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拟南芥AtERFs家族DNA结合特性计算分析及其亚家族DREBs调节靶基因的预测

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拟南芥AtERFs家族DNA结合特性计算分析及其亚家族DREBs调节靶基因的预测
论文目录
 
内容提要第1-7 页
前言第7-8 页
第一部分 分子动力学模拟研究AtERFs亚家族间DNA结合特异性第8-24 页
  第一章 绪论第8-11 页
    一、乙烯反应元件结合因子第8-9 页
    二、分子动力学第9-10 页
    三、研究目地和内容第10-11 页
  第二章 材料与方法第11-13 页
    一、实验材料第11 页
    二、计算模拟方法第11-13 页
  第三章 结果与讨论第13-20 页
    一、整体结构特性第13-15 页
    二、蛋白与DNA的相互作用第15-18 页
    三、保守氨基酸在DNA识别中的作用第18-19 页
    四、GCCGCC模体中的关键位点第19-20 页
  第四章 总结第20-21 页
  参考文献第21-24 页
第二部分 DREBs调节靶基因的预测第24-74 页
  第一章 绪论第24-37 页
    一、基因的表达调控第25-26 页
    二、转录因子调节靶基因的识别第26-36 页
    三、DREBs家族第36 页
    四、研究目地和意义第36-37 页
  第二章 材料和方法第37-45 页
    一、实验材料第37 页
    二、计算方法第37-45 页
  第三章 结果第45-66 页
    一、数据集构建第45-47 页
    二、实验流程设计第47 页
    三、DFSs序列中显著出现的hexamers第47-50 页
    四、SVM分类器参数优化和性能评估第50-51 页
    五、DREBs调节靶基因的预测第51-62 页
    六、靶基因在非生物逆境条件下的表达第62-64 页
    七、基因本体(GO)分析第64-66 页
  第四章 讨论第66-68 页
  第五章 总结第68-69 页
  参考文献第69-74 页
攻读博士期间发表及待发表文章第74-75 页
致谢第75-76 页
中文摘要第76-79 页
Abstract第79-81 页

本篇论文共81页,点击这进入下载页面
 
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