DBP降解菌DNB-S1转录组学研究及功能基因的筛选
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DBP降解菌DNB-S1转录组学研究及功能基因的筛选
论文目录
摘要
第1-9页
英文摘要
第9-11页
1 前言
第11-20页
· 转录组学概述
第11-14页
· 转录组与转录组学
第11页
· 转录组学研究的基本方法
第11-12页
· 第二代测序平台
第12-14页
· 细菌转录组研究现状
第14页
· DBP降解菌功能基因相关研究
第14-18页
· DBP及其危害
第14-16页
· DBP的生物降解
第16-17页
· DBP降解菌功能基因研究
第17-18页
· 实时荧光定量PCR
第18页
· 研究的目的意义
第18-19页
· 技术路线
第19页
· 课题来源
第19-20页
2 材料与方法
第20-28页
· 材料
第20-21页
· 供试菌株与培养基
第20页
· 主要试剂
第20页
· 主要仪器
第20-21页
· 试验方法
第21-26页
· 培养菌株
第21页
· 上机测序
第21-22页
· 序列拼接与组装
第22-23页
· 基因的功能注释和COG分类
第23-25页
· Unigene表达差异分析
第25-26页
· 差异Unigene的GO和Pathway分析
第26页
· qPCR
第26-28页
3 实验结果
第28-43页
· 产量统计与组装结果分析
第28页
· Unigene的功能注释结果与分析
第28-30页
· Unigene的功能注释
第28-29页
· 预测蛋白注释
第29页
· COG
第29-30页
· Unigene的GO分类
第30-31页
· Unigene的代谢通路分析
第31页
· Unigene的表达差异分析
第31-34页
· GO功能分析
第32-34页
· Pathway富集分析
第34页
· 功能基因的预测
第34-42页
· 转录调控因子
第34-36页
· 趋化蛋白
第36-38页
· 降解基因及代谢路径
第38-41页
· 其它功能基因
第41-42页
· 定量验证测序结果
第42-43页
4 讨论
第43-48页
· 转录组测序实验的实验设计
第43页
· 基因注释结果和差异表达基因分析
第43-44页
· 功能基因预测分析
第44-47页
· 转录调控因子
第44-45页
· 趋化蛋白
第45页
· 降解基因及代谢路径分析
第45-46页
· 降解DBP功能基因
第46-47页
· 功能基因的验证
第47-48页
·结论
第48-49页
致谢
第49-50页
参考文献
第50-59页
攻读硕士学位期间发表的学术论文
第59页
本篇论文共
59
页,
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。
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