含假结的RNA二级结构预测算法研究



含假结的RNA二级结构预测算法研究

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含假结的RNA二级结构预测算法研究

论文目录
摘要	第1-5页
abstract	第5-13页
第一章绪论	第13-29页
1.1 研究背景	第13-14页
1.2 研究现状	第14-27页
1.3 本文主要工作	第27页
1.4 论文组织结构	第27-29页
第二章并行计算与生物学基础	第29-50页
2.1 并行计算	第29-30页
2.2 异构计算	第30-39页
2.2.1 OpenCL支持的不同架构	第31-33页
2.2.2 OpenCL平台模型	第33-34页
2.2.3 OpenCL执行模型	第34-35页
2.2.4 OpenCL内存模型	第35-36页
2.2.5 OpenCL编程模型	第36-38页
2.2.6 OpenCL 2.0 与HSA架构	第38-39页
2.3 RNA生物学背景	第39-43页
2.3.1 RNA分子结构	第39-40页
2.3.2 RNA的分类与功能	第40-43页
2.4 RNA序列结构	第43-49页
2.4.1 序列结构分级	第43-45页
2.4.2 RNA二级结构	第45-47页
2.4.3 假结结构	第47-49页
2.5 本章小结	第49-50页
第三章基于遗传算法的带假结RNA二级结构预测	第50-73页
3.1 遗传算法介绍	第50-54页
3.1.1 改进的遗传操作	第50-51页
3.1.2 遗传算法相关定义	第51-54页
3.2 初始化处理	第54-56页
3.2.1 构建茎区池	第54-55页
3.2.2 初始化种群	第55-56页
3.3 适应度函数设计	第56-60页
3.4 包含假结的结构树构建算法	第60-63页
3.5 算法总流程	第63-65页
3.6 测试结果与分析	第65-71页
3.6.1 测试环境与测试数据	第65-67页
3.6.2 结果对比与分析	第67-71页
3.7 本章小结	第71-73页
第四章基于OpenCL的并行预测算法	第73-82页
4.1 预测算法并行性分析	第73页
4.2 并行填充螺旋区点阵	第73-75页
4.3 种群并行迭代进化	第75-78页
4.4 并行预测算法总流程	第78-79页
4.5 测试结果与实验分析	第79-81页
4.6 本章小结	第81-82页
第五章总结与展望	第82-84页
5.1 总结	第82页
5.2 展望	第82-84页
参考文献	第84-88页
致谢	第88-89页
在学期间的研究成果及发表的学术论文	第89页

本篇论文共89页，点击这进入下载页面。

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