内距离及相关方法在分子进化和宏基因组中的应用



内距离及相关方法在分子进化和宏基因组中的应用

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内距离及相关方法在分子进化和宏基因组中的应用

论文目录
摘要	第4-6页
Abstract	第6-10页
第一章引言	第10-21页
1.1 系统发生树的构建	第11-18页
1.1.1 系统发育树的基本概念	第11页
1.1.2 系统发生树的研究概述	第11-18页
1.2 系统发生树的稳健性—自举法	第18-19页
1.3 宏基因组学研究简介	第19页
1.4 本文主要工作	第19-21页
第二章内氨基酸距离及其在系统发生树研究中的应用	第21-41页
2.1 内氨基酸距离的定义及性质	第24-29页
2.1.1 内氨基酸距离序列的定义	第24-25页
2.1.2 距离序列的条件几何分布	第25-26页
2.1.3 相对偏差	第26-27页
2.1.4 两个物种之间的弦距离(Chord distance)	第27-28页
2.1.5 系统发育树的稳健性	第28页
2.1.6 参数K的确定	第28-29页
2.2 计算结果	第29-37页
2.2.1 数据集1的结果	第30-32页
2.2.2 数据集2的结果	第32-37页
2.3 本章结论和讨论	第37-41页
2.3.1 主要结论	第37页
2.3.2 IAGDP方法和Afreixo等人提出的方法的不同之处	第37-38页
2.3.3 进化距离和IAGDP法给出的距离之间的关系	第38-40页
2.3.4 本章主要结论	第40-41页
第三章内距离在宏基因组研究中的应用	第41-55页
3.1 宏基因组研究概况	第41-43页
3.1.1 宏基因组定义及主要研究方法	第41-42页
3.1.2 无比对方法在宏基因组研究中的应用	第42-43页
3.2 基因组中的一种新的信号—内距离在宏基因组研究中的应用	第43-55页
3.2.1 DNA序列的基于内核苷酸距离模型	第43-46页
3.2.2 数据和结果	第46-52页
3.2.3 结果的定量分析	第52-53页
3.2.4 结论	第53-55页
第四章工作总结和展望	第55-58页
参考文献	第58-64页
致谢	第64-65页
附录	第65页

本篇论文共65页，点击这进入下载页面。

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