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真核生物AU-rich元件结合蛋白HuR和GAPDH3的结构功能研究

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真核生物AU-rich元件结合蛋白HuR和GAPDH3的结构功能研究
论文目录
 
摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
目录第9-12页
第一篇 mRNA稳定性调节蛋白HuR的结构和功能研究第12-74页
  第1章 绪论第12-28页
    · 哺乳动物mRNA稳定性调节的研究进展第12-14页
    · mRNA监控途径第14-17页
      · NMD降解途径第14-16页
      · NSD降解途径第16-17页
      · NGD降解途径第17页
    · 参与mRNA降解的顺式作用元件和反式作用因子第17-21页
      · AU-rich元件以及结合蛋白第18-20页
      · GU-rich元件以及结合蛋白第20页
      · CU-rich元件及分化调控元件第20-21页
      · CA-rich元件及其结合蛋白第21页
    · ARE结合蛋白HuR的结构及功能研究第21-28页
      · HuR的结构特征第21-23页
      · HuR与mRNA的稳定性第23-24页
      · HuR的翻译后修饰对其结合RNA的影响第24-26页
      · HuR与肿瘤第26-28页
  第2章 HuR识别ARE的分子机制研究第28-58页
    · HuR蛋白的结构生物学研究现状第28-29页
    · 实验材料和方法第29-35页
      · HuR蛋白的基因克隆及表达质粒的构建第29-32页
      · HuR RRM1/2蛋白的表达及纯化第32-33页
      · 晶体生长及衍射数据收集第33页
      · 模型搭建及晶体结构修正第33-34页
      · HuR RRM1/2蛋白的生化性质及其结合RNA能力的鉴定第34-35页
    · 实验结果第35-52页
      · HuR RRM1/2蛋白的纯化第36页
      · HuR RRM1/2晶体的获得第36-38页
      · HuR RRM1/2的结构解析第38-40页
      · HuR RRM1/2的总体结构第40-42页
      · HuR RRM1/2结合poly(U)能力的检测及关键残基的鉴定第42-44页
      · HuR RRM1/2-RNA复合物的结构解析第44-47页
      · HuR RRM1/2-RNA的总体结构第47-48页
      · 底物RNA的识别及其选择特异性第48-50页
      · HuR RRM1/2与底物RNA之间结合能力测定第50-52页
    · 结果讨论第52-58页
      · 与Hu蛋白家族其他成员的RRM1/2的结构比对第52-53页
      · 构象变化显著提高了HuR RRM1/2对底物RNA的亲和力第53-58页
  本篇小结第58-59页
  参考文献第59-74页
第二篇 酿酒酵母GAPDH3的结构与功能研究第74-115页
  第1章 绪论第74-89页
    · 糖酵解过程概述第74-76页
      · 糖酵解过程第74-76页
      · 甘油醛-3-磷酸脱氢酶的作用机制第76页
    · 甘油醛-3-磷酸脱氢酶的其他功能第76-81页
      · GAPDH结合核酸第77-79页
      · GAPDH与端粒第79页
      · GAPDH是一个转录因子第79页
      · GAPDH与其他蛋白的相互作用第79页
      · GAPDH把葡萄糖的利用和生长信号联系起来第79-80页
      · GAPDH与凋亡第80-81页
      · GAPDH作为一个促生存因子第81页
    · GAPDH功能的调节第81-86页
      · 磷酸化对于GAPDH的影响第81-82页
      · GAPDH定位的调节第82-86页
    · GAPDH具有多重功能的重要性第86-87页
    · GAPDH的医学意义以及未来前景第87-89页
  第2章 酿酒酵母GAPDH3的结构生物学研究第89-106页
    · 酿酒酵母甘油醛-3-磷酸脱氢酶的结构生物学研究现状第89-91页
    · 实验材料和方法第91-97页
      · GAPDH3蛋白的基因克隆及表达质粒的构建第91-93页
      · GAPDH3蛋白的表达及纯化第93-94页
      · GAPDH3的晶体生长及衍射数据收集第94-95页
      · 模型搭建及晶体结构修正第95页
      · GAPDH3蛋白的生化性质及其结合RNA能力的鉴定第95-97页
    · 实验结果与讨论第97-106页
      · GAPDH3蛋白的纯化第97页
      · GAPDH3的晶体学研究第97-100页
      · GAPDH3的总体结构第100-101页
      · GAPDH3蛋白聚集状态分析第101-102页
      · NAD~+结合引起构象变化第102-103页
      · GAPDH3酶活测定第103-104页
      · GAPDH3结合RNA能力的测定第104-105页
      · GAPDH3结合RNA的结构模型第105-106页
  本篇小结第106-107页
  参考文献第107-115页
致谢第115-117页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第117 页

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