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组蛋白H3甲基化模式在稻瘟病菌发育和致病过程中的功能分析

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组蛋白H3甲基化模式在稻瘟病菌发育和致病过程中的功能分析
论文目录
 
致谢第1-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-14页
第一章 文献综述第14-28页
  1.1 稻瘟病菌概况第14-16页
    1.1.1 稻瘟病与稻瘟病菌第14页
    1.1.2 稻瘟病菌的致病侵染循环第14-16页
  1.2 表观遗传学第16-19页
    1.2.1 染色体结构重塑与重塑子第16-18页
    1.2.2 DNA甲基化第18页
    1.2.3 组蛋白修饰第18-19页
  1.3 组蛋白甲基化第19-22页
  1.4 酵母中组蛋白甲基化研究概况第22-24页
  1.5 丝状真菌中表观遗传学研究概况第24-26页
  1.6 稻瘟病菌中的表观遗传学研究概况与本实验研究目的第26-28页
第二章 材料与方法第28-44页
  2.1 实验菌株与培养条件第28-30页
    2.1.1 稻瘟病菌菌株及培养条件第28页
    2.1.2 细菌菌株及其培养条件第28页
    2.1.3 酵母菌株及其培养条件第28页
    2.1.4 培养基配方第28-30页
  2.2 载体构建第30-35页
    2.2.1 聚合酶链式反应(PCR)第30-31页
    2.2.2 DNA操作第31-32页
      2.2.2.1 载体酶切第31页
      2.2.2.2 酵母融合方法构建敲除质粒第31-32页
      2.2.2.3 融合酶法载体构建第32页
    2.2.3 酵母感受态细胞的制备与转化第32-33页
    2.2.4 酵母质粒提取第33-34页
    2.2.5 质粒转化大肠杆菌第34-35页
      2.2.5.1 大肠杆菌感受态细胞制备第34页
      2.2.5.2 大肠杆菌转化第34-35页
  2.3 稻瘟病菌T-DNA转化第35-37页
    2.3.1 载体农杆菌转化(冻融法)第35-36页
    2.3.2 稻瘟病菌的农杆菌介导的DNA转化(ATMT)方法第36-37页
  2.4 稻瘟病菌基因组DNA和RNA的提取第37-39页
    2.4.1 基因组DNA提取(快提法)第37页
    2.4.2 基因组DNA提取(CTAB法,小量)第37-38页
    2.4.3 稻瘟病菌RNA的提取第38-39页
  2.6 突变体表型分析第39-40页
    2.6.1 菌丝生长速度测定和产孢量分析第39页
    2.6.2 分生孢子梗形态的观察第39-40页
    2.6.3 孢子萌发率和附着胞形成率测定第40页
  2.7 稻瘟病菌的致病性测定第40-41页
    2.7.1 离体大麦叶片接种第40-41页
    2.7.2 水稻喷雾第41页
    2.7.3 离体水稻叶片接种第41页
  2.8 稻瘟病菌Western Blotting分析第41-44页
    2.8.1 稻瘟病菌全蛋白的提取与定量第41-42页
    2.8.2 稻瘟病菌蛋白Western Blotting第42-44页
第三章 稻瘟病菌组蛋白甲基化相关基因功能分析第44-62页
  3.1 稻瘟病菌中JmjC结构域蛋白基因敲除与分析第44-52页
    3.1.1 JmjC结构域蛋白基因的鉴定和敲除第44-46页
    3.1.2 Jmd1、MoLid2和MoRph1是稻瘟病菌的生长与产孢中起作用第46页
    3.1.3 MoLid2是孢子萌发和附着胞形成所必须的第46-47页
    3.1.4 MoLid2和MoRph1影响稻瘟病菌的致病能力第47-48页
    3.1.5 MoLid2参与到稻瘟病菌有性生殖中第48-49页
    3.1.6 MoLid2的结构域功能分析第49-52页
  3.2 稻瘟菌中组蛋白甲基化相关基因的鉴定以及功能分析第52-58页
    3.2.1 MoLid2的敲除使H3K4和H3K9甲基化水平升高第52-53页
    3.2.2 MoRph1影响H3K36甲基化水平第53-54页
    3.2.3 MoCu14、MoClr4和MoSet1参与稻瘟病菌的生长、产孢以及致病过程第54-57页
    3.2.4 MoCu14、MoClr4和MoSet1参与组蛋白甲基化过程第57-58页
  3.3 MoHp1同源蛋白鉴定与分析第58-62页
    3.3.1 MoHp1B参与到生长和产孢的过程中第58-60页
    3.3.2 MoSet1和MoLid2在常染色质的维持中起作用第60-62页
第四章 讨论第62-66页
  4.1 稻瘟病菌中MoLid2功能的重要性第62-63页
  4.2 稻瘟病菌中H3组蛋白甲基化水平影响发育第63-64页
  4.3 H3组蛋白甲基化水平调节稻瘟病菌发育与致病基因的表达第64页
  4.4 本研究创新点、不足与展望第64-66页
参考文献第66-74页
附表1第74-80页
附表2第80页

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