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RNA差异甲基化与共甲基化模式分析方法研究
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RNA差异甲基化与共甲基化模式分析方法研究
论文目录
 
摘要第1-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第10-22页
　　　　1.1 研究背景及意义第10-13页
　　　　1.2 国内外研究现状第13-18页
　　　　1.3 研究内容第18页
　　　　1.4 章节安排第18-22页
第二章 MeRIP-seq测序技术与数据分析第22-32页
　　　　2.1 引言第22页
　　　　2.2 RNA甲基化测序技术第22-26页
　　　　2.3 MeRIP-seq测序技术第26-27页
　　　　　　　　2.3.1 MeRIP-seq测序文库制备第26-27页
　　　　　　　　2.3.2 MeRIP-seq测序平台数据输出第27页
　　　　2.4 MeRIP-seq测序数据分析第27-30页
　　　　2.5 本章小结第30-32页
第三章 基于多模态卷积神经网络的RNA甲基化位点预测第32-46页
　　　　3.1 引言第32页
　　　　3.2 基于多模态卷积神经网络的RNA甲基化位点预测第32-39页
　　　　　　　　3.2.1 特征表示方法第32-35页
　　　　　　　　3.2.2 Methyl-CNN甲基化位点预测方法第35-39页
　　　　3.3 预测系统检验与评价指标第39-40页
　　　　　　　　3.3.1 预测系统检验方法第39页
　　　　　　　　3.3.2 评价指标第39-40页
　　　　3.4 实验结果与分析第40-44页
　　　　　　　　3.4.1 数据集第40页
　　　　　　　　3.4.2 单源编码特征实验结果与分析第40-42页
　　　　　　　　3.4.3 多模态卷积神经网络实验结果与分析第42-43页
　　　　　　　　3.4.4 卷积神经网络参数选取第43-44页
　　　　3.5 本章小结第44-46页
第四章 小样本下基于读段数的RNA差异甲基化分析第46-62页
　　　　4.1 引言第46页
　　　　4.2 RNA差异甲基化第46-48页
　　　　4.3 DRME差异甲基化分析方法第48-52页
　　　　4.4 实验结果与分析第52-60页
　　　　　　　　4.4.1 模拟数据实验结果第52-55页
　　　　　　　　4.4.2 真实数据实验结果第55-60页
　　　　4.5 本章小结第60-62页
第五章 基于四阶负二项模型的差异甲基化分析第62-76页
　　　　5.1 引言第62页
　　　　5.2 QNB差异甲基化分析方法第62-66页
　　　　5.3 实验结果与分析第66-74页
　　　　　　　　5.3.1 模拟数据实验结果第66-69页
　　　　　　　　5.3.2 真实数据实验结果第69-73页
　　　　　　　　5.3.3 QNB相关影响因素第73-74页
　　　　5.4 QNB软件包第74页
　　　　5.5 本章小结第74-76页
第六章 RNA共甲基化模式分析第76-94页
　　　　6.1 引言第76页
　　　　6.2 RNA甲基化组第76-78页
　　　　6.3 RNA共甲基化模式分析第78-82页
　　　　6.4 实验结果与分析第82-93页
　　　　　　　　6.4.1 数据集第82页
　　　　　　　　6.4.2 单组MeRIP-seq数据的RNA甲基化检测第82-83页
　　　　　　　　6.4.3 整合多组MeRIP-seq数据的RNA甲基化检测结果第83-87页
　　　　　　　　6.4.4 聚类结果分析第87-93页
　　　　6.5 本章小结第93-94页
第七章 总结与展望第94-98页
　　　　7.1 工作总结第94-95页
　　　　7.2 研究展望第95-98页
参考文献第98-110页
发表学术论文和参与科研项目第110-112页
　　　　发表学术论文第110页
　　　　参与科研项目第110-112页
致谢第112-113页

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