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环渤海湾苹果产区再植障碍园与丰产园土壤细菌遗传多样性分析
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环渤海湾苹果产区再植障碍园与丰产园土壤细菌遗传多样性分析
论文目录
 
中文摘要第10-11页
英文摘要第11-13页
1 前言第13-29页
　　· 再植障碍研究概述第13-16页
　　　　· 再植障碍的危害第13-14页
　　　　· 再植障碍的研究现状第14-16页
　　　　　　· 再植障碍的特征第14页
　　　　　　· 再植障碍的发生机理研究现状第14-16页
　　　　· 再植障碍的应对措施第16页
　　· 细菌群落分析方法第16-22页
　　　　· 环境基因组16S rDNA 的PCR 扩增第17-19页
　　　　· T-RFLP第19-20页
　　　　· DGGE第20-21页
　　　　· 连载体测序第21-22页
　　· 生物群落多样性的测度第22-25页
　　　　· α多样性的测度第22-24页
　　　　　　· 物种丰富度第22-23页
　　　　　　· 物种相对多度模型第23页
　　　　　　· 物种多样性指数第23页
　　　　　　· 物种均匀度指数第23-24页
　　　　· β多样性的测度第24-25页
　　　　　　· 二元属性数据测度法第24页
　　　　　　· 数量数据测度法第24-25页
　　· 生物群落梯度分析第25-27页
　　　　· 直接梯度分析第26页
　　　　· 间接梯度分析第26页
　　　　· 约束直接梯度分析第26-27页
　　　　　　· 典型变量分析第26-27页
　　　　　　· 典型相关分析第27页
　　　　　　· 冗余分析第27页
　　　　　　· 典型对应分析第27页
　　· 本研究的立项依据、研究内容与技术路线第27-29页
　　　　· 立项依据第27-28页
　　　　· 研究内容第28页
　　　　· 技术路线第28-29页
2 材料与方法第29-41页
　　· 材料第29-31页
　　　　· 样品的采集第29页
　　　　· 仪器设备第29页
　　　　· 生化试剂第29页
　　　　· 主要溶液的配制第29-31页
　　　　　　· LB 培养基第29页
　　　　　　· PDA 培养基第29-30页
　　　　　　· 根皮苷培养基第30页
　　　　　　· 鉴定培养基第30页
　　　　　　· 氨苄青霉素（Amp）溶液第30-31页
　　　　　　· X-Gal 贮液第31页
　　　　　　· IPTG 贮液第31页
　　　　· 样品理化指标测定第31页
　　　　· PCR 引物第31页
　　　　· 病原菌株第31页
　　· 方法第31-41页
　　　　· 样品总DNA 的提取及PCR 扩增第31-33页
　　　　　　· 样品总DNA 的提取第31-32页
　　　　　　· PCR 扩增第32页
　　　　　　· PCR 扩增的反应条件第32页
　　　　　　· PCR 扩增产物的纯化第32-33页
　　　　· T-RFLP 分析第33页
　　　　　　· 荧光PCR 产物的限制性酶切第33页
　　　　　　· 酶切产物的基因扫描第33页
　　　　· DGGE第33-36页
　　　　　　· PCR 产物的定量第33页
　　　　　　· DGGE第33-34页
　　　　　　· 连载体测序第34-36页
　　　　· 数据分析第36-37页
　　　　　　· 细菌群落多样性分析第36页
　　　　　　· 去趋势对应分析（DCA）第36-37页
　　　　　　· 典型对应分析（CCA）第37页
　　　　· 苹果常见土传病害拮抗菌的筛选第37-38页
　　　　　　· 含有拮抗菌的土壤样品的筛选第37页
　　　　　　· 苹果常见土传病害拮抗菌的筛选第37-38页
　　　　· 根皮苷降解菌的筛选第38-39页
　　　　　　· 以根皮苷为碳源的微生物的富集第38页
　　　　　　· 以根皮苷为碳源的微生物的分离及纯化第38页
　　　　　　· 分光光度法筛选根皮苷高效降解菌第38页
　　　　　　· 盆栽试验第38-39页
　　　　　　· 165 rDNA 序列的测定第39页
　　　　· 菌种生理生化鉴定第39-41页
　　　　　　· 接触酶第39页
　　　　　　· 淀粉水解第39页
　　　　　　· V－P 测定第39页
　　　　　　· 吲哚第39页
　　　　　　· 甲基红第39-40页
　　　　　　· 葡萄糖发酵第40页
　　　　　　· 乳糖发酵第40页
　　　　　　· 蔗糖发酵第40页
　　　　　　· 麦芽糖发酵第40页
　　　　　　· 脂酶第40-41页
3 结果与分析第41-55页
　　· 果园土壤理化指标分析第41-42页
　　　　· 青县果园土壤理化指标分析第41页
　　　　· 昌邑果园土壤理化指标分析第41-42页
　　　　· 瓦房店果园土壤理化指标分析第42页
　　· T-RFLP 分析第42-48页
　　　　· T-RFLP 图谱的分析第42-45页
　　　　· 多样性指数分析第45页
　　　　· T-RFLP 图谱中主要片段的定性分析第45-46页
　　　　· 基于T-RFLP 的主成分分析第46-47页
　　　　· 环渤海苹果产区果园土壤的细菌群落结构与环境因子之间的关系第47-48页
　　· DGGE 结果分析第48-50页
　　　　· 青县样品DGGE 图谱与结果分析第48页
　　　　· 昌邑样品DGGE 图谱与结果分析第48-49页
　　　　· 瓦房店样品DGGE 图谱与结果分析第49-50页
　　· 苹果常见土传病害的拮抗菌的筛选第50-51页
　　　　· 拮抗菌X 的抗菌效果照片第50-51页
　　　　· 拮抗菌X 的16S rDNA 序列分析第51页
　　· 根皮苷降解菌的筛选第51-55页
　　　　· 以根皮苷为碳源的微生物的筛选第51-52页
　　　　· 根皮苷光谱第52-53页
　　　　· 360nm 波长下根皮苷标准吸光曲线的制备第53页
　　　　· 根皮苷降解菌的初步筛选第53-54页
　　　　· 根皮苷降解菌pd6-3 的盆栽试验第54页
　　　　　　· 砧木株高第54页
　　　　　　· 根系扫描第54页
　　　　· 16S rDNA 的测定第54-55页
4 讨论第55-57页
　　· 种植方式不同的两类果园土壤中细菌群落结构的差异性第55页
　　· 环渤海湾苹果产区果园土壤中的细菌群落构成第55-56页
　　· 环渤海湾苹果产区果园土壤中主要菌群与环境因子的相关性研究第56页
　　· 拮抗菌与降解菌的筛选第56-57页
5 结论第57-58页
　　· 分子生物学方法的比较第57页
　　· 环渤海湾苹果产区果园土壤细菌群落构成第57页
　　· 细菌群落结构变化的相关性研究第57页
　　· 拮抗菌与降解菌的筛选第57-58页
参考文献第58-66页
致谢第66 页

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