醋栗番茄(Solanum pimpinellifolium)遗传多样性及重要农艺性状全基因组关联分析
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醋栗番茄(Solanum pimpinellifolium)遗传多样性及重要农艺性状全基因组关联分析
论文目录
摘要
第1-7页
abstract
第7-14页
英文缩略表
第14-15页
第一章 绪论
第15-24页
1.1 醋栗番茄遗传多样性
第15-19页
1.1.1 醋栗番茄的群体结构
第15页
1.1.2 醋栗番茄抗生物胁迫性
第15-17页
1.1.3 醋栗番茄抗非生物胁迫性
第17-18页
1.1.4 醋栗番茄的优良园艺性状
第18页
1.1.5 问题与展望
第18-19页
1.2 SNP分子标记
第19-20页
1.2.1 SNP标记
第19-20页
1.2.2 KASPar基因分型
第20页
1.3 全基因组关联分析
第20-23页
1.3.1 全基因组关联分析的原理和优势
第20-21页
1.3.2 连锁不平衡分析
第21页
1.3.3 全基因组关联分析在植物学中的应用
第21-22页
1.3.4 全基因组关联分析在番茄作物中的应用
第22页
1.3.5 基于低倍重测序进行GWAS
第22-23页
1.4 本研究的目的和技术路线
第23-24页
1.4.1 研究目的
第23页
1.4.2 技术路线
第23-24页
第二章 S. pimpinellifolium遗传多样性分析
第24-35页
2.1 材料与方法
第24-26页
2.1.1 试验材料
第24页
2.1.2 栽培方法
第24页
2.1.3 DNA提取和基因分型
第24-25页
2.1.4 性状测定方法
第25-26页
2.1.5 数据统计与分析
第26页
2.2 结果与分析
第26-33页
2.2.1 醋栗资源材料的来源及地理分布
第26-27页
2.2.2 表型多样性分析
第27-28页
2.2.3 聚类分析
第28-29页
2.2.4 相关性分析
第29页
2.2.5 主成分分析
第29-33页
2.3 讨论
第33-35页
2.3.1 醋栗番茄的遗传多样性
第33-34页
2.3.2 表型和基因型聚类分析
第34页
2.3.3 性状相关性及主成分分析
第34页
2.3.4 存在的问题及应用前景
第34-35页
第三章 S. pimpinellifolium群体结构分析
第35-42页
3.1 材料与方法
第35-37页
3.1.1 试验材料
第35页
3.1.2 测序样品的制备
第35-36页
3.1.3 全基因组重测序
第36页
3.1.4 SNPs的提取
第36页
3.1.5 SNPs注释和分类
第36页
3.1.6 醋栗番茄群体进化树的构建
第36页
3.1.7 醋栗番茄群体主成分分析
第36页
3.1.8 群体结构分析
第36-37页
3.2 结果与分析
第37-40页
3.2.1 全基因组SNPs的鉴定
第37-38页
3.2.2 醋栗番茄群体进化树分析
第38-39页
3.2.3 醋栗番茄群体主成分分析
第39页
3.2.4 醋栗番茄群体结构分析
第39-40页
3.3 讨论
第40-42页
3.3.1 SNP标记的挖掘
第40页
3.3.2 醋栗番茄群体结构分析
第40-42页
第四章 S. pimpinellifolium重要农艺性状的全基因组关联分析
第42-49页
4.1 材料与方法
第42-43页
4.1.1 试验材料
第42页
4.1.2 重要农艺性状的鉴定
第42-43页
4.1.3 全基因组重测序
第43页
4.1.4 表型数据分析
第43页
4.1.5 全基因组关联分析
第43页
4.2 结果与分析
第43-48页
4.2.1 表型鉴定
第43-47页
4.2.2 全基因组关联分析
第47-48页
4.3 讨论
第48-49页
4.3.1 表型性状分析
第48页
4.3.2 全基因组关联分析
第48-49页
第五章 全文结论
第49-50页
参考文献
第50-61页
致谢
第61-62页
作者简介
第62页
本篇论文共
62
页,
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