野桑蚕转录组测序与正向选择基因分析



野桑蚕转录组测序与正向选择基因分析

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野桑蚕转录组测序与正向选择基因分析

论文目录
摘要	第1-9页
Abstract	第9-12页
第一章文献综述	第12-22页
· 野桑蚕特点概述	第12-15页
· 野桑蚕形态特征	第12-14页
· 野桑蚕生物学特征	第14-15页
· 物种驯化概述	第15-18页
· 驯化的定义	第15-16页
· 驯化的结果	第16-17页
· 驯化基因的分子机制	第17-18页
· 家蚕驯化的研究进展	第18-22页
· 野桑蚕与家蚕的起源	第18-19页
· 家蚕驯化机制研究进展	第19-22页
第二章引言	第22-24页
· 研究背景及目的意义	第22页
· 主要研究内容	第22-23页
· 研究技术路线	第23-24页
第三章野桑蚕转录组测序	第24-36页
· 实验材料与方法	第24-32页
· 实验材料	第24页
· 主要实验仪器	第24-25页
· 主要实验试剂	第25页
· RNA提取与质量检测	第25-26页
· 转录组测序文库构建	第26-29页
· 转录组测序文库质量控制	第29-30页
· 转录组测序文库测序	第30-32页
· 实验结果	第32-33页
· 转录组RNA提取与质量检测	第32-33页
· 转录组文库质量控制	第33页
· 讨论	第33-36页
第四章 de novo组装与基因注释及SNP鉴定	第36-46页
· 实验材料与方法	第36-38页
· 测序原始数据处理及de novo组装	第36-37页
· 基因注释	第37-38页
· SNP鉴定	第38页
· 实验结果	第38-44页
· 测序原始数据统计与质量评估	第38-40页
· de novo组装统计	第40页
· 基因注释结果	第40-44页
· SNP鉴定结果	第44页
· 讨论	第44-46页
第五章野桑蚕转录组表达谱分析	第46-56页
· 实验材料与方法	第46-47页
· 转录组unigene表达量计算	第46-47页
· 基因差异表达分析	第47页
· 实验结果	第47-54页
· 基因差异表达分析结果	第47页
· 丝蛋白相关基因分析	第47-54页
· 讨论	第54-56页
第六章野桑蚕正向选择基因鉴定与功能分析	第56-76页
· 实验材料与方法	第56-58页
· 野桑蚕直系同源基因鉴定	第56页
· 野桑蚕Ka/Ks分析与正向选择基因的鉴定	第56-57页
· 野桑蚕正向选择基因KEGG富集分析	第57-58页
· 实验结果	第58-72页
· 野桑蚕直系同源基因鉴定与Ka/Ks分析结果	第58-62页
· 与家蚕重测序接结果的比较	第62-63页
· 野桑蚕正向选择基因功能分析	第63-72页
· 讨论	第72-76页
第七章结论与讨论	第76-78页
参考文献	第78-84页
附录	第84-100页
硕士在读期间发表的文章及参与课题	第100-102页
致谢	第102页

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