癌症基因组和转录组测序数据分析方法研究
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癌症基因组和转录组测序数据分析方法研究
论文目录
摘要
第1-6页
Abstract
第6-12页
第一章 引言
第12-18页
· 新一代测序技术简介及其应用
第12-14页
· 结构变异简介以及研究意义
第14-15页
· 肺癌简介
第15页
· 转录组简介
第15-16页
· 结构变异检测方法和肺癌研究现状
第16页
· 本论文组织结构
第16-18页
第二章 癌症基因组结构变异检测方法研究
第18-32页
· 结构变异检测方法介绍
第18-19页
· 检测原理
第19-23页
· Paired reads比对串
第19-22页
· 窗口覆盖度
第22-23页
· 基于mate-pair reads检测缺失的方法
第23-26页
· 检测原理
第24-26页
· 生成模拟数据并比较检测结果
第26-29页
· 模拟数据
第26-27页
· 基于mate-pair reads方法检测结果
第27-28页
· PEMer检测结果
第28页
· BreakDancer检测结果
第28-29页
· 基于mate-pair reads检测肝癌结构变异
第29-30页
· 肝癌样品简介
第29-30页
· 检测结构变异结果
第30页
· 检测结构变异方法总结
第30-32页
第三章 肺癌转录组测序数据分析
第32-58页
· RNA-Sequencing技术简介
第32-33页
· 肺癌数据分析层面及其意义
第33-36页
· 肺癌样品简介
第36页
· 样品测序与比对结果
第36-38页
· 肺癌样品数据分析流程
第38-41页
· SNP分析流程
第38-39页
· 融合基因分析流程
第39-41页
· 差异表达基因分析流程
第41页
· 可变剪切分析流程
第41页
· 信号通路分析流程
第41页
· 肺癌样品数据分析结果
第41-51页
· 单核苷酸突变位点结果
第41-43页
· 等位基因特异性表达结果
第43-45页
· 融合基因检测结果
第45-47页
· 差异表达基因检测结果
第47-50页
· 可变剪切位点检测结果
第50-51页
· 信号通路检测结果
第51页
· 聚类分析
第51-54页
· 肺癌转录组数据分析总结
第54-58页
参考文献
第58-62页
简历
第62-64页
致谢
第64-65页
本篇论文共
65
页,
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。
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