拟南芥AtERFs家族DNA结合特性计算分析及其亚家族DREBs调节靶基因的预测
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拟南芥AtERFs家族DNA结合特性计算分析及其亚家族DREBs调节靶基因的预测
论文目录
内容提要
第1-7 页
前言
第7-8 页
第一部分 分子动力学模拟研究AtERFs亚家族间DNA结合特异性
第8-24 页
第一章 绪论
第8-11 页
一、乙烯反应元件结合因子
第8-9 页
二、分子动力学
第9-10 页
三、研究目地和内容
第10-11 页
第二章 材料与方法
第11-13 页
一、实验材料
第11 页
二、计算模拟方法
第11-13 页
第三章 结果与讨论
第13-20 页
一、整体结构特性
第13-15 页
二、蛋白与DNA的相互作用
第15-18 页
三、保守氨基酸在DNA识别中的作用
第18-19 页
四、GCCGCC模体中的关键位点
第19-20 页
第四章 总结
第20-21 页
参考文献
第21-24 页
第二部分 DREBs调节靶基因的预测
第24-74 页
第一章 绪论
第24-37 页
一、基因的表达调控
第25-26 页
二、转录因子调节靶基因的识别
第26-36 页
三、DREBs家族
第36 页
四、研究目地和意义
第36-37 页
第二章 材料和方法
第37-45 页
一、实验材料
第37 页
二、计算方法
第37-45 页
第三章 结果
第45-66 页
一、数据集构建
第45-47 页
二、实验流程设计
第47 页
三、DFSs序列中显著出现的hexamers
第47-50 页
四、SVM分类器参数优化和性能评估
第50-51 页
五、DREBs调节靶基因的预测
第51-62 页
六、靶基因在非生物逆境条件下的表达
第62-64 页
七、基因本体(GO)分析
第64-66 页
第四章 讨论
第66-68 页
第五章 总结
第68-69 页
参考文献
第69-74 页
攻读博士期间发表及待发表文章
第74-75 页
致谢
第75-76 页
中文摘要
第76-79 页
Abstract
第79-81 页
本篇论文共
81
页,
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。
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