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表观遗传调控参与肿瘤细胞辐射应答的机制研究

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表观遗传调控参与肿瘤细胞辐射应答的机制研究
论文目录
 
致谢第1-7页
摘要第7-9页
ABSTRACT第9-16页
第一章 绪论第16-41页
  1.1 辐射与辐射生物效应第16-21页
    1.1.1 辐射基本概念第16-17页
    1.1.2 辐射生物学效应第17-21页
  1.2 癌症与放疗第21-23页
  1.3 表观遗传调控第23-34页
    1.3.1 Micro RNA第24-28页
    1.3.2 组蛋白修饰第28-30页
    1.3.3 DNA甲基化第30-34页
  1.4 表观遗传调控与辐射第34-38页
    1.4.1 Micro RNA与辐射第34-36页
    1.4.2 组蛋白修饰与辐射第36-37页
    1.4.3 DNA甲基化与辐射第37-38页
  1.5 三维细胞培养模型第38-40页
  1.6 本文研究目的及拟解决的问题第40-41页
第二章 MiR1423p/Bod1通路调控辐射诱导的染色单体过早分离第41-65页
  2.1 前言第41-42页
  2.2 材料与方法第42-50页
    2.2.1 细胞培养条件第42页
    2.2.2 辐照装置和条件第42-43页
    2.2.3 染色体形态分析第43页
    2.2.4 质粒构建第43页
    2.2.5 细胞转染第43-44页
    2.2.6 双荧光素酶报告检测第44页
    2.2.7 RNA提取第44页
    2.2.8 实时荧光定量PCR第44-47页
    2.2.9 免疫印迹实验(Western Blot)第47-48页
    2.2.10 流式细胞术检测细胞周期第48页
    2.2.11 MTT法检测细胞增殖第48-49页
    2.2.12 克隆形成实验第49页
    2.2.13 微核形成率检测第49-50页
    2.2.14 数据统计分析第50页
  2.3 实验结果第50-62页
    2.3.1 辐射诱导肿瘤细胞染色单体过早分离第50-51页
    2.3.2 MiR1423p与Bod1参与细胞辐射应答第51-52页
    2.3.3 MiR1423p靶向调控Bod1表达第52-53页
    2.3.4 Bod1低表达或miR1423p高表达加剧辐射诱导的染色单体过早分离第53-55页
    2.3.5 Bod1低表达或miR1423p高表达引起细胞G2/M期阻滞第55-56页
    2.3.6 Bod1低表达增加细胞辐射敏感性第56-57页
    2.3.7 MiR1423p高表达增加细胞辐射敏感性第57-58页
    2.3.8 Bod1高表达抑制miR1423p诱导的染色单体过早分离第58-60页
    2.3.9 Bod1高表达抑制辐射诱导的染色单体过早分离并增强细胞辐射抗性第60-62页
    2.3.10 Bod1高表达降低miR1423p细胞辐射增敏效应第62页
  2.4 结论与讨论第62-65页
第三章 组蛋白赖氨酸甲基转移酶SET8参与细胞辐射应答第65-83页
  3.1 前言第65-66页
  3.2 材料与方法第66-69页
    3.2.1 细胞培养条件第66页
    3.2.2 辐照装置和条件第66页
    3.2.3 慢病毒构建稳定突变株第66页
    3.2.4 全基因组表达谱测序第66-67页
    3.2.5 免疫荧光实验第67页
    3.2.6 流式细胞术检测细胞凋亡第67页
    3.2.7 克隆形成实验第67-68页
    3.2.8 MTT法检测细胞增殖第68页
    3.2.9 免疫印迹实验第68页
    3.2.10 RNA提取第68页
    3.2.11 实时荧光定量PCR第68页
    3.2.12 质粒构建与转染第68页
    3.2.13 Pull-down检测实验第68页
    3.2.14 Chip-seq检测实验第68-69页
    3.2.15 数据统计分析第69页
  3.3 实验结果第69-81页
    3.3.1 SET8参与细胞辐射应答第69-70页
    3.3.2 SET8干扰序列确定第70页
    3.3.3 SET8-siRNA慢病毒(lentvirus)载体的构建第70-71页
    3.3.4 SET8低表达阻碍DNA修复并增加细胞辐射敏感性第71-73页
    3.3.5 SET8低表达加剧辐射诱导的细胞凋亡第73-74页
    3.3.6 SET8敲低细胞辐射后的全基因转录组测序检测第74-75页
    3.3.7 SET8异常表达对细胞损伤修复关键基因表达的影响第75-77页
    3.3.8 SET8与RNF8表达存在反馈调节关系第77-79页
    3.3.9 Pull-down实验检测H4K20me1特异性结合蛋白第79-80页
    3.3.10 Chip-seq实验检测H4K20me1特异性结合基因序列第80-81页
  3.4 结论与讨论第81-83页
第四章 RBL1启动子甲基化导致三维(3D)培养细胞辐射抗性第83-116页
  4.1 前言第83-84页
  4.2 材料与方法第84-93页
    4.2.1 细胞培养条件第84页
    4.2.2 免疫荧光实验 (Immunofluorescence)第84-85页
    4.2.3 辐照装置和条件第85页
    4.2.4 3D细胞转换成单细胞悬液第85页
    4.2.5 克隆形成实验第85页
    4.2.6 微核形成率检测第85页
    4.2.7 流式细胞术检测细胞周期第85-86页
    4.2.8 RNA提取第86页
    4.2.9 全基因组DNA的提取第86页
    4.2.10 PCR芯片检测基因表达第86-87页
    4.2.11 细胞全基因组甲基化水平检测第87页
    4.2.12 5-Aza-CdR处理细胞第87-88页
    4.2.13 基因启动子甲基化PCR芯片分析第88-90页
    4.2.14 甲基化特异性PCR(MSP)第90-92页
    4.2.15 琼脂糖凝胶电泳第92页
    4.2.16 实时荧光定量PCR第92页
    4.2.17 免疫印迹实验第92-93页
    4.2.18 质粒构建与转染第93页
    4.2.19 数据统计分析第93页
  4.3 实验结果第93-114页
    4.3.1 3D细胞形态学特征第93-94页
    4.3.2 3D结构细胞表达有人体组织样标志物第94-96页
    4.3.3 3D培养细胞具有辐射抗性第96-97页
    4.3.4 辐射诱导的 3D细胞G2/M期阻滞低于 2D细胞第97-98页
    4.3.5 2D与 3D细胞中周期调控基因差异表达第98-101页
    4.3.6 2D与 3D细胞中RBL1、CCND1、CCNF差异表达明显第101-102页
    4.3.7 2D与 3D细胞全基因组DNA甲基化水平存在差异第102-103页
    4.3.8 2D与 3D细胞中周期调控基因启动子甲基化水平存在差异第103-105页
    4.3.9 辐射或 5-Aza-CdR对 2D与 3D细胞中RBL1的启动子甲基化影响第105-106页
    4.3.10 辐射或 5-Aza-CdR对 2D与 3D细胞中RBL1的表达影响第106-107页
    4.3.11 5-Aza-CdR联合辐射诱导 3D细胞更为严重的G2/M期阻滞第107-108页
    4.3.12 RBL1低表达导致 2D细胞中辐射诱导的G2/M期阻滞程度降低第108-110页
    4.3.13 RBL1低表达增加 2D细胞辐射抗性第110-111页
    4.3.14 RBL1高表达降低 2D细胞辐射抗性第111-112页
    4.3.15 RBL1高表达降低 3D细胞辐射抗性第112-113页
    4.3.16 RBL1低表达增加 3D细胞辐射抗性第113-114页
  4.4 讨论与分析第114-116页
第五章 结论与展望第116-118页
  5.1 结论第116页
  5.2 展望第116-118页
参考文献第118-139页
个人简历第139-140页
在学研究成果第140-142页

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