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甘肃高山细毛羊KRT-IF基因克隆、生物信息学分析及其遗传效应研究

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甘肃高山细毛羊KRT-IF基因克隆、生物信息学分析及其遗传效应研究
论文目录
 
摘要第1-5 页
Abstract第5-10 页
第一章 文献综述第10-21 页
  ·世界羊毛品质现状第10-11 页
  ·中国羊毛生产现状第11-13 页
    · 我国细毛羊发展的历史回顾第11-12 页
    · 我国细毛羊的发展方向第12 页
    · 我国细毛羊结构的变化第12 页
    · 我国细毛羊育种手段第12-13 页
  ·甘肃高山细毛羊育种状况第13-14 页
    · 甘肃高山细毛羊简介第13 页
    · 甘肃高山细毛羊育种中存在的问题第13 页
    · 发展甘肃细毛羊对策第13-14 页
      · 改进和发展细毛羊业第13-14 页
      · 改进选育手段,加快选育进程第14 页
  ·分子标记在绵羊育种中的应用第14-17 页
    · 聚合酶链式反应—单链构象多态性(PCR-SSCP)第15-16 页
      · PCR-SSCP基本原理第15 页
      · PCR-SSCP优点第15-16 页
      · PCR-SSCP缺陷第16 页
    · 高分辨率溶解—HRM第16-17 页
      · HRM主要原理第16 页
      · HRM技术优势第16-17 页
      · HRM的应用第17 页
  ·毛用性状基因研究进展第17-20 页
  ·本研究的目的和意义第20-21 页
第二章 KRT-IF 35基因克隆、生物信息学分析第21-37 页
  ·实验材料第21 页
    · 实验动物第21 页
    · 实验仪器耗材及试剂的配制方法第21 页
  ·实验方法第21-28 页
    · 基因组DNA的提取第21-22 页
    · 基因组DNA浓度和纯度的检测第22-23 页
      · 琼脂糖电泳检测第22 页
      · DNA纯度及浓度的判别第22-23 页
      · 紫外分光光度计检测第23 页
    · 引物设计第23 页
    · PCR反应第23-24 页
      · PCR反应程序第23-24 页
      · PCR反应体系第24 页
    · 基因克隆第24-27 页
      · PCR产物回收步骤第24-25 页
      · PCR产物的连接第25 页
      · PCR产物的转化第25-26 页
      · 提取质粒第26 页
      · 酶切鉴定第26-27 页
    ·KRT-IF 35基因的生物信息学分析第27-28 页
      · KRT-IF 35基因结构分析第27 页
      · KRT-IF 35基因蛋白质分析第27-28 页
  ·结果第28-35 页
    · PCR产物第29 页
    · KRT-IF 35基因的核酸序列分析第29-33 页
      · 序列拼接结果第29-30 页
      · KRT-IF 35基因的分子质量、碱基组成、碱基分布第30 页
      · KRT-IF 35 mRNA预测第30 页
      · 开放阅读框(ORF)预测第30-31 页
      · KRT-IF 35mRNA、蛋白同源性比对及系统进化树第31-33 页
    · KRT-IF 35基因蛋白质结构预测第33-35 页
      · 氨基酸基本理化特性分析第33 页
      · 蛋白质亲疏水性预测第33 页
      · 蛋白质跨膜结构预测第33-34 页
      · 蛋白质信号肽分析第34 页
      · 蛋白质二级结构分析第34-35 页
      · 蛋白质超二级结构——结构域分析第35 页
  ·讨论第35-37 页
第三章 KRT-IF 35基因的遗传结构与遗传效应分析第37-47 页
  ·实验材料第37 页
    · 实验动物和地点第37 页
    · 实验仪器耗材及试剂的配制方法第37 页
  ·实验方法第37-40 页
    · 基因组DNA的提取及浓度和纯度的检测第37 页
    · 分子标记检测第37-40 页
      · 引物的设计及稀释第37 页
      · 引物序列及退火温度第37-38 页
      · SSCP—PCR反应体系及程序第38 页
      · 凝胶的配制第38 页
      · 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳步骤第38-39 页
      · 测序第39 页
      · 羊毛性状数据的测定第39 页
      · 数据统计第39-40 页
  ·结果第40-44 页
    · 甘肃高山细毛羊基因组DNA的检测第40 页
    · PCR扩增第40-41 页
    · SSCP检测第41 页
    · 序列分析结果第41-42 页
    · 数据统计第42-44 页
      · 基因频率及基因型频率第42 页
      · Hardy-Weinberg平衡检验(χ~2适合性检验)第42 页
      · KRT-IF 35基因的遗传多态参数第42-43 页
      · 利用最小二乘法分析各因素对细毛羊毛用性状的影响第43-44 页
  ·讨论第44-47 页
    · KRT-IF 35基因作为毛用候选基因的可行性第44-45 页
    · KRT-IF 35多态性分析第45-47 页
      · KRT-IF 35的遗传性分析第45-46 页
      · KRT-IF 35基因多态性与毛用性状的相关性分析第46-47 页
第四章 KRT-IF 31基因的遗传结构与遗传效应研究第47-62 页
  ·实验材料第47 页
  ·实验方法第47-49 页
    · 引物的设计第47-48 页
    · PCR反应程序第48 页
      · Mutation Scanning的PCR反应程序第48 页
      · Unlabeled Probes的PCR反应程序第48 页
      · PCR反应体系第48 页
    · MUTATION SCANNING、UNLABELED PROBES步骤第48-49 页
    · 测序第49 页
    · 羊毛性状数据的测定第49 页
    · 数据统计第49 页
  ·结果第49-57 页
    · MUTATION SCANNING扩增结果第49-50 页
    · UNLABELED PROBES法扩增结果第50-51 页
    · MUTATION SCANNING扫描结果第51 页
    · UNLABELED PROBES分型结果第51-52 页
    · 测序结果第52-53 页
    · 数据统计第53-57 页
      · 基因频率和基因型频率计算第53-54 页
      · Hardy-Weinberg平衡检验(χ~2适合性检验)第54 页
      · KRT-IF 31基因的杂合度、有效等位基因数和多态信息含量第54-55 页
      · 利用最小二乘法分析各因素对细毛羊毛用性状的影响第55-57 页
  · 讨论第57-62 页
    · 影响HRM分析结果的因素第57-59 页
      · 荧光染料第57-58 页
      · PCR产物第58 页
      · 非标记性探针法第58-59 页
      · 探针设计应注意的问题第59 页
    · KRT-IF 31多态性分析第59-62 页
      · KRT-IF 31的遗传性分析第59-61 页
      · KRT-IF 31基因多态性与毛用性状的相关性分析第61-62 页
第五章 结论第62-63 页
参考文献第63-67 页
附录第67-75 页
  附录1:主要仪器和设备第67-68 页
  附录2:主要的化学药品及耗材及主要试剂的配制第68-71 页
  附录3:缩写词表第71-72 页
  附录4:KRT-IF 35基因全序列第72-74 页
  附录5:KRT-IF 35基因的MRNA第74-75 页
致谢第75-76 页
个人简介第76-77 页
导师简介第77-79页

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