双荧光T-RFLP方法的建立及应用—硕士毕业论文下载



双荧光T-RFLP方法的建立及应用

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双荧光T-RFLP方法的建立及应用

论文目录
摘要	第1-6页
ABSTRACT	第6-11页
引言	第11-12页
第1章绪论	第12-25页
· 环境质量的生物评价指标	第13-14页
· 微生物群落多样性研究方法	第14-20页
· 传统研究方法	第15页
· 分子生物学研究方法	第15-20页
· T-RFLP技术	第20-24页
· T-RFLP技术在微生物群落研究中的应用	第20-22页
· 双荧光T-RFLP方法	第22-24页
· 本课题研究的目的和意义	第24-25页
第2章实验材料与方法	第25-44页
· 实验材料	第25-26页
· 底泥样品材料的采集	第25-26页
· 实验药品试剂	第26-28页
· 实验试剂的配制	第26-28页
· 实验工具酶	第28页
· 实验仪器设备	第28-29页
· 实验方法	第29-44页
· 技术路线	第29-30页
· 细菌菌种的筛选	第30页
· 细菌菌种的活化及扩大培养	第30-31页
· 细菌基因组DNA的提取	第31-32页
· PCR反应及产物回收	第32-33页
· 连接与转化	第33-34页
· 细菌质粒的提取	第34页
· 重组质粒的验证	第34-36页
· 质粒配比的混合体系	第36-37页
· 底泥样品宏基因组的提取	第37-38页
· 电泳检测及核酸浓度测定	第38-39页
· 荧光PCR扩增反应	第39-40页
· 限制性内切酶酶切反应	第40页
· 酶切反应产物的脱盐处理	第40-41页
· 毛细管电泳检测	第41-42页
· 数据处理与分析	第42-44页
第3章双荧光标记T-RFLP方法的建立	第44-61页
· 双荧光标记T-RFLP准确性验证实验	第44-49页
· 细菌菌种的筛选	第44-45页
· 细菌基因组DNA的提取	第45页
· PCR扩增反应	第45-46页
· 目的产物回收	第46页
· 提取质粒及测序	第46-47页
· 质粒的三类验证实验	第47-48页
· 质粒测序结果分析	第48-49页
· 质粒浓度测定	第49页
· 双荧光标记T-RFLP灵敏度检验实验	第49-61页
· 不同细菌质粒按体系配比	第49-50页
· 荧光引物PCR反应	第50-51页
· 限制性酶切反应及产物处理	第51页
· 毛细管电泳	第51-52页
· 双荧光T-RFLP图谱分析	第52-61页
第4章大凌河底泥样品的双荧光T-RFLP实验	第61-76页
· 底泥样品实验结果	第61-64页
· 底泥样品宏基因组的提取	第61-62页
· PCR反应	第62-63页
· 毛细管电泳	第63-64页
· 实验结果分析	第64-76页
· 双荧光标记T-RFs种类和数量统计	第64-66页
· T-RFs图谱分析	第66-67页
· RDP数据库比对分析	第67-69页
· 样点间相似度分析	第69-70页
· 样点间菌群多样性分析	第70-73页
· 不同理化参数对细菌多样性影响的主成分分析	第73-76页
第5章结论与展望	第76-78页
· 结论	第76页
· 展望	第76-78页
参考文献	第78-83页
附录测序序列	第83-85页
致谢	第85页

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