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不同年龄段圈养大熊猫肠道微生物群落多样性的研究

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不同年龄段圈养大熊猫肠道微生物群落多样性的研究
论文目录
 
摘要第1-8页
Abstract第8-9页
第一章 文献综述第10-22页
    1 大熊猫的研究概况第10-12页
        1.1 圈养大熊猫的现状第10-11页
        1.2 大熊猫年龄的划分情况第11页
        1.3 大熊猫的食性和消化特点第11-12页
    2 大熊猫肠道微生物群落的研究背景第12-18页
        2.1 肠道微生物简介第12-14页
        2.2 大熊猫肠道微生物菌群的功能第14-16页
        2.3 大熊猫肠道菌群结构的影响因素第16-18页
        2.4 研究不同年龄大熊猫肠道微生物群落结构的研究意义第18页
    3 大熊猫肠道菌群的研究方法第18-20页
        3.1 传统的研究方法与现代分子生物学技术的研究方法第18-19页
        3.2 高通量测序技术在肠道微生物菌群研究的应用第19-20页
    4 论文主要研究内容第20-22页
        4.1 研究意义和研究内容第20-21页
        4.2 技术路线第21-22页
第二章 不同年龄段圈养大熊猫肠道微生物菌群的多样性比较分析第22-49页
    1 前言第22-23页
    2 材料与方法第23-26页
        2.1 不同年龄段大熊猫粪便的采集第23页
        2.2 实验设计第23-24页
        2.3 研究方法第24-26页
            2.3.1 粪便样品细菌总DNA提取第24页
            2.3.2 基于16S rRNA扩增的Hiseq测序第24-25页
            2.3.4 测序信息统计与分析第25-26页
    3 结果与分析第26-44页
        3.0 测序数据结果第26-27页
        3.1 样品多样性曲线第27-29页
        3.2 Alpha多样性指数第29-31页
        3.3 OTU聚类及注释第31-32页
        3.4 不同年龄段圈养大熊猫肠道菌群特征的比较第32-34页
            3.4.1 基于OTU的Venn图第32-33页
            3.4.2 不同年龄段样品的PCA结果第33-34页
            3.4.3 UPGMA聚类分析第34页
        3.5 不同年龄段圈养大熊猫肠道菌群结构的对比第34-41页
            3.5.1 不同分类水平菌群组成结构第34-38页
            3.5.2 物种丰度聚类热图分析第38-40页
            3.5.3 三元相图分析第40-41页
        3.6 年龄对成年和老年圈养大熊猫肠道细菌的影响第41页
        3.7 圈养大熊猫肠道微生物功能分析第41-44页
            3.7.1 圈养大熊猫肠道微生物功能预测初步分析第41-42页
            3.7.2 圈养大熊猫肠道微生物碳水化合物代谢的能力第42-44页
            3.7.3 圈养大熊猫肠道微生物抗生素抗性基因的能力第44页
    4 讨论第44-47页
    5 小结第47-49页
第三章 总体结论、创新点和展望第49-51页
    1 总体结论第49页
    2 创新点第49-50页
    3 展望第50-51页
参考文献第51-59页
致谢第59-63页
在学期间的科研情况第63

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