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中国南方9个黄牛群体mtDNA D-loop区遗传多样性和起源进化研究

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中国南方9个黄牛群体mtDNA D-loop区遗传多样性和起源进化研究
论文目录
 
摘要第1-7 页
ABSTRACT第7-11 页
前言第11-13 页
第一部分 文献综述第13-31 页
  第一章 分子进化概述第13-27 页
    · 物种系统进化研究的分子标记第13-16 页
      · 微卫星和小卫星第13-14 页
      · Y 染色体微卫星第14 页
      · 线粒体DNA第14 页
      · 单拷贝核基因(scnDNA)第14-15 页
      · SINEs 插入序列第15 页
      · 卫星DNA第15-16 页
    · 母系进化标记-mtDNA第16-22 页
      · 线粒体起源的研究第16 页
      · mtDNA 的序列特征第16-18 页
      · mtDNA D-loop 的序列特点第18-19 页
      · mtDNA 的进化特征第19-20 页
      · mtDNA 的进化速率特征以及它们的应用第20 页
      · mtDNA 的遗传特征第20-21 页
      · mtDNA 作为分子标记使用时的注意事项第21-22 页
    · 分子系统发生分析的原理和方法第22-24 页
      · 分子系统发生分析第22 页
      · 分子钟机理第22 页
      · 分子系统发生与系统发生树第22-23 页
      · 系统发生树的可靠性第23-24 页
    · mtDNA D-loop 在系统发生研究中的应用进展第24-27 页
  第二章 中国黄牛的起源进化和研究进展第27-31 页
    · 家牛的起源进化第27-28 页
    · 中国黄牛起源进化研究进展第28-31 页
第二部分 试验研究第31-63 页
  第三章 九个黄牛群体mtDNA 多态性及其母系进化研究第31-43 页
    · 材料与方法第31-33 页
      · 试验材料第31 页
      · 实验方法第31-33 页
      · 序列分析第33 页
    · 结果与分析第33-40 页
      · mtDNA D-loop 区全序列的PCR 扩增第33 页
      · 南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 区全序列的核苷酸组成第33-34 页
      · 南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 区的核苷酸变异和多态性分析第34-36 页
      · 南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型多态性第36-37 页
      · 南方9 个黄牛群体间的遗传距离第37 页
      · 南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型的系统进化分析第37-38 页
      · 南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型的变异和多态性分析第38-40 页
      · 南方9 个黄牛群体基于遗传距离的群体聚类第40 页
    · 讨论第40-43 页
      · 中国南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 的核苷酸变异第40-41 页
      · 中国南方9 个黄牛群体的群体内遗传多样性差异第41-42 页
      · 中国南方9 个黄牛群体起源关系第42-43 页
  第四章 26 个中国南方黄牛群体mtDNA D-loop 区核苷酸及单倍型多态性第43-49 页
    · 材料与方法第43-44 页
      · 试验材料第43 页
      · 序列分析第43-44 页
    · 结果与分析第44-46 页
      · 南方26 个黄牛群体mtDNA D-loop 区全序列的核苷酸组成第44 页
      · 南方26 个黄牛群体mtDNA D-loop 区核苷酸变异和多态性分析第44-45 页
      · 南方26 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型多态性第45-46 页
      · 南方26 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型多样度和系统进化分析第46 页
    · 讨论第46-49 页
      · 南方26 个黄牛群体的遗传多样性第46-47 页
      · 南方26 个黄牛群体的单倍型多样性第47 页
      · 南方26 个黄牛群体的遗传组成第47-49 页
  第五章 26 个中国南方黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型组多样性及其母系进化研究第49-61 页
    · 材料与方法第50 页
      · 试验材料第50 页
      · 序列分析第50 页
    · 结果与分析第50-56 页
      · 普通牛mtDNA D-loop 区单倍型分析第50-51 页
      · 瘤牛mtDNA D-loop 区单倍型分析第51-54 页
      · 中国南方地区26 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型汇总第54-55 页
      · 中国南方地区26 个黄牛群体的聚类关系第55-56 页
    · 讨论第56-61 页
      · 中国南方地区黄牛的母系血统来源第56-57 页
      · 中国南方黄牛区域性母系遗传组成特征第57 页
      · 单倍型i1 和其它单倍型之间的关系第57-58 页
      · 地理和遗传信息之间的关系第58-60 页
      · 潜在的瘤牛驯化中心第60-61 页
  第六章 结论第61-63 页
参考文献第63-71 页
致谢第71-73 页
作者简介第73 页

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