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基于高通量RNA-seq数据的水稻亚种特异性编码基因鉴定及长非编码RNA识别
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基于高通量RNA-seq数据的水稻亚种特异性编码基因鉴定及长非编码RNA识别
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-8页
缩略词表第8-9页
1 前言第9-20页
　　1.1 转录组学研究概述第9-15页
　　　　1.1.1 转录组学第9页
　　　　1.1.2 转录组测序技术的发展第9-14页
　　　　1.1.3 转录组研究的内容及现状第14-15页
　　1.2 长非编码RNA研究概述第15-17页
　　　　1.2.1 长非编码RNA的研究背景第15页
　　　　1.2.2 长非编码RNA的分类第15-16页
　　　　1.2.3 长非编码RNA的识别第16-17页
　　1.3 禾本科植物转录组学研究进展第17-18页
　　　　1.3.1 水稻的功能基因挖掘第17-18页
　　　　1.3.2 禾本科长非编码RNA的研究第18页
　　1.4 研究目的及内容第18-20页
2 材料和方法第20-26页
　　2.1 实验数据第20页
　　2.2 生物信息学软件第20-22页
　　2.3 实验方法第22-26页
　　　　2.3.1 数据的预处理第22页
　　　　2.3.2 转录组组装第22-23页
　　　　2.3.3 预测新的编码基因第23页
　　　　2.3.4 泛基因组完整性的验证第23-24页
　　　　2.3.5 新基因的功能注释第24页
　　　　2.3.6 籼、粳稻编码基因同源性分析第24页
　　　　2.3.7 简单重复序列的识别第24-25页
　　　　2.3.8 长非编码RNA的预测第25-26页
3 结果与分析第26-45页
　　3.1 数据的质量控制第26-28页
　　3.2 新转录本的识别第28-30页
　　　　3.2.1 De novo组装结果第28-29页
　　　　3.2.2 新转录本的识别及序列特征第29-30页
　　3.3 新编码基因预测及注释第30-39页
　　　　3.3.1 新编码基因的预测第30-31页
　　　　3.3.2 泛基因组完整性的验证第31-33页
　　　　3.3.3 新编码基因的功能注释第33-37页
　　　　3.3.4 逆境胁迫相关功能基因第37-39页
　　3.4 籼、粳稻编码基因的同源性分析第39-40页
　　3.5 简单重复序列分析第40-43页
　　3.6 长非编码RNA预测第43-45页
4 讨论第45-47页
5 总结与展望第47-48页
参考文献第48-53页
附录第53-56页
致谢第56页

本篇论文共56页，点击这进入下载页面。
 
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