液及培养基配方 | 第164-169
页 |
附录C 博士研究生期间发表的及投稿中的学术论著 | 第169-171
页 |
附录D EMBL登录基因 | 第171-172
页 |