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大豆疫霉菌和寄生疫霉菌中小RNA的初步鉴定和分析

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大豆疫霉菌和寄生疫霉菌中小RNA的初步鉴定和分析
论文目录
 
摘要第1-6页
ABSTRACT第6-9页
第一章 文献综述第9-19页
  · 寄生疫霉菌和大豆疫霉菌第9页
    · 寄生疫霉菌第9页
    · 大豆疫霉菌第9页
  · 小RNA 研究概述第9-18页
    · miRNA第11-16页
    · siRNA第16-17页
    · piRNA第17-18页
  · 本研究的目的和意义第18-19页
第二章 大豆疫霉菌,寄生疫霉菌小RNA 文库的构建及分析第19-25页
  · 实验材料与试剂第19页
    · 实验材料第19页
    · 试剂第19页
  · 寄生疫霉菌和大豆疫霉菌各个时期材料的收集第19-21页
    · 寄生疫霉菌各个时期材料的收集第19-20页
    · 大豆疫霉菌各个时期材料的收集第20页
    · 寄生疫霉菌侵染拟南芥叶片组织的制备第20-21页
  · 各种组织RNA 的提取第21页
  · 寄生疫霉菌和大豆疫霉菌小RNA 的测序第21页
  · 结果与分析第21-24页
    · 总RNA 的提取第21页
    · 寄生疫霉菌和大豆疫霉菌小RNA 的分布分析第21-23页
    · 高质量序列的分类第23页
    · 疫霉菌中microRNA 的预测第23-24页
  · 讨论第24-25页
第三章 小RNA 的实验克隆第25-38页
  · 实验材料与试剂第25-26页
    · 实验材料第25页
    · 试剂第25页
    · 接头及引物第25-26页
  · 实验方法第26-30页
    · 低分子量RNA 的分离第26页
    · Small RNA 的分离第26-27页
    · Small RNA 的去磷酸化第27页
    · 3’接头的连接第27-28页
    · 加接头的小RNA 的5’磷酸化及与5’接头的连接第28页
    · Small RNA 连接产物的反转录第28-29页
    · 反转录产物PCR第29页
    · PCR 产物加A第29-30页
    · PCR 产物与pGXT 载体连接第30页
    · 电击转化第30页
  · AppDNA adaptor 的合成第30-31页
    · ImpA(adenosine-5’-phosphoimidazolide)的合成第30-31页
    · 3’adaptor 的腺苷酰化修饰第31页
  · 结果与分析第31-36页
    · 总RNA 提取及低分子量RNA 的分离第31-32页
    · Small RNA 的分离第32-33页
    · Small RNA 加3’接头后的分离第33-34页
    · Small RNA 加5’接头后的分离第34页
    · 反转录产物PCR 后检测第34-35页
    · 测序结果第35-36页
  · 讨论第36-38页
第四章 大豆疫霉菌和寄生疫霉菌中候选小 RNA 的验证第38-45页
  · 实验材料及试剂第38页
    · 实验材料第38页
    · 试剂第38页
  · 实验方法第38-39页
    · 总RNA 的电泳及转膜第38-39页
    · Northern blot第39页
  · 结果与分析第39-43页
    · tRNA 来源的小RNA第39-42页
    · rRNA 来源及其他来源的小RNA第42-43页
  · 讨论第43-45页
第五章 结论与创新点第45-46页
  · 结论第45页
  · 创新点第45-46页
参考文献第46-54页
致谢第54-55页
作者简介第55 页

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