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胶质类芽孢杆菌KNP414染色体外遗传物质鉴定

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胶质类芽孢杆菌KNP414染色体外遗传物质鉴定
论文目录
 
摘要第1-10页
Abstract第10-15页
第一章 文献综述第15-27页
  1 细菌染色体外遗传物质的种类及其基本特征1 第15-20页
    · 细菌染色体外遗传物质的种类1第15页
    · 细菌质粒的基本特征1第15-18页
      · 质粒的复制调控第15-16页
      · 质粒的拷贝数第16-17页
      · 质粒的稳定性第17页
      · 质粒的不相容性第17页
      · 质粒的生物学功能第17-18页
    · 噬菌体的基本特征第18-20页
      · 噬菌体的种类第18-19页
      · 噬菌体的感染性第19页
      · 噬菌体的可诱导性第19页
      · 噬菌体的常用检测方法第19-20页
      · 噬菌体的生物学功能第20页
  2 芽孢杆菌属和类芽孢杆菌属染色体外核酸研究现状第20-23页
    · 质粒研究现状第21-22页
    · 噬菌体研究现状第22-23页
  3 胶质类芽孢杆菌的概况第23-25页
    · 胶质类芽孢杆菌的分类研究进展第23-24页
    · 胶质类芽孢杆菌的形态特性及培养条件第24页
    · 胶质类芽孢杆菌的功能第24-25页
    · 胶质类芽孢杆菌的应用第25页
  4 研究目的和意义第25-27页
第二章 胶质类芽孢杆菌质粒的提取第27-42页
  1 材料第27页
    · 供试菌株第27页
  2 方法第27-30页
    · 培养条件的优化第27-29页
      · 培养时间对菌株生长状况及质粒提取效率的影响第27-28页
      · 氮、碳源对菌株荚膜及质粒提取效率的影响第28页
      · 不同浓度(NH3)2 SO4对菌株生长状况及质粒提取效率影响第28页
      · 不同浓度K2 HPO4对菌株生长状况及质粒提取效率的影响第28-29页
    · 菌质粒提取方法改良第29-30页
      · 改良的SDS法第29页
      · 改良的试剂盒法-AxyGene第29-30页
    · 菌质粒条带的纯化方法第30页
  3 结果与分析第30-40页
    · 培养条件的优化第30-38页
      · 培养时间的影响第30-32页
      · 氮、碳源的影响第32-33页
      · 不同浓度(NH3 )2SO4的影响第33-35页
      · 不同浓度K2HPO4的影响第35-38页
    · 菌质粒提取方法的确定第38-39页
    · 菌质粒条带的纯化方法第39-40页
  4 小结与讨论第40-42页
第三章 胶质类芽孢杆菌质粒pKNP414的全序列分析第42-58页
  1 材料第42-43页
    · 供试菌株与载体第42-43页
  2 方法第43-46页
    · 质粒pKNP414酶切图谱分析第43-44页
      · 单酶切图谱分析第43页
      · 双酶切图谱分析第43-44页
      · 质粒酶切位点图预测第44页
    · 质粒全序列获取第44-46页
      · 双酶切克隆分析质粒部分序列第44页
      · 基因步移法获取质粒全序列第44-46页
        · 反向PCR扩增第44-46页
        · 质粒全序列拼接第46页
    · 质粒全序列分析第46页
      · 质粒pKNP414一般结构特征分析第46页
      · ORFs预测第46页
      · 启动子预测与分析第46页
      · 重复序列的预测与分析第46页
  3 结果与分析第46-56页
    · 胶质类芽孢杆菌KNP414质粒酶切图谱分析第46-49页
      · 单酶切和双酶切电泳图第46-48页
      · 质粒酶切位点图预测第48-49页
    · 质粒全序列获取第49-52页
      · 双酶切克隆分析质粒部分序列第49-50页
      · 基因步移法获取质粒全序列第50-52页
    3. 3 质粒 p K N P4 1 4 全序 列 的 分 析第52-56页
      · 质粒 p KN P 4 14 全 序 列的 一 般结 构 特征 分 析第52页
      · 质粒pKNP414ORFs预测第52-54页
      · 启动子预测与分析第54-56页
      · 重复序列的预测与分析第56页
  4 小结与讨论第56-58页
第四章 胶质类芽孢杆菌质粒pKNP414拷贝数测定第58-67页
  1 材料第58页
    · 供试菌株第58页
    · 实验仪器第58页
  2 方法第58-61页
    · 胶质类芽孢杆菌KNP414裂解液制备第58-59页
    · 荧光定量PCR引物设计和特异性检测第59-60页
      · 荧光定量PCR引物设计第59页
      · 引物特异性检测第59-60页
      · 序列克隆测序第60页
    · pKNP414质粒的拷贝数测定第60-61页
  3 结果与分析第61-65页
    · PCR条件优化与引物特异性检测第61-63页
      · PCR退火温度优化第61-62页
      · 引物特异性检测第62页
      · 细胞裂解液不同浓度稀释PCR产物特异性检测第62-63页
    · 质粒pKNP414的拷贝数测定第63-65页
  4 小结与讨论第65-67页
第五章 胶质类芽孢杆菌原噬菌体序列分析及噬菌体诱导第67-76页
  1 材料第67-68页
    · 供试菌株第67页
    · 噬菌体相关序列第67-68页
  2 方法第68-71页
    · 原噬菌体序列获取第68-70页
      · 引物设计第68页
      · 原噬菌体序列验证第68-70页
        · 基因组DNA提取第68-69页
        · PCR扩增反应第69页
        · 序列克隆测序第69-70页
      · 原噬菌体序列与质粒的关系第70页
        · 质粒DNA提取第70页
        · PCR扩增反应第70页
    · 噬菌体诱导验证实验第70-71页
      · MMC诱导噬菌体实验第70页
      · 噬菌体验证实验第70-71页
        · 2.5×SDS-EDTA快速检测第70页
        · 双层平板检测第70-71页
  3 结果与分析第71-74页
    · 原噬菌体序列验证第71-72页
      · 基因组DNA提取第71页
      · 原噬菌体序列的克隆第71-72页
      · 原噬菌体序列与质粒的关系第72页
    · 噬菌体诱导验证实验第72-74页
      · 2.5×SDS-EDTA快速检测第72-73页
      · 双层平板检测第73-74页
  4 小结与讨论第74-76页
总结第76-77页
参考文献第77-82页
附录一 培养基的配制第82-83页
附录二 重要溶液的配制69第83-84页
致谢第84 页

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