论文目录 | |
摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-10页 |
第1章 Pdp1 PWWP 结构域的结构和相互作用的研究 | 第10-75页 |
· 背景介绍 | 第10-37页 |
· 真核细胞染色体的结构 | 第10-16页 |
· 组蛋白的共价修饰 | 第16-19页 |
· 组蛋白 H4K20 甲基化 | 第19-20页 |
· 组蛋白 H4K20 甲基转移酶 | 第20-22页 |
· 组蛋白 H4K20 不同甲基化状态的功能 | 第22-24页 |
· 识别组蛋白甲基化修饰的结构域 | 第24-29页 |
· 总结 | 第29-30页 |
参考文献 | 第30-37页 |
· 酵母甲基转移酶 Set9 调控蛋白 Pdp1 的 PWWP 结构域的结构研究 | 第37-75页 |
· Pdp1 的功能介绍 | 第37-42页 |
· 实验材料和实验方法 | 第42-58页 |
· 生物信息学调研 | 第42-43页 |
· 引物设计 | 第43-44页 |
· PCR 体系 | 第44-45页 |
· 胶回收 PCR 片段和限制性内切酶酶切实验 | 第45页 |
· 连接和转化 | 第45-46页 |
· 初步表达测试 | 第46页 |
· 点突变实验 | 第46-47页 |
· Pdp1 PWWP 结构域的表达与纯化 | 第47-48页 |
· 蛋白质浓度测定 | 第48-49页 |
· 多肽合成与纯化 | 第49-50页 |
· 荧光偏振实验 | 第50-51页 |
· NMR 扰动(perturbation)实验 | 第51-52页 |
· NMR 波谱解析三维溶液结构 | 第52-58页 |
· 分子动力学模拟 | 第58页 |
· 实验结果与讨论 | 第58-75页 |
第2章 MOZ tandem PHD 结构域的结构和相互作用的研究 | 第75-129页 |
· 背景介绍 | 第75-103页 |
· 组蛋白的乙酰化 | 第75-76页 |
· 组蛋白乙酰化在转录中的作用 | 第76-79页 |
· 组蛋白乙酰化对染色质结构的直接影响 | 第79-82页 |
· 组蛋白乙酰化是一种分子标签 | 第82-84页 |
· 组蛋白乙酰化是组蛋白密码的一部分 | 第84-85页 |
· 组蛋白的乙酰转移酶 HATs | 第85-91页 |
· 组蛋白乙酰转移酶的分类 | 第86-89页 |
· 组蛋白乙酰转移酶的亚基以及底物的偏好性 | 第89-91页 |
· 组蛋白乙酰转移酶 MOZ 属于 MYST 家族 | 第91-92页 |
· PHD 锌指结构域 | 第92-95页 |
参考文献 | 第95-103页 |
· 人乙酰转移酶 MOZ 的串联 PHD 结构域的结构研究 | 第103-129页 |
· 串联 PHD 结构域的功能介绍 | 第103-105页 |
· 实验材料和实验方法 | 第105-109页 |
· 表达载体 | 第105页 |
· TEV 酶的表达纯化 | 第105-106页 |
· MOZ 串联 PHD 结构域的表达条件 | 第106页 |
· MOZ 串联 PHD 结构域实验的各种 Buffer 配方 | 第106-107页 |
· 多肽合成与纯化 | 第107页 |
· 荧光偏振实验 | 第107-108页 |
· NMR 波谱解析三维溶液结构 | 第108-109页 |
· 实验结果与讨论 | 第109-129页 |
· MOZ 串联 PHD 结构域的序列比对 | 第109-110页 |
· MOZ 串联 PHD 结构域的边界选择 | 第110页 |
· MOZ 串联 PHD 结构域的克隆 | 第110-111页 |
· MOZ 串联 PHD 结构域的表达与纯化 | 第111-115页 |
· MOZ 串联 PHD 结构域的溶液结构 | 第115-118页 |
· MOZ 与 DPF3b 串联 PHD 结构域的结构比较 | 第118-119页 |
· MOZ 与组蛋白 H3 的相互作用研究 | 第119-122页 |
· 点突变实验验证相互作用信息 | 第122-124页 |
· MOZ 串联 PHD 结构域与 H3K14ac 的复合物结构(进行中) | 第124页 |
· 讨论 | 第124-127页 |
· 总结 | 第127-129页 |
附录 1 Pdp1 PWWP 结构域原子化学位移列表 | 第129-170页 |
附录 2 MOZ 串联 PHD 结构域原子化学位移列表 | 第170-194页 |
致谢 | 第194-195页 |
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第195-196页 |