五种螽蟖线粒体基因组的测定与直翅目谱系基因组学分析



五种螽蟖线粒体基因组的测定与直翅目谱系基因组学分析

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五种螽蟖线粒体基因组的测定与直翅目谱系基因组学分析

论文目录
摘要	第1-5 页
Abstract	第5-10 页
第1章前言	第10-43 页
1 六足总纲线粒体基因组全序列测定的研究概况	第10-11 页
· 最早测定的六足总纲线粒体基因组序列	第10 页
· 我国六足总纲线粒体基因组全序列测定研究概况	第10-11 页
2 六足总纲线粒体基因组的主要特征	第11-21 页
· 线粒体基因组的结构特征	第11-12 页
· 线粒体基因组的遗传及进化特征	第12-14 页
· 线粒体基因组各组分的特征	第14-21 页
3 线粒体基因组在进化研究中的应用价值	第21-22 页
4 线粒体基因组全序列测序的方法学	第22-33 页
· DNA测序的方法学	第22-24 页
· 较大DNA片段的测序策略	第24-26 页
· 线粒体基因组全序列测定的策略	第26-29 页
· 线粒体基因组测序片段的拼接	第29-30 页
· 基于生物信息学技术对线粒体基因组进行注释	第30-32 页
· 线粒体基因组全序列的递交	第32-33 页
· 线粒体基因组信息的网络资源	第33 页
5 线粒体比较基因组学	第33 页
6 线粒体谱系基因组学	第33-36 页
· 线粒体谱系基因组学研究方法	第34-35 页
· 线粒体谱系基因组学分析过程	第35 页
· 线粒体谱系基因组学研究概况	第35-36 页
7 直翅目高级阶元分类系统	第36-41 页
· 螽亚目分类系统	第37-39 页
· 蝗亚目分类系统	第39-41 页
8 直翅目分子系统学研究现状	第41 页
9 本项研究的意义	第41-43 页
第2章材料与方法	第43-58 页
1 实验材料	第43-44 页
· 实验标本的采集、保存与鉴定	第43 页
· 实验仪器及试剂	第43-44 页
· 生物信息学软件	第44 页
2 实验方法	第44-58 页
· 线粒体基因组全序列测定	第45-51 页
· 线粒体基因组全序列的生物信息学分析	第51-52 页
· 直翅目线粒体谱系基因组学研究	第52-58 页
第3章线粒体基因组全序列测定	第58-104 页
1 总DNA提取结果	第58 页
2 PCR扩增	第58-59 页
· L-PCR扩增结果	第59 页
· Sub-PCR扩增结果	第59 页
3 Sub-PCR扩增片段测序	第59-60 页
· PCR法直接测序	第59-60 页
· 克隆测序	第60 页
4 疑钩额螽线粒体基因组全序列	第60-71 页
· 线粒体基因组的基本组成特征	第60-63 页
· 蛋白质编码基因	第63-64 页
· tRNA基因	第64-67 页
· rRNA基因	第67-70 页
· A+T丰富区	第70-71 页
5 斑翅草螽线粒体基因组全序列	第71-78 页
· 线粒体基因组的基本组成特征	第71-74 页
· 蛋白质编码基因	第74 页
· tRNA基因	第74 页
· rRNA基因	第74 页
· A+T丰富区	第74-78 页
6 优雅蝈螽线粒体基因组全序列	第78-84 页
· 线粒体基因组的基本组成特征	第78-81 页
· 蛋白质编码基因	第81 页
· tRNA基因	第81 页
· rRNA基因	第81 页
· A+T丰富区	第81-84 页
7 北方棘螽线粒体基因组全序列	第84-90 页
· 线粒体基因组的基本组成特征	第84-87 页
· 蛋白质编码基因	第87 页
· tRNA基因	第87 页
· rRNA基因	第87 页
· A+T丰富区	第87-90 页
8 陈氏掩耳螽线粒体基因组全序列	第90-100 页
· 线粒体基因组的基本组成特征	第90-92 页
· 蛋白质编码基因	第92-93 页
· tRNA基因	第93 页
· rRNA基因	第93 页
· A+T丰富区	第93-100 页
9 讨论	第100-104 页
· 线粒体基因组的基本组成特征	第100 页
· 蛋白质编码基因	第100-102 页
· tRNA基因	第102 页
· rRNA基因	第102 页
· A+T丰富区	第102-104 页
第4章直翅目昆虫的线粒体谱系基因组学研究	第104-118 页
1 数据集序列组成分析	第104-105 页
2 碱基替换饱和性分析	第105-106 页
3 gl检验和PTP检验	第106 页
4 系统发育关系重建	第106-116 页
· 简约法建树	第106-109 页
· 距离法建树	第109-111 页
· 最大似然法建树	第111-113 页
· 贝叶斯系统发育推论	第113-116 页
5 讨论	第116-118 页
结论	第118-120 页
参考文献	第120-134 页
附录Ⅰ 已测定的六足总纲线粒体基因组全序列种类	第134-140 页
附录Ⅱ 六足总纲线粒体基因组全序列测定涉及的L-PCR引物	第140-146 页
附录Ⅲ 本研究所涉及的Sub-PCR引物序列	第146-148 页
攻读博士学位期间科研成果	第148-149 页
致谢	第149 页

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