论文目录 | |
| 缩略词 | 第11-12
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| 摘要 | 第12-15
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| Abstract | 第15-18
页 |
| 第一章 前言 | 第18-40
页 |
| 1 深海微生物研究的概况 | 第19-21
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| 2 深海微生物极端环境适应性机理研究进展 | 第21-26
页 |
| · 深海微生物低温适应性机理的研究 | 第22-23
页 |
| · 深海微生物高压适应性机理的研究 | 第23-26
页 |
| 3 脂肪酸系统与环境关系的研究 | 第26-30
页 |
| 4 丝状噬菌体研究概况 | 第30-38
页 |
| · 丝状噬菌体的基因结构和功能 | 第30-31
页 |
| · 丝状噬菌体的生活史 | 第31-36
页 |
| · 丝状噬菌体的感染过程 | 第32
页 |
| · 丝状噬菌体DNA的复制 | 第32-33
页 |
| · 丝状噬菌体基因的转录和翻译 | 第33-34
页 |
| · 丝状噬菌体的装配 | 第34-36
页 |
| · 丝状噬菌体诱导机制的研究 | 第36-38
页 |
| 5 本论文的研究目的和意义 | 第38-40
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| 第二章 深海细菌Shewanella piezotolerans WP3脂肪酸系统在不同温度和压力下的作用和调控 | 第40-82
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| 1 材料与方法 | 第40-58
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| · 材料 | 第40-48
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| · 菌株与质粒 | 第40
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| · 引物 | 第40-42
页 |
| · 主要仪器 | 第42
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| · 工具软件 | 第42-43
页 |
| · 主要试剂 | 第43
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| · 工具酶 | 第43
页 |
| · 试剂盒 | 第43
页 |
| · 常用溶液、培养基的配制 | 第43-48
页 |
| · 方法 | 第48-58
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| · 不同条件下的细菌培养 | 第48
页 |
| · 细菌总DNA的提取 | 第48-49
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| · WP3总RNA的提取 | 第49
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| · 基因组DNA的去除及RNA的纯化 | 第49-50
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| · DNA乙醇沉淀 | 第50
页 |
| · PCR反应 | 第50-51
页 |
| · 菌落PCR | 第51
页 |
| · 琼脂糖凝胶上DNA片段的回收 | 第51-52
页 |
| · PCR产物的回收 | 第52
页 |
| · 核酸内切酶酶切反应 | 第52
页 |
| · 质粒去磷酸化处理 | 第52
页 |
| · 连接反应 | 第52
页 |
| · 化学感受态细胞的制备 | 第52
页 |
| · 质粒的化学转化 | 第52-53
页 |
| · 质粒提取 | 第53
页 |
| · 同源性比对 | 第53
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| · 反转录PCR(RT—PCR) | 第53-54
页 |
| · 脂肪酸样品的制备与检测 | 第54
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| · 缺失突变载体和突变菌株的构建(双亲杂交) | 第54-58
页 |
| 2 结果与分析 | 第58-76
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| · 希瓦氏菌中与脂肪酸合成相关的基因和途径 | 第58-60
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| · WP3脂肪酸在不同温度和压力下的变化 | 第60-61
页 |
| · EPA,而不是单不饱和脂肪酸是WP3低温高压生长所必需的 | 第61-65
页 |
| · EPA缺失突变菌株的构建及其脂肪酸成分的分析 | 第61-62
页 |
| · EPA对WP3低温高压生长的影响 | 第62-64
页 |
| · 浅蓝菌素(Cerulenin)处理后WP3脂肪酸成分的变化 | 第64
页 |
| · 单不饱和脂肪酸含量的降低对WP3低温高压生长的影响 | 第64-65
页 |
| · EPA和单不饱和脂肪酸合成的调控 | 第65-70
页 |
| · 脂肪酸相关基因转录水平的分析 | 第65-66
页 |
| · EPA合成的调控 | 第66-69
页 |
| · Fis型转录调控因子(swp3548)缺失突变株的构建及其脂肪酸成分的分析 | 第67
页 |
| · Fis突变菌株EPA基因转录水平的分析 | 第67-69
页 |
| · 单不饱和脂肪酸合成的调控 | 第69-70
页 |
| · 需氧途径在WP3单不饱和脂肪酸合成中的作用 | 第69
页 |
| · 厌氧途径在WP3单不饱和脂肪酸合成中的作用 | 第69-70
页 |
| · 支链脂肪酸的作用和调控 | 第70-74
页 |
| · 支链氨基酸转运系统(LIV-I)结构和功能分析 | 第70-71
页 |
| · LIV-I突变菌株的构建及其脂肪酸成分的分析 | 第71-72
页 |
| · 支链脂肪酸含量的降低对WP3生长的影响 | 第72-73
页 |
| · 同位素示踪实验对LIV-I调控作用的验证 | 第73-74
页 |
| · LIV-I系统在希瓦氏细菌中的进化 | 第74-76
页 |
| 3 讨论 | 第76-81
页 |
| 4 小结 | 第81-82
页 |
| 第三章 深海噬菌体SW1的分离鉴定及其低温特性的研究 | 第82-107
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| 1 材料和方法 | 第83-92
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| · 材料 | 第83
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| · 引物序列 | 第83
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| · 探针序列 | 第83
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| · 方法 | 第83-92
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| · 丝状噬菌体颗粒的提取 | 第83-84
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| · 质粒形式(RF)丝状噬菌体DNA的提取 | 第84
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| · 单链形式(SS)丝状噬菌体DNA的提取 | 第84-85
页 |
| · 噬菌体侵染实验 | 第85
页 |
| · 噬菌体热稳定性的检测 | 第85
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| · 噬菌体宿主范围的检测 | 第85
页 |
| · 噬菌体颗粒的透射电镜观察 | 第85-86
页 |
| · Southern杂交 | 第86-88
页 |
| · 双向电泳 | 第88-92
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| 2 结果与分析 | 第92-103
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| · SW1丝状噬菌体基因组结构分析 | 第92-94
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| · SW1丝状噬菌体颗粒的分离及形态的观察 | 第94
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| · SW1丝状噬菌体基本性质的测定 | 第94-97
页 |
| · SW1丝状噬菌体宿主范围的检测 | 第97
页 |
| · SW1丝状噬菌体低温侵染特性及热稳定性的研究 | 第97-98
页 |
| · 温度对SW1丝状噬菌体表达调控的研究 | 第98-101
页 |
| · SW1丝状噬菌体低温诱导机制的初步研究 | 第101-103
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| 3 讨论 | 第103-106
页 |
| 4 小结 | 第106-107
页 |
| 第四章 总结与展望 | 第107-110
页 |
| 参考文献 | 第110-117
页 |
| 附录 | 第117-119
页 |
| 致谢 | 第119页 |
