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禾谷镰刀菌组蛋白乙酰转移酶基因功能研究

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禾谷镰刀菌组蛋白乙酰转移酶基因功能研究
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第11-16页
    1.1 小麦赤霉病及禾谷镰刀菌第11-12页
        1.1.1 小麦赤霉病的分布第11页
        1.1.2 小麦赤霉病发病特点及侵染模式第11-12页
        1.1.3 小麦赤霉病危害性第12页
    1.2 小麦赤霉病毒素的危害第12页
    1.3 小麦赤霉病毒素DON的合成第12-13页
    1.4 小麦赤霉病DON合成的调控第13-14页
    1.5 丝状真菌中组蛋白调控第14-15页
    1.6 组蛋白调控与次生代谢的关系第15-16页
第二章 材料与方法第16-29页
    2.1 基因敲除第16-23页
        2.1.1 供试菌株及载体第16页
        2.1.2 主要培养基及配方第16-19页
        2.1.4 实验方法第19-23页
    2.2 突变体表型分析第23-25页
        2.2.1 供试菌株第23页
        2.2.2 试剂盒及培养基配方第23-24页
        2.2.3 实验方法第24-25页
    2.3 磷酸化位点突变载体及互补载体构建第25-27页
        2.3.1 PKA磷酸化位点的预测第25页
        2.3.2 点突变载体及互补载体引物设计第25页
        2.3.3 载体构建第25-27页
    2.4 RNA-seq分析第27-29页
        2.4.1 收集菌丝样品并送样第27页
        2.4.2 RNA-seq数据处理第27-29页
第三章 禾谷镰刀菌组蛋白乙酰化转移酶的敲除及表型分析第29-40页
    3.1 禾谷镰刀菌乙酰转移酶基因的敲除第29-30页
        3.1.1 .禾谷镰刀菌中组蛋白乙酰化转移酶基因HATs的鉴定第29页
        3.1.2 .基因敲除转化子验证第29-30页
    3.2 禾谷镰刀菌乙酰转移酶基因突变体菌株表型鉴定结果第30-37页
        3.2.1 sas3,gcn5,elp3,rtt109 缺失突变体菌株生长速率下降第30-31页
        3.2.2 gcn5 突变体不产孢,sas3和rtt109 突变体孢子形态异常第31-33页
        3.2.3 sas3和gcn5 突变体丧失有性生殖过程第33-34页
        3.2.4 sas3、elp3 突变体仅能在接种点发病,rtt109 突变体致病力下降第34-36页
        3.2.5 sas3,gcn5 突变体几乎不产毒,hat1,elp3 突变体产毒下降第36-37页
    3.3 sas3 突变体功能回复验证和亚细胞定位第37-38页
    3.4 讨论第38-40页
第四章 PKA和 Sas3 对次生代谢途径的调控第40-54页
    4.1 外源cAMP增加禾谷镰刀菌DON的产量第40-41页
    4.2 cAMP处理可以刺激产毒相关的细胞分化第41-42页
    4.3 cAMP可以恢复hat1,elp3 突变体菌株产毒,cAMP不能恢复 gcn5,sas3 突变体菌株产毒第42页
    4.4 WT、sas3、PKA突变体的RNA-seq数据分析第42-53页
        4.4.1 RNA-seq返回数据重复性分析结果第42-43页
        4.4.2 转录差异基因第43-44页
        4.4.3 sas3,pka突变体转录差异基因功能注释及富集第44-47页
        4.4.4 sas3,pka突变体相关转录差异基因分析及功能富集第47-52页
        4.4.5 Tri基因的表达分析第52页
        4.4.6 PKA 和 Sas3 共同调控 H3K14 乙酰化修饰水平第52-53页
    4.5 讨论第53-54页
第五章 Sas3是cAMP信号途径的下游第54-57页
    5.1 禾谷镰刀菌Sas3 含有两个个潜在的PKA磷酸化位点第54页
    5.2 点突变菌株的功能鉴定第54-56页
        5.2.1 SAS3-SA点突变及互补菌株的获得第54页
        5.2.2 SAS3-SA点突变菌株生长表型部分恢复,产毒未得到恢复第54-56页
    5.3 讨论第56-57页
第六章 Sas3和Gcn5、Rtt109、Elp3 存在功能的重叠第57-61页
    6.1 双敲突变体菌株均获得第57页
    6.2 sas3rtt109,sas3 gcn5,sas3elp3,sas3sas2 双敲突变体生长速率降低第57-58页
    6.3 sas3 gcn5 双敲突变体不产孢,双敲突变体产孢率均下降第58-59页
    6.4 双敲突变体均不致病第59-60页
    6.5 讨论第60-61页
第七章 全文总结及展望第61-62页
参考文献第62-67页
附录第67-97页
致谢第97-99页
作者简介第99页

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