饲粮和品种对山羊瘤胃微生物多样性的影响



饲粮和品种对山羊瘤胃微生物多样性的影响

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饲粮和品种对山羊瘤胃微生物多样性的影响

论文目录
摘要	第1-6页
Abstract	第6-8页
符号说明	第8-13页
引言	第13-14页
第一章文献综述	第14-24页
· 反刍动物瘤胃微生物	第14-17页
· 瘤胃内的细菌	第14-15页
· 拟杆菌门	第14-15页
· 厚壁菌门	第15页
· 瘤胃内的古菌	第15-16页
· 瘤胃内的真菌	第16页
· 瘤胃内的原虫	第16-17页
· 影响瘤胃微生物多样性的因素	第17-19页
· 饲粮对瘤胃微生物多样性的影响	第17-18页
· 饲粮对瘤胃细菌多样性的影响	第17页
· 饲粮对瘤胃产甲烷古菌多样性的影响	第17-18页
· 品种对瘤胃微生物多样性的影响	第18-19页
· 品种对瘤胃细菌多样性的影响	第18页
· 品种对瘤胃古菌多样性的影响	第18-19页
· 瘤胃微生物的研究方法	第19-23页
· 瘤胃微生物分子生物学研究方法	第19-20页
· 16SrRNA基因序列分析技术	第19页
· 定量PCR技术	第19-20页
· RFLP分析技术	第20页
· DGGE技术	第20页
· 高通量测序平台在瘤胃微生物多样性研究上的应用	第20-23页
· 罗氏公司(Roche)454焦磷酸测序	第21页
· Ulmnina公司聚合酶合成测序	第21-23页
4 存在的问题及本研究的目的意义	第23-24页
· 存在的问题	第23页
· 本研究的目的和意义	第23-24页
· 研究目的	第23页
· 研究的意义	第23-24页
第二章试验研究	第24-52页
试验一：不同饲粮对山羊瘤胃微生物多样性的影响	第24-40页
· 材料	第24-25页
· 试验材料	第24页
· 试验动物	第24页
· 试验饲粮	第24-25页
· 主要仪器和设备	第25页
· 生物信息软件	第25页
· 试剂	第25页
· 方法	第25-28页
· 样品总DNA的提取	第25-27页
· 试验准备	第25-26页
· 样品采集	第26页
· 提取瘤胃微生物总DNA	第26-27页
· 样品PCR扩增以及Miseq测序	第27-28页
· 样品PCR扩增	第27页
· Miseq测序	第27-28页
· 数据分析	第28页
· 结果	第28-35页
· 稀释曲线	第28-29页
· 阿尔法多样性指数	第29页
· 不同饲粮处理组中瘤胃微生物的相对含量	第29-32页
· 组内共享的属	第32-34页
· Weighted unifrac距离矩阵	第34-35页
· 讨论	第35-39页
· 稀释曲线和阿尔法多样性指数	第35-36页
· 两个处理组中微生物含量的差异	第36-38页
· 两个处理组中对的共享属	第38-39页
· 小结	第39-40页
试验二：品种对山羊瘤胃微生物多样性的影响	第40-52页
· 材料	第40页
· 试验材料	第40页
· 试验动物	第40页
· 试验饲粮	第40页
· 主要仪器和设备	第40页
· 生物信息软件	第40页
· 试剂	第40页
· 方法	第40-41页
· 样品总DNA的提取	第40-41页
· 试验准备	第40-41页
· 样品采集	第41页
· 提取瘤胃微生物总DNA	第41页
· 样品PCR扩增以及Miseq测序	第41页
· 数据分析	第41页
· 结果	第41-48页
· 稀释曲线	第41-42页
· 阿尔法多样性指数	第42-43页
· B组与N组瘤胃微生物在门和属水平上的组成差异	第43-48页
· B组与N组瘤胃微生物在门水平上的组成差异	第43-44页
· B组与N组瘤胃微生物在属水平上的组成差异	第44-46页
· B组与N组共享的属	第46-47页
· Unweighted unifrac距离矩阵	第47-48页
· 讨论	第48-51页
· 稀释曲线和阿尔法多样性指数	第48-49页
· B组与N组之间门和属水平上的差异	第49-50页
· B组与N组之间的共享属	第50-51页
· 小结	第51-52页
第三章结论及创新点	第52-53页
· 结论	第52页
· 创新点	第52页
· 需要进一步研究的问题	第52-53页
参考文献	第53-61页
致谢	第61页

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