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湖南省旱稻孢囊线虫rDNA-ITS序列特征及基于ISSR的遗传多样性分析

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湖南省旱稻孢囊线虫rDNA-ITS序列特征及基于ISSR的遗传多样性分析
论文目录
 
摘要第4-6页
Abstract第6-12页
第一章 绪论第12-18页
1 旱稻孢囊线虫病概况第12页
2 病原鉴定第12-14页
  2.1 形态学鉴定第13页
  2.2 常用的分子鉴定方法第13-14页
    2.2.1 核糖体r DNA-ITS鉴定第13页
    2.2.2 核糖体28S鉴定第13-14页
3 遗传多样性研究的常用标记方法第14-16页
  3.1 RFLP第14页
  3.2 RAPD第14-15页
  3.3 AFLP第15页
  3.4 ISSR第15-16页
4 研究的目的和意义第16-18页
第二章 湖南省旱稻孢囊线虫ITS及28S分子特征第18-32页
1 材料与方法第18-24页
  1.1 材料第18-19页
    1.1.1 线虫材料第18-19页
    1.1.2 试剂与试剂盒第19页
    1.1.3 主要培养基和试剂的配制第19页
  1.2 方法第19-24页
    1.2.1 旱稻孢囊线虫的分离第19页
    1.2.2 旱稻孢囊线虫单孢囊DNA的提取第19-20页
    1.2.3 rDNA-ITS-PCR的扩增与检测第20-21页
    1.2.4 28S rDNA D2/D3-PCR的扩增与检测第21-22页
    1.2.5 PCR产物回收与纯化第22页
    1.2.6 质粒的连接第22-24页
      1.2.6.1 连接载体的转化第22-23页
      1.2.6.2 阳性克隆的筛选第23页
      1.2.6.3 序列测定与分析第23页
      1.2.6.4 序列测定与分析第23-24页
2 结果与分析第24-29页
  2.1 ITS分子特征分析结果第24-26页
    2.1.1 湖南省12个地区旱稻孢囊线虫ITS分子特征分析第24-26页
      2.1.1.1 ITS-PCR扩增及检测第24页
      2.1.1.2 rDNA-ITS序列分析第24-25页
      2.1.1.3 rDNA-ITS序列分析第25-26页
  2.2 28S rDNA D2/D3区的分子特征分析结果第26-29页
    2.2.1 湖南省12个地区旱稻孢囊线虫28S rDNA D2/D3分子特征分析第26-29页
      2.2.1.1 28S rDNA D2/D3-PCR扩增及检测第26-27页
      2.2.1.2 28S rDNA D2/D3序列测定与比对第27-28页
      2.2.1.3 28S rDNA D2/D3序列系统进化分析第28-29页
3 结论和讨论第29-32页
  3.1 rDNA-ITS区序列分析第29-30页
  3.2 28S rDNA D2/D3区序列分析第30-32页
第三章 湖南省旱稻孢囊线虫的ISSR分析第32-41页
1 材料与方法第32-36页
  1.1 材料第32-34页
    1.1.1 线虫材料第32页
    1.1.2 引物材料第32-34页
    1.1.3 仪器第34页
    1.1.4 试剂与试剂盒第34页
  1.2 方法第34-36页
    1.2.1 多孢囊总DNA的提取第34页
    1.2.2 ISSR引物的筛选第34页
    1.2.3 退火温度第34页
    1.2.4 ISSR-PCR扩增及体系正交试验第34-36页
    1.2.5 数据处理与分析方法第36页
2 结果与分析第36-40页
  2.1 ISSR引物筛选第36-37页
  2.2 ISSR-PCR反应体系条件优化第37-38页
  2.3 ISSR引物最适退火温度筛选第38页
  2.4 旱稻孢囊线虫ISSR多态性分析第38-39页
  2.5 旱稻孢囊线虫的遗传多样性分析第39-40页
3 结论与讨论第40-41页
  3.1 ISSR-PCR反应体系的优化第40页
  3.2 退火温度第40页
  3.3 ISSR遗传多样性第40-41页
第四章 全文结论第41-43页
参考文献第43-49页
致谢第49-50页
作者简介第50页

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