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感染调节线虫寿命和免疫遗传的表观遗传学机制

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感染调节线虫寿命和免疫遗传的表观遗传学机制
论文目录
 
摘要第1-5页
Abstract第5-11页
第一章 前言第11-42页
  1.1 模式生物秀丽隐杆线虫第11-12页
    1.1.1 作为模式生物的优点第11页
    1.1.2 秀丽隐杆线虫的生活史第11-12页
  1.2 亲代环境因素的改变诱导基因调控遗传的分子机制第12-19页
    1.2.1 DNA甲基化第13-14页
    1.2.2 组蛋白修饰第14-15页
    1.2.3 小非编码RNA第15-19页
  1.3 亲代环境因素的改变诱导表观遗传的研究进展第19-40页
    1.3.1 表观遗传在秀丽隐杆线虫中的研究进展第19-27页
      1.3.1.1 外源双链RNA诱导的表观遗传第19-21页
      1.3.1.2 内源双链RNA诱导的表观遗传第21-22页
      1.3.1.3 piRNA诱导的表观遗传第22-24页
      1.3.1.4 组蛋白甲基化和表观遗传调控第24-26页
      1.3.1.5 嗅觉印迹第26-27页
    1.3.2 表观遗传在黑腹果蝇中的研究进展第27-28页
      1.3.2.1 热激诱导的表观遗传第27页
      1.3.2.2 父系饮食诱导的表观遗传第27-28页
    1.3.3 表观遗传在斑马鱼中的研究进展第28-29页
    1.3.4 表观遗传在老鼠中的研究进展第29-39页
      1.3.4.1 遗传操作诱导的表观遗传第29-33页
      1.3.4.2 环境化学剂诱导的表观遗传第33页
      1.3.4.3 父系营养诱导的表观遗传第33-36页
      1.3.4.4 父母亲的慢性压力和惨痛经历诱导的表观遗传第36-38页
      1.3.4.5 气味的条件化恐惧诱导的表观遗传第38-39页
    1.3.5 表观遗传在人类中的研究进展第39-40页
      1.3.5.1 父母亲的营养诱导的表观遗传第39页
      1.3.5.2 表突变诱导的表观遗传第39-40页
    1.3.6 表观遗传在其他哺乳动物中的研究进展第40页
  1.4 本课题的研究目的第40-42页
第二章 实验材料与方法第42-60页
  2.1 实验材料第42-46页
    2.1.1 实验设备第42-43页
    2.1.2 主要材料与试剂第43-46页
      2.1.2.1 实验线虫第43-44页
      2.1.2.2 主要试剂、培养基第44-46页
  2.2 方法第46-60页
    2.2.1 线虫的培养第46页
      2.2.1.1 大肠杆菌E.coliOP50的活化与培养第46页
      2.2.1.2 NGM培养基平板的制备第46页
      2.2.1.3 线虫的培养第46页
    2.2.2 M9溶液的准备(1L的配置)第46页
    2.2.3 线虫同步化实验第46-47页
    2.2.4 线虫RNAi实验第47页
    2.2.5 线虫的突变株实验第47页
    2.2.6 线虫的侵染实验第47-48页
      2.2.6.1 FUDR板的制备第47页
      2.2.6.2 病原微生物铜绿假单胞菌PA14的活化第47-48页
      2.2.6.3 线虫侵染板的制备第48页
      2.2.6.4 线虫侵染第48页
    2.2.7 实时荧光定量PCR实验第48-50页
      2.2.7.1 线虫的RNA的提取第48页
      2.2.7.2 RT-PCR第48-49页
      2.2.7.3 线虫基因组的提取第49-50页
    2.2.8 set-2::set-2::gfp的构建第50-52页
      2.2.8.1 大肠杆菌感受态细胞的制备第50-51页
      2.2.8.2 质粒的提取第51-52页
      2.2.8.3 set-2启动子和基因的扩增与片段回收第52页
      2.2.8.4 set-2过表达的构建第52页
    2.2.9 蛋白免疫应迹(Westernblotting)第52-54页
      2.2.9.1 线虫蛋白的提取第52-53页
      2.2.9.2 蛋白含量测定第53-54页
      2.2.9.3 样品处理(提取后蛋白处理)第54页
      2.2.9.4 电泳分离第54页
      2.2.9.5 转膜第54页
      2.2.9.6 封闭第54页
      2.2.9.7 一抗孵育第54页
      2.2.9.8 二抗孵育第54页
      2.2.9.9 底物孵育和检测第54页
    2.2.10 线虫的保存第54-55页
    2.2.11 荧光显微镜对线虫GFP的分析实验第55页
    2.2.12 透射电子显微镜法第55-56页
    2.2.13 线虫的免疫荧光实验第56-57页
      2.2.13.1 线虫生殖腺的解剖与分离第56页
      2.2.13.2 线虫生殖腺的固定第56-57页
      2.2.13.3 线虫的DAPI染色第57页
      2.2.13.4 线虫生殖腺的抗体免疫着色第57页
    2.2.14 线虫杂交实验第57页
    2.2.15 线虫的RNA测序和小RNA测序第57-59页
      2.2.15.1 mRNA的提取、文库的构建和测序第57-58页
      2.2.15.2 小RNA的提取、文库的构建和测序第58-59页
    2.2.16 统计学分析第59-60页
第三章 实验结果第60-84页
  3.1 感染刺激诱导线虫寿命缩短和免疫增加第60-62页
  3.2 感染所引起的表型改变的遗传依赖于母系和父系刺激第62-63页
  3.3 组蛋白三甲基化复合体H3K4me3调节感染所引起的表型变化的继代遗传第63-69页
  3.4 组蛋白三甲基化复合体H3K4me3调节线虫的天然免疫第69-70页
  3.5 组蛋白三甲基化复合体H3K4me3作用于生殖腺来调节感染所引起的表型变化的继代遗传第70-76页
  3.6 小RNA作用于组蛋白三甲基化复合体H3K4me3的下游来调节感染所引起的表型变化的继代遗传第76-82页
  3.7 CSR-1控制的22GsiRNAs调节感染所引起的表型变化的继代遗传第82-84页
第四章 讨论第84-89页
参考文献第89-110页
科研成果第110-111页
致谢第111-112页
附录第112-422页

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