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食源性单核细胞增生李斯特菌遗传多样性分析和群体感应研究

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食源性单核细胞增生李斯特菌遗传多样性分析和群体感应研究
论文目录
 
摘要第1-7页
ABSTRACT第7-10页
缩略词表第10-17页
第一章 绪论第17-39页
  1.1 单增李斯特菌的生物学特性第17-18页
  1.2 单增李斯特菌检测方法进展第18-21页
    1.2.1 定性检测方法第18-21页
    1.2.2 定量检测方法第21页
  1.3 单增李斯特菌分型技术研究第21-28页
    1.3.1 传统表型分型第21-22页
    1.3.2 分子分型第22-28页
  1.4 单增李斯特菌毒力因子与致病机理第28-31页
    1.4.1 单增李斯特菌毒力因子第28-30页
    1.4.2 致病机理第30-31页
  1.5 群体感应与食品安全第31-35页
    1.5.1 agr 群体感应系统第32页
    1.5.2 AI-2 群体感应系统第32-33页
    1.5.3 agr 群体感应与生物膜形成的关系第33-34页
    1.5.4 AI-2 群体感应与生物膜形成的关系第34-35页
    1.5.5 群体感应与单增李斯特菌基因转录调节第35页
  1.6 未来的发展方向第35-36页
  1.7 本论文的目的意义与研究内容第36-39页
    1.7.1 目的意义第36-37页
    1.7.2 研究内容第37-38页
    1.7.3 本研究技术路线第38-39页
第二章 华南四省即食食品中单增李斯特菌风险识别与遗传多样性分析第39-53页
  2.1 实验材料第39-40页
    2.1.1 实验材料第39-40页
    2.1.2 实验仪器第40页
  2.2 实验方法第40-44页
    2.2.1 样品采集第40页
    2.2.2 样品定性与定量分析第40-42页
    2.2.3 谱系型分析第42页
    2.2.4 毒力基因 PCR 扩增第42页
    2.2.5 抗生素敏感性分析第42-43页
    2.2.6 RAPD 分型第43页
    2.2.7 ERIC-PCR 分型第43-44页
  2.3 结果第44-50页
    2.3.1 不同食品类型污染率第44-46页
    2.3.2 谱系型分型第46页
    2.3.3 抗生素抗性分析第46页
    2.3.4 ERIC-PCR 分型第46-48页
    2.3.5 RAPD 分型第48-49页
    2.3.6 毒力基因分析第49-50页
  2.4 讨论第50-52页
  2.5 本章小结第52-53页
第三章 华南四省生鲜食品中单增李斯特菌风险识别与遗传多样性分析第53-73页
  3.1 实验材料第54页
    3.1.1 实验试剂第54页
    3.1.2 实验仪器第54页
  3.2 实验方法第54-57页
    3.2.1 样品采集第54-55页
    3.2.2 定性分析第55页
    3.2.3 定量分析第55-56页
    3.2.4 谱系型分析第56页
    3.2.5 ERIC-PCR 分型第56页
    3.2.6 菌株库构建第56页
    3.2.7 RAPD 分型第56-57页
    3.2.8 遗传多样性分析第57页
    3.2.9 毒力基因 PCR 扩增第57页
    3.2.10 抗生素敏感性分析第57页
  3.3 结果第57-68页
    3.3.1 不同食品类型污染率第57-58页
    3.3.2 不同食品类型污染水平第58-59页
    3.3.3 谱系型分型第59页
    3.3.4 ERIC-PCR 分型第59-60页
    3.3.5 RAPD 分型第60-65页
    3.3.6 毒力基因存在情况第65页
    3.3.7 抗生素抗性分析第65-68页
  3.4 讨论第68-71页
  3.5 本章小结第71-73页
第四章 金针菇生产过程中单增李斯特菌污染溯源研究第73-87页
  4.1 实验材料第73-74页
    4.1.1 实验材料第73-74页
    4.1.2 主要仪器第74页
  4.2 实验方法第74-76页
    4.2.1 采样和菌株分离鉴定第74-75页
    4.2.2 谱系型分析第75页
    4.2.3 遗传多样性分析第75页
    4.2.4 结晶紫染色法测定菌膜形成能力第75-76页
    4.2.5 电子扫描显微镜观察生物膜形成第76页
  4.3 结果第76-84页
    4.3.1 李斯特菌污染情况第76页
    4.3.2 谱系型分析第76-78页
    4.3.3 ERIC-PCR 分析第78页
    4.3.4 RAPD 分型第78-79页
    4.3.5 分型方法比较第79-83页
    4.3.6 菌膜形成能力第83-84页
  4.4 讨论第84-85页
  4.5 本章小结第85-87页
第五章 单增李斯特菌 798-1WT 全基因组测序分析第87-93页
  5.1 实验材料第87页
  5.2 实验方法第87-89页
    5.2.1 基因组 DNA 提取第87-88页
    5.2.2 基因组文库构建、测序与组装第88页
    5.2.3 基因 ORF 预测与注释第88页
    5.2.4 单增李斯特菌的比较基因组学第88-89页
  5.3 实验结果第89-91页
    5.3.1 单增李斯特菌 798-1WT 基因组组装及其基本特征第89页
    5.3.2 比较基因组学第89-91页
  5.4 讨论第91-92页
  5.5 本章小结第92-93页
第六章 单增李斯特菌群体感应与生物膜形成关系研究第93-111页
  6.1 实验材料第94-95页
    6.1.1 实验材料第94页
    6.1.2 实验试剂配制第94页
    6.1.3 实验材料和实验设备第94-95页
  6.2 实验方法第95-101页
    6.2.1 引物设计与 PCR 扩增第95页
    6.2.2 CaCl2法制备大肠杆菌感受态细胞第95-96页
    6.2.3 单核细胞增生李斯特菌感受态细胞的制备第96页
    6.2.4 同源重组载体和回复载体构建与筛选第96-98页
    6.2.5 同源重组突变株筛选与鉴定第98-100页
    6.2.6 生长曲线测定第100页
    6.2.7 菌株表型特征观察第100页
    6.2.8 生物膜形成能力测定第100页
    6.2.9 不同菌株抗氧胁迫能力的测定第100-101页
  6.3 结果第101-109页
    6.3.1 ΔluxS、ΔagrD 基因同源重组载体构建与突变株筛选第101-103页
    6.3.2 luxS、agrD 基因同源回复载体构建与回复株筛选株筛选第103-104页
    6.3.3 ΔluxSΔagrD 双基因缺失株筛选第104-105页
    6.3.4 生长曲线测定第105-106页
    6.3.5 菌株表型特征第106-107页
    6.3.6 野生株和突变株在生物膜形成能力的差异第107-108页
    6.3.7 缺失株对抗 H2O2胁迫能力测定第108-109页
  6.4 讨论第109-110页
  6.5 本章小结第110-111页
结论与展望第111-115页
参考文献第115-135页
附录第135-165页
攻读博士学位取得的研究成果第165-167页
致谢第167-168页
附件第168页

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