基于高通量测序数据的遗传调控元件识别及算法研究



基于高通量测序数据的遗传调控元件识别及算法研究

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基于高通量测序数据的遗传调控元件识别及算法研究

论文目录
摘要	第1-6页
Abstract	第6-13页
第1章绪论	第13-32页
· 课题背景及研究的目的和意义	第13-14页
· 研究现状	第14-29页
· 新一代测序技术	第15-20页
· 新一代 RNA 测序数据的处理与分析	第20-23页
· 基因转录调控机制的研究	第23-26页
· 非编码 RNA 的转录调控研究	第26-27页
· 最大似然估计	第27-29页
· 本文的主要研究内容	第29-32页
第2章等位特异表达基因识别	第32-55页
· 引言	第32-33页
· 高通量 RNA 测序数据处理及标准化	第33-34页
· 识别等位特异表达基因的最大似然算法	第34-48页
· 基因组 DNA 和 RNA 数据的等位表达分布	第34-38页
· 识别等位特异表达的最大似然统计模型	第38-41页
· 最大似然模型的参数估计	第41-42页
· 最大似然模型的假阳性控制	第42-44页
· 模拟数据的评估	第44-48页
· 最大似然模型在群体数据中的应用	第48-51页
· 等位特异表达基因解析	第51-53页
· 本章小结	第53-55页
第3章双向启动子的转录调控位点挖掘	第55-65页
· 引言	第55-56页
· 数据的获取	第56-57页
· 双向基因对的鉴定及表达相关性	第57-59页
· 双向基因对遗传调控位点的挖掘	第59-62页
· 双向基因对的转录调控模式	第62-64页
· 本章小结	第64-65页
第4章基于 RNA 测序数据挖掘非编码 RNA 的遗传调控位点	第65-77页
· 引言	第65-66页
· RNA-SEQ 数据量化PRI-MIRNA的表达	第66-67页
· PRI-MIRNA 的基因组分布	第67-69页
· 挖掘PRI-MIRNA的遗传调控位点	第69-73页
· PRI-MIRNA 及其宿主基因的调控机制	第73-76页
· 本章小结	第76-77页
第5章 SNP-DNA 甲基化的协同调控机制	第77-101页
· 引言	第77-78页
· 数据的获取及处理	第78-79页
· 数量性状位点的挖掘	第79-81页
· SNP-DNA 甲基化调控模型	第81-91页
· SNP-DNA 甲基化调控模式的构建	第81-84页
· 调控模型最大似然函数的构建	第84-86页
· 模型稳健性评估	第86-88页
· 群体数据中预测基因调控模式	第88-91页
· 功能富集分析	第91-95页
· 印记基因的 SNP-DNA 甲基化协同调控机制	第95-99页
· 本章小结	第99-101页
结论	第101-103页
参考文献	第103-115页
附录 A 个体内和群体内均显示等位特异表达的基因	第115-118页
附录 B PRI-MIRNAS 的基因组定位	第118-123页
附录 C PRI-MIRNAS 相关的全部顺式调控位点	第123-126页
攻读博士学位期间发表的论文及其它成果	第126-129页
致谢	第129-130页
个人简历	第130 页

本篇论文共130页，点击这进入下载页面。

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