基于三角网格的蛋白质分子表面建模及分子能量分布在表面特征分析中的应用



基于三角网格的蛋白质分子表面建模及分子能量分布在表面特征分析中的应用

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基于三角网格的蛋白质分子表面建模及分子能量分布在表面特征分析中的应用

论文目录
摘要	第1-7页
ABSTRACT	第7-11页
第一章绪论	第11-15页
· 研究背景及意义	第11-12页
· 研究现状	第12-13页
· 本文研究内容	第13-15页
第二章基本概念与理论	第15-20页
· 蛋白质数据库	第15页
· 分子表面	第15-17页
· 表面原子与内部原子	第17-20页
· 基于扩展球的表面原子提取算法	第18-20页
第三章基于Contour-Buildup算法的蛋白质分子表面三角化	第20-35页
· 相关工作	第20-22页
· 基于表面原子与Contour-Buildup算法计算SES	第22-25页
· 计算SAS上弧的列表	第23-24页
· 生成马鞍面	第24页
· 生成三角凹球面	第24-25页
· 三角化SES的三类面片	第25-28页
· 凸球面三角化	第25-27页
· 凹球面和马鞍面三角化	第27-28页
· 实验结果与分析	第28-34页
· 使用SAEES提取表面原子	第29页
· 基于Contour-Buildup生成SAS上弧列表的实验	第29-32页
· 计算分子SES及三角化的实验	第32-34页
· 本章小结	第34-35页
第四章基于CB方法的对接分子表面三角网格绘制	第35-45页
· 基本介绍	第35-37页
· 分子对接	第35-36页
· 局部重绘	第36-37页
· 具体实现	第37-40页
· 获取数据源	第37-38页
· 局部绘制的实现过程	第38-40页
· 实验结果与分析	第40-44页
· 局部重绘实验结果	第40-42页
· 实验结果分析	第42-44页
· 本章小结	第44-45页
第五章基于静电势能的蛋白质分子表面特征分析	第45-54页
· 相关工作	第45-46页
· 分析蛋白质分子表面特征区域处的能量分布	第46-49页
· 基本介绍	第47-48页
· 寻找位于分子表面附近的能量点	第48-49页
· 分子表面特征区域处能量分布情况	第49页
· 实验结果与分析	第49-53页
· 寻找分子表面能量点的实验	第49-50页
· 能量值可视化	第50-53页
· 分子能量分布分析	第53页
· 本章小结	第53-54页
第六章结论与展望	第54-56页
· 结论	第54-55页
· 展望	第55-56页
参考文献	第56-60页
作者在攻读硕士学位期间公开发表的论文	第60-61页
致谢	第61页

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