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绿肥—烟草轮作对土壤细菌多样性和烟草青枯病发生的影响研究

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绿肥—烟草轮作对土壤细菌多样性和烟草青枯病发生的影响研究
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 绪论第11-20页
  1 研究背景第11-13页
    · 绿肥应用研究概述第11-12页
    · 烟草主要土传病害与其生物防治的重要性第12-13页
  2 国内外研究进展第13-17页
    · 土壤微生物多样性研究现状第13-15页
      · 自然因素第14页
      · 人为因素第14-15页
    · 土壤微生物多样性研究方法的发展第15-16页
    · Miseq高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的应用第16-17页
  3 研究意义和内容第17-19页
    · 研究意义第17-18页
    · 研究内容第18-19页
  4 技术路线第19-20页
第二章 绿肥-烟草轮作对烟田土壤性质的影响第20-26页
  1 材料与仪器第20-21页
    · 试验材料第20-21页
      · 土壤样品第20页
      · 试验试剂第20页
      · 试验仪器第20-21页
  2 试验方法第21-23页
    · 土壤样品的采集和青枯病发病率调查第21页
    · 土壤样品理化性质的测定第21-22页
      · 供试土壤含水量的测定第21页
      · 供试土壤pH值的测定第21页
      · 供试土壤的全元素分析第21页
      · 土壤样品总N含量的测定第21-22页
      · 土壤样品总C含量的测定第22页
    · 数据分析第22-23页
  3 结果与分析第23-24页
    · 绿肥-烟草轮作对烟田土壤理化性质的影响第23-24页
      · 绿肥-烟草轮作对烟田土壤PH和含水量的影响第23页
      · 绿肥-烟草轮作对土壤元素含量的影响第23页
      · 绿肥-烟草轮作对土壤总碳和总氮的影响第23-24页
  4 讨论第24-26页
第三章 土壤样品的16S rRNA高通量测序第26-35页
  1 材料与仪器第26页
    · 试验材料第26页
      · 土壤样品第26页
      · 试验试剂第26页
    · 试验仪器第26页
  2 试验方法第26-30页
    · DNA提取液的配制第26-27页
    · 土壤微生物总DNA提取和纯化第27-28页
    · 土壤总DNA的16S rRNA扩增第28-29页
      · 土壤总DNA的检测和定量第28页
      · 土壤总DNA 16S rRNA的PCR扩增第28页
      · PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测第28-29页
    · Illumina Miseq高通量测序第29-30页
      · PCR产物定量和混样第29页
      · 琼脂糖凝胶DNA回收第29-30页
      · 细菌总DNA文库构建和上机测序第30页
      · 测序有效序列筛选及优化第30页
  3 结果分析第30-34页
    · 样品DNA检测第30-31页
    · PCR扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测第31-32页
    · PCR扩增产物的酶标仪检测第32-33页
    · Miseq高通量测序结果第33-34页
  4 讨论第34-35页
第四章 绿肥-烟草轮作下土壤细菌多样性、土壤性质和烟草青枯病发病率的联系第35-49页
  1 材料与仪器第35页
  2 试验方法第35-37页
    · 分类学分析第35页
    · OTU聚类统计第35页
    · 稀释曲线构建第35-36页
    · 群落结构和组成差异分析第36页
      · 群落结构差异分析第36页
      · 群落组成差异分析第36页
    · Alpha多样性分析第36页
    · mantel test相关性分析第36-37页
    · 皮尔森系数相关性分析第37页
    · PLSPM相关性分析第37页
  3 结果分析第37-46页
    · OTU聚类和稀释曲线第37-38页
    · 绿肥-烟草轮作对烟田土壤细菌群落结构的影响第38-40页
      · 烟田土壤细菌群落结构的统计分析第38-39页
      · 烟田土壤细菌群落结构的不相似性分析第39页
      · 烟田土壤细菌群落结构的去趋势对应分析第39-40页
    · 绿肥-烟草轮作对烟田土壤细菌群落组成的影响第40-42页
      · 绿肥-烟草轮作烟田土壤细菌群落组成在门和属水平上的差异第40-42页
    · 绿肥-烟草轮作对土壤细菌多样性的影响第42页
    · 土壤性质和烟田土壤细菌之间的Mantel test相关性分析第42-43页
    · 土壤性质、烟草发病率和烟田土壤细菌之间的皮尔森相关性分析第43-45页
    · 土壤性质、烟草发病率和烟田土壤菌群之间的PLSPM分析第45-46页
  4 讨论第46-49页
第五章 结论与展望第49-51页
  1 结论第49页
  2 展望第49-51页
参考文献第51-58页
致谢第58-59页
作者简介第59页

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