论文目录 | |
| 中文摘要 | 第12-14
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| 英文摘要 | 第14-17
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| 第一章 文献综述 | 第17-74
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| 第一节 植原体与植原体病害 | 第17-24
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| · 植原体的发现 | 第17
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| · 柔膜菌纲原核生物的分类 | 第17-18
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| · 分子进化研究与植原体的归属及概念 | 第18-20
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| · 植原体的基本形态和超微结构 | 第20-22
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| · 植原体的生理特征 | 第22
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| · 植原体的传播和移动 | 第22-23
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| · 植原体病害症状特点及为害 | 第23-24
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| 第二节 植原体的检测与鉴定研究 | 第24-39
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| · 显微研究技术 | 第24-28
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| · 光学显微技术（Light Microscopy） | 第24-25
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| · 荧光显微技术（Fluorescence Microscopy） | 第25-26
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| · 透射电镜显微技术（Transmission electron microscopy, TEM） | 第26-28
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| · 扫描电镜技术（Scanning electron microscopy） | 第28
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| · 细胞化学技术（Cytochemical methods） | 第28
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| · 血清学检测技术 | 第28-29
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| · DNA分子杂交技术 | 第29-31
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| · 点印迹杂交分析法 | 第29-30
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| · 原位杂交 | 第30
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| · Southern杂交／RFLP | 第30-31
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| · PCR技术 | 第31-39
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| · 巢式PCR（Nested-PCR） | 第31-32
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| · 免疫捕获PCR（Immuno-capture-PCR, IC-PCR） | 第32-33
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| · 循环PCR（Recycled PCR） | 第33
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| · 原位PCR（In situ PCR） | 第33
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| · 竞争PCR（Competitive PCR） | 第33-34
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| · 实时荧光定量PCR（Real-time fluorescence quantitative PCR, RTF-PCR） | 第34-39
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| 第三节 植原体的分子生物多样性研究 | 第39-66
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| · 植原体的遗传多样性研究 | 第39-47
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| · 遗传多样性的起源 | 第39-41
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| · 遗传多样性的重要性 | 第41-42
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| · 遗传多样性的研究方法 | 第42-47
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| · 植原体的物种多样性研究 | 第47-64
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| · 微生物系统发育多样性的特点 | 第48-49
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| · 用于植原体系统发育研究的分子标记 | 第49-55
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| · 植原体的分类 | 第55-59
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| · 植原体的命名 | 第59-64
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| · 植原体的生态多样性 | 第64-66
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| · 植原体的地理分布 | 第64
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| · 植原体的寄主特异性 | 第64
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| · 介体-植原体-寄主的相互关系 | 第64-66
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| 第四节 植原体的基因组研究 | 第66-72
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| · 植原体基因组主要特性 | 第66-70
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| · 植原体基因组大小 | 第66-67
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| · 植原体染色体和质粒的主要特征 | 第67-70
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| · 植原体的膜蛋白（membrane proteins） | 第70-71
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| · 植原体的代谢 | 第71-72
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| · 植原体的毒性 | 第72
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| 第五节 本研究的目的和总体思路 | 第72-74
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| · 研究目的和意义 | 第72-73
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| · 研究的总体思路 | 第73-74
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| 第二章 实验部分 | 第74-125
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| 第一节 云南省植原体病害的种类鉴定 | 第74-87
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| · 材料与方法 | 第74-77
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| · 植原体病害的采集 | 第74
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| · 植原体病害的分子鉴定 | 第74-77
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| · 结果与分析 | 第77-86
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| · 巢式PCR扩增结果 | 第77
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| · 植原体病害症状表现 | 第77-86
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| · 小结 | 第86-87
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| 第二节 云南省植原体株系系统发育多样性研究 | 第87-94
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| · 材料与方法 | 第87-90
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| · 材料来源 | 第87
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| · 感病植株总DNA的提取和植原体165 rRNA基因PCR扩增 | 第87
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| · PCR产物的克隆和序列测定 | 第87-89
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| · 16S rRNA序列系统演化分析 | 第89-90
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| · 结果与分析 | 第90-94
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| · 重组质粒的筛选 | 第90
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| · 云南省植原体株系1651DNA的序列分析 | 第90
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| · 云南省植原体株系系统进化树构建及分析 | 第90-94
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| · 小结 | 第94
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| 第三节 仙人掌丛枝病植原体的遗传多样性研究 | 第94-103
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| · 材料与方法 | 第94-97
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| · 材料来源 | 第94-95
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| · 感病植株总DNA提取 | 第95-96
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| · PCR扩增植原体165 rRNA基因片段 | 第96
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| · 巢式PCR扩增产物序列测定和比对 | 第96
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| · 计算机模拟1651DNA限制性酶切 | 第96-97
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| · 遗传相似系数计算 | 第97
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| · 构建遗传系统树状图谱 | 第97
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| · 结果与分析 | 第97-103
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| · RFLP电子酶切图谱 | 第97-100
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| · 任意两个仙人掌丛枝植原体株系间的遗传相似系数 | 第100-102
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| · 29 个仙人掌丛枝植原体株系的系统聚类树状图谱 | 第102
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| · 仙人掌丛枝植原体26 号株系的序列分析 | 第102-103
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| · 小结 | 第103
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| 第四节 植原体实时荧光定量PCR方法的建立及其应用 | 第103-117
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| · 材料与方法 | 第104-106
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| · 材料来源和选取 | 第104
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| · 感病组织总DNA提取 | 第104
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| · 感病植原体株系165 rDNA的PCR扩增、产物克隆及序列测定 | 第104
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| · TaqMan探针与引物的设计和合成 | 第104-105
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| · 定量PCR标准品和标准曲线的制作 | 第105
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| · 实时荧光定量PCR检测及各反应条件的优化 | 第105
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| · 实时荧光定量PCR检测植原体的反应体系的建立及应用 | 第105-106
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| · 结果与分析 | 第106-116
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| · 用于定量PCR的植原体病害的感病组织 | 第106
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| · 感病组织不同部位总DNA浓度及用做标准品质粒的浓度 | 第106-107
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| · 实时荧光定量PCR各反应条件的优化 | 第107-112
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| · 植原体16SrII 组探针的特异性检测 | 第112-113
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| · 感病植株中的植原体含量 | 第113-116
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| · 小结 | 第116-117
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| 第五节 植原体病原形态电镜观察 | 第117-125
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| · 材料与方法 | 第117-118
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| · 材料来源 | 第117
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| · 植物组织超薄切片制备 | 第117-118
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| · 电镜观察 | 第118
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| · 结果与分析 | 第118-123
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| · 植原体的形态 | 第118-121
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| · 植原体的发育 | 第121-122
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| · 植原体的移动 | 第122-123
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| · 小结 | 第123-125
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| 第三章 讨论 | 第125-134
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| 第一节 云南省植原体病害种类的多样性 | 第125-126
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| · 云南省首次报道的植原体病害的多样性 | 第125
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| · 国内外首次报道的植原体病害 | 第125-126
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| 第二节 云南省植原体株系种类的多样性 | 第126-129
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| · 云南省植原体株系的分布特点 | 第126
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| · 泡桐丛枝病植原体株系的分类地位 | 第126-127
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| · 长春花黄化植株植原体株系的复合侵染 | 第127
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| · 我国报道的竹丛枝植原体株系的分类 | 第127
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| · 引起桃树植原体病害的植原体株系 | 第127-128
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| · 侵染苜蓿的植原体株系 | 第128
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| · 不同症状表现的矮牵牛、百合植原体病害 | 第128-129
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| · 国外报道的发生在柑橘属植物上的植原体病害 | 第129
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| 第三节 云南省仙人掌丛枝病植原体株系的遗传多样性 | 第129-130
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| · 仙人掌丛枝植原体26 号株系的系统分类和来源 | 第129-130
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| · 云南省仙人掌丛枝病植原体株系的遗传变异 | 第130
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| 第四节 实时荧光定量PCR技术检测定量感病组织中的植原体 | 第130-133
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| · 技术应用的优点及本研究的特点 | 第130-131
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| · 感病组织中植原体的分布与细胞数量比较 | 第131-133
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| 第五节 植原体感病组织的电镜观察 | 第133-134
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| · 电镜观察植原体的局限性 | 第133
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| · 植原体的形态与分类 | 第133-134
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| 全文结论与创新点 | 第134-135
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| 参考文献 | 第135-150
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| 附录1 论文中使用的缩写词及中英文对照 | 第150-153
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| 附录2 100 余号疑似植原体病害的症状表现及采集地 | 第153-156
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| 附录3 29 个仙人掌丛枝植原体株系在GenBank中的登录号 | 第156-157
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| 附录4 实验中常用试剂的配制 | 第157-160
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| 致谢 | 第160-161
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| 攻读博士学位论文期间发表的学术论文目录及获得的奖励 | 第161
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