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多粘类芽胞杆菌(Paenibacillus polymyxa)SC2基因敲除体系的建立

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多粘类芽胞杆菌(Paenibacillus polymyxa)SC2基因敲除体系的建立
论文目录
 
符号说明第1-10页
中文摘要第10-11页
Abstract第11-13页
1 引言第13-43页
  · 微生物基因组学第13-22页
    · 基因组学的分类第13-16页
      · 结构基因组学第14页
      · 功能基因组学第14-16页
    · 微生物基因组测序的方法和策略第16-17页
    · 微生物基因组的注释第17-20页
    · 后基因组时代的研究任务第20-21页
    · 后基因组时代研究生防基因功能的手段第21-22页
      · 反向遗传学技术第21页
      · 基因敲除第21-22页
  · 类芽胞杆菌属全基因组研究现状第22-34页
    · 多粘类芽胞杆菌的分类地位第22-23页
    · 多粘类芽胞杆菌产生的抗菌物质第23-32页
      · 拮抗蛋白第24-25页
      · 抗生素类第25-30页
      · 肽类抗生素和聚酮类化合物的 NRPS-PKS 合成途径第30-32页
    · 多粘类芽胞杆菌的应用第32-33页
      · 农业应用第32-33页
      · 工业应用第33页
      · 医药应用第33页
    · 多粘类芽胞杆菌的基因组测序工作进展第33-34页
  · 基因敲除体系研究进展第34-41页
    · 基因敲除载体的选择和构建第34-39页
      · 基因敲除载体的选择第34-35页
      · 基因敲除载体的构建第35-39页
    · 常用的转化方法第39-40页
      · 电激转化法第39页
      · 原生质体转化第39-40页
      · 碱金属离子转化法第40页
      · 接合转移法第40页
    · 重组子的筛选第40-41页
  · 立题依据、研究内容及技术路线第41-43页
    · 立题依据第41页
    · 研究内容第41-42页
    · 技术路线第42-43页
2 材料和方法第43-58页
  · 适合多粘类芽胞杆菌的自杀质粒的选择及转化条件摸索第43-52页
    · 菌株和质粒第43页
    · 培养基与抗生素第43-44页
    · 酶和生化试剂第44页
    · 常用溶液及缓冲液第44-45页
      · 大肠杆菌感受态细胞制备试剂(CaCl2法)第44页
      · 多粘类芽胞杆菌 SC2 感受态细胞制备及电转化试剂第44页
      · DNA 提取试剂第44-45页
      · 核酸电泳缓冲液第45页
    · 仪器设备第45页
    · 实验方法第45-52页
      · SC2 基因组 DNA 的提取第45-46页
      · 多粘类芽胞杆菌 SC2 的生长曲线的测定第46页
      · 质粒 DNA 的提取第46-47页
      · 质粒 DNA 的单酶切第47页
      · 大肠杆菌 JM109 热激感受态细胞的制备第47-48页
      · 大肠杆菌 SCS110 感受态细胞的制备第48页
      · 多粘类芽胞杆菌 SC2 感受态细胞的制备第48页
      · 热激转化大肠杆菌 JM109第48页
      · 电转化大肠杆菌 SCS110第48-49页
      · 电转化多粘类芽胞杆菌 SC2第49页
      · PCR 扩增第49页
      · 琼脂糖凝胶电泳第49-50页
      · DNA 浓度的测定第50页
      · PCR 扩增产物的回收第50-51页
      · 连接第51页
      · 质粒快速检测第51页
      · 序列测定第51-52页
  · 适于多粘类芽胞杆菌 SC2 抗性盒的选择第52-54页
    · 菌株与质粒第52页
    · 培养基和抗生素第52页
    · 质粒 pHY300PLK-Km 的构建第52-53页
      · 质粒 pHY300PLK 和 pUC4K 的 EcoR I 单酶切第52页
      · 酶切产物的回收第52页
      · 酶切产物的连接第52-53页
      · 连接产物的转化及鉴定第53页
    · 卡那霉素抗性基因在多粘类芽胞杆菌 SC2 中的表达检测第53页
    · 质粒 pHY300PLK-Cm 的构建第53-54页
      · 质粒 pHY300PLK 的 EcoR I 和 BamH I 双酶切第53页
      · 氯霉素基因的扩增、连接及酶切第53页
      · 酶切产物的回收第53-54页
      · 酶切产物的连接第54页
      · 连接产物的转化及鉴定第54页
    · 氯霉素抗性基因在多粘类芽胞杆菌 SC2 中的表达检测第54页
  · 多粘菌素合成关键基因 pmxE 的敲除验证体系的可用性第54-58页
    · 菌株与质粒第54页
    · 培养基和抗生素第54页
    · 高效液相色谱所使用的试剂和缓冲液第54页
    · 敲除质粒 pRN5101-EC 的构建第54-56页
      · pmxE 部分基因片段和 Cm 抗性盒的 PCR 扩增与 DNA 测序第54-55页
      · 敲除质粒 pRN5101-EC 构建流程第55页
      · 载体和外源片段的双酶切第55页
      · 酶切产物的回收第55-56页
      · 酶切产物的连接反应第56页
      · 连接产物的转化及鉴定第56页
      · 敲除质粒 pRN5101-EC 的电转化第56页
    · 多粘类芽胞杆菌 pmxE 突变体 SC2-E 的筛选第56-57页
      · 筛选具有氯霉素抗性无红霉素抗性的重组子第56-57页
      · 菌落 PCR 筛选双交换子第57页
    · 抗细菌性能检测第57页
    · 多粘类芽胞杆菌 SC2-E 发酵液的 HPLC 分析第57-58页
3 结果与分析第58-72页
  · 适合多粘类芽胞杆菌的自杀质粒的选择及转化条件摸索的结果第58-61页
    · 多粘类芽胞杆菌 SC2 的生长曲线第58页
    · 质粒 pHY300PLK 电转化多粘类芽胞杆菌 SC2第58-60页
    · 质粒 pRN5101 转化多粘类芽胞杆菌 SC2第60-61页
  · 适合多粘类芽胞杆菌 SC2 抗性盒的选择第61-64页
    · 质粒 pHY300PLK-Km 的构建第61-62页
    · 卡那霉素抗性基因在多粘类芽胞杆菌 SC2 中的表达情况第62-63页
    · 质粒 pHY300PLK-Cm 的构建第63-64页
    · 氯霉素抗性基因在多粘类芽胞杆菌 SC2 中的表达情况第64页
  · 多粘菌素基因 E 的敲除验证体系的可用性第64-72页
    · 敲除载体 pRN5101-pm-Cm 的构建第64-68页
    · 多粘类芽胞杆菌 SC2-E 的筛选第68-70页
    · 多粘类芽胞杆菌 SC2-E 的抗细菌性能检测第70-71页
    · 多粘类芽胞杆菌 SC2-E 发酵液的 HPLC 分析第71-72页
4 讨论第72-74页
5 结论第74-75页
参考文献第75-82页
致谢第82-83页
攻读学位期间发表论文情况第83 页

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